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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/39640
Tipo de documento
ArtigoDireito Autoral
Acesso restrito
Data de embargo
2025-01-01
Coleções
- IOC - Artigos de Periódicos [12490]
Metadata
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IN HOUSE REVERSE LINE HYBRIDIZATION ASSAY FOR RAPID DETECTION OF SUSCEPTIBILITY TO RIFAMPICIN IN ISOLATES OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS
Rifampicin resistance
Detection
Reverse hybridization assay
Brazil
Autor(es)
Afiliação
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Centro de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico. Instituto de Pesquisas Biológicas. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Hospital Universitário Clementino Fraga Filho. Instituto de Doenças do Tórax. Programa Acadêmico de Tuberculose Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Centro de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico. Instituto de Pesquisas Biológicas. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Centro de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico. Instituto de Pesquisas Biológicas. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Hospital Universitário Clementino Fraga Filho. Instituto de Doenças do Tórax. Programa Acadêmico de Tuberculose Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Centro de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico. Instituto de Pesquisas Biológicas. Porto Alegre, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumo em Inglês
We developed a Reverse Hybridization Assay (RHA) slightly modified from the Rifoligotyping assay and analyzed the presence
of mutations in a specific region of rpoB gene in 157 isolates (90 rifampin-resistant and 67 rifampin sensitive) of Mycobacterium
tuberculosis from patients attended in South and Southeast region of Brazil. Comparing to standardized drug susceptibility testing
results, the sensitivity and specificity of the RHA was respectively 93% (95% IC: 86.6%–97.2%) and 100% respectively.
Additionally, a high agreement (kappa coefficient 95%) between the RHA assay and sequencing was obtained. Among the 90
rifampicin-resistant isolates, RHA identified point mutations in the following codons: 42 isolates (46.6%) in 531; 29 isolates
(32.2%) in 526, 6 isolates (6.7%) in 516, 3 isolates (3.3%) in 522, 2 isolates (2.2%) in 515, 514, 513 and 1 isolate (1.1%) in 511,
524 and 525. Mutations in different codons were simultaneously identified in 8 isolates (8.9%). The RHA used in the present study
had a high accuracy and can be rapidly performed. However, more reproducible hybridization conditions should be looked for to
increase reliability of mutant probe interpretation.
Palavras-chave em inglês
TuberculosisRifampicin resistance
Detection
Reverse hybridization assay
Brazil
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