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THE CIRCULATION OF HUMAN ASTROVIRUS GENOTYPES IN THE CENTRAL WEST REGION OF BRAZIL
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Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil / Robert Koch-Institute. Berlin, Germany.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Faculdade de Medicina. Departamento de Pediatria. Goiânia, GO, Brasil.
Instituto de Saúde do Distrito Federal. Brasília, DF, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Microbiologia. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal do Mato Grosso do Sul. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Campo Grande, MS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Robert Koch-Institute. Berlin, Germany.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Faculdade de Medicina. Departamento de Pediatria. Goiânia, GO, Brasil.
Instituto de Saúde do Distrito Federal. Brasília, DF, Brasil.
Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Microbiologia. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal do Mato Grosso do Sul. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Campo Grande, MS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Robert Koch-Institute. Berlin, Germany.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil
Abstract
Out of 1,588 faecal samples of children taken from three locations of the Central West Region of Brazil, 57 were positive for astroviruses (HAstVs) using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). They were geno-
typed by nested RT-PCR and/or genomic sequencing. HAstV-1 (42.8%), HAstV-2 (23.2%), HAstV-3 (3.6%), HAstV-4 (14.3%) and HAstVs -5, -6, -7 and -8 (1.8% each) were detected. In Goiânia and Campo Grande, HAstV-1 was the most frequently detected genotype while in Brasília (DF) it was HAstV-2. Shifts in the circulation of astrovirus genotypes were observed in DF and Campo Grande. All samples collected by rectal swabs were viral negative. The astrovirus genotypes were detected in all age groups and there was no correlation between genotype and age group.
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