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MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS COMPLEX DETECTION IN HUMAN REMAINS: TUBERCULOSIS SPREAD SINCE THE 17TH CENTURY IN RIO DE JANEIRO, BRAZIL
Ancient DNA
Human mtDNA
Mycobacterium tuberculosis complex
Brazil
Produção científica do Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos.
Autor(es)
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia de Tripanossomatídeos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Instituto de Arqueologia Brasileira. Belford Roxo, RJ, Brasil.
Instituto de Arqueologia Brasileira. Belford Roxo, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia de Tripanossomatídeos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Instituto de Arqueologia Brasileira. Belford Roxo, RJ, Brasil.
Instituto de Arqueologia Brasileira. Belford Roxo, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumo em Inglês
Paleogenetic analysis for tuberculosis (TB) was conducted on bone and sediment samples dating from the 17th to 19th centuries from the archeological site of Nossa Senhora do Carmo Church in Rio de Janeiro, Brazil. Forty samples were analyzed, corresponding to 32 individuals from 28 burials, 22 of primary type and 6 of secondary type. The samples were collected following strict paleogenetic investigation guidelines and submitted to ancient DNA (aDNA) extraction. In order to detect TB infection, aDNA hybridizations with the molecular targets of Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) IS6110 and IS1081 were applied. Additionally, the ancestry of individuals was assessed by human mitochondrial DNA (mtDNA) analysis of hypervariable segment I (HVS-I) sequence polymorphisms. The results of aDNA hybridizations demonstrated varying levels of MTC intensity in 17/32 individuals (53.1%), using the IS6110 target. The IS1081 MTC target showed lower sensitivity, confirming TB positivity in 10/32 (31.2%) individuals. The mtDNA analysis allowed the recovery of HVS-I sequences in 23/32 individuals (71.8%). The majority of these individuals (21/23, 91.3%) were of European ancestry, especially in primary burials. Haplogroups U, J, V, T, K, N, H and R, were identified with haplogroup U being the most frequent at 6/23 (26.1%). African and Amerindian mtDNA haplogroups were observed in two individuals in secondary burials. In spite of the ecclesiastic and aristocratic bias of the population of the study, human ancestry analysis revealed the prominent contribution of Europeans in the introduction or spread of TB in the New World.
Palavras-chave em inglês
TuberculosisAncient DNA
Human mtDNA
Mycobacterium tuberculosis complex
Brazil
Editor
Elsevier
Referência
JAEGER, Laura Hubert et al. Mycobacterium tuberculosis complex detection in human remains: tuberculosis spread since the 17th century in Rio de Janeiro, Brazil. Infection, Genetics and Evolution, v. 12, n. 4, p. 642-648, June 2012.DOI
10.1016/j.meegid.2011.08.021ISSN
1567-1348Notas
Produção científica do Laboratório de Biologia de Tripanossomatídeos.Produção científica do Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos.
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