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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/37639
Tipo de documento
ArtigoDireito Autoral
Acesso aberto
Coleções
- IOC - Artigos de Periódicos [12514]
Metadata
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SQUID - A SIMPLE BIOINFORMATICS GRID
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
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Resumo em Inglês
BLAST is a widely used genetic research tool for analysis of similarity between nucleotide and protein sequences. This paper presents a software application entitled "Squid" that makes use of grid technology. The current version, as an example, is configured for BLAST applications, but adaptation for other computing intensive repetitive tasks can be easily accomplished in the open source version. This enables the allocation of remote resources to perform distributed computing, making large BLAST queries viable without the need of high-end computers.
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