Use este identificador para citar ou linkar para este item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/32139
Tipo de documento
ArtigoDireito Autoral
Acesso aberto
Coleções
- IOC - Artigos de Periódicos [12514]
Metadata
Mostrar registro completo
REREP: COMPUTATIONAL DETECTION OF REPETITIVE SEQUENCES IN GENOME SURVEY SEQUENCES (GSS)
Autor(es)
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Fundação Ataulpho de Paiva. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.
Resumo em Inglês
Genome survey sequences (GSS) offer a preliminary global view of a genome since, unlike ESTs, they cover coding as well as non-coding DNA and include repetitive regions of the genome. A more precise estimation of the nature, quantity and variability of repetitive sequences very early in a genome sequencing project is of considerable importance, as such data strongly influence the estimation of genome coverage, library quality and progress in scaffold construction. Also, the elimination of repetitive sequences from the initial assembly process is important to avoid errors and unnecessary complexity. Repetitive sequences are also of interest in a variety of other studies, for instance as molecular markers.
Compartilhar