Author | Lamarão, Flávia Rachel M. | |
Author | Reis, Estéfane C. | |
Author | Simão, Tatiana A. | |
Author | Albano, Rodolpho M. | |
Author | Lôbo-Hajdu, Gisele | |
Access date | 2018-04-24T17:19:01Z | |
Available date | 2018-04-24T17:19:01Z | |
Document date | 2010 | |
Citation | LAMARÃO, Flávia Rachel M. et al. Aplysina (Porifera: Demospongiae) species identification through SSCP-ITS patterns. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, v.90, n.4, p.845-850, 2010.. | pt_BR |
ISSN | 1469-7769 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/26071 | |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | Marine Biological Association of the United Kingdom | pt_BR |
Rights | restricted access | pt_BR |
Subject in Portuguese | Reação em Cadeia da Polimerase | pt_BR |
Subject in Portuguese | Polimorfismo Conformacional de Fita Simples | pt_BR |
Subject in Portuguese | esponjas marinhas | pt_BR |
Subject in Portuguese | espécies crípticas | pt_BR |
Title | Aplysina (Porifera: Demospongiae) species identification through SSCP-ITS patterns | pt_BR |
Type | Article | pt_BR |
DOI | 10.1017/S0025315409991202 | |
Abstract | Keratose sponges have no spicules and limited robust morphological characters, causing severe problems for taxonomic classification. Single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis of PCR amplified internal transcribed spacers (ITS) of nuclear ribosomal RNA (rRNA) genes was used to elucidate speciation patterns in marine sponges of the genus Aplysina. In
this study, Aplysina species with non-ambiguous traditional morphological alpha taxonomy were used to generate standard
SSCP-ITS patterns, which were compared with patterns from alleged new species. Our results show that ITS-SSCP patterns
allowed the differentiation of Aplysina sponges, demonstrating the advantage of a method that explores the secondary structure
compared to direct sequencing. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Hanseníase. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Bioquímica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Bioquímica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Bioquímica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Subject | marine sponges | pt_BR |
Subject | internal transcribed spacers | pt_BR |
Subject | PCR-SSCP | pt_BR |
Subject | cryptic species | pt_BR |
Embargo date | 2030-01-01 | |