Advisor | Alcantara, Luiz Carlos Júnior | |
Author | Rego, Filipe Ferreira de Almeida | |
Access date | 2012-07-19T17:10:40Z | |
Available date | 2012-07-19T17:10:40Z | |
Document date | 2010 | |
Citation | REGO, Filipe Ferreira de Almeida. Mutações na região LTR do HTLV e sua implicação na presença do vírus na saliva e origem na Bahia. 2010. 90 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz, Salvador, 2010. | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4205 | |
Abstract in Portuguese | O HTLV-1 é o agente etiológico da ATL, HAM/TSP e outras perturbações inflamatórias. Alguns
estudos tentam analisar as variações do HTLV-1 em diferentes fluidos corpóreos e seu impacto
sobre a infecção pelo HTLV. A coinfecção HTLV/HIV-1 é associada com graves manifestações
clínicas, imunodeficiência marcante e infecções oportunistas, bem como comportamento de risco.
Salvador, capital do Estado da Bahia, Brasil, tem a maior prevalência para o HTLV-1 (1,74%)
encontrada no país. Poucos estudos descrevem esta coinfecção em Salvador e áreas vizinhas, e
muito menos investigam como estes vírus circulam ou avaliam a relação entre eles. Para descrever a
epidemiologia molecular do HTLV-1 e as características da coinfecção HTLV/HIV-1 em mulheres,
nós realizamos um corte transversal envolvendo 107 mulheres infectadas com HIV-1 do centro de
referência da DST/HIV/AIDS, localizado na cidade de Feira de Santana. Amostras das pacientes
foram testadas por ELISA e a infecção pelo HTLV confirmada usando o WB e PCR. A análise
filogenética foi realizada nas seqüências LTR do HTLV para obter mais informações sobre a
epidemiologia molecular e a origem deste vírus na Bahia. Quatro das cinco amostras reativas no
ELISA foram confirmadas como HTLV-1 no WB e PCR e uma amostra confirmada como HTLV-
2. A soroprevalência da infecção pelo HTLV nestas mulheres foi de 4,7%, menor que o esperado,
provavelmente pela baixa prevalência da infecção pelo HTLV esta área ou devido a medidas de
controle de DST/AIDS implementadas desde a realização do estudo anterior. A análise filogenética
da região LTR das quatro seqüências do HTLV-1 revelou que todos os isolados foram classificados
como subgrupo Transcontinental do subtipo Cosmopolita e se agrupam no principal grupo latinoamericano,
que possui um ancestral comum com isolados da África do Sul, sugerindo uma
introdução pós Colombiana deste vírus na Bahia. A seqüência de HTLV-2 foi classificada como
subtipo c, a variante brasileira do subtipo 2a. Também foi observado que quatro mulheres
coinfectadas HTLV/HIV-1 apresentavam comportamento de risco, sendo duas por exposição
parenteral, enquanto que duas eram profissionais do sexo, demonstrando que esta coinfecção é mais
freqüente em grupos de risco. Para determinar a carga proviral em PBMC e células do lavado bucal
um PCR em tempo real foi realizado e para analisar variações da região tax-LTR do HTLV-1 em
indivíduos infectados uma nested-PCR da região tax-LTR do HTLV-1 em PBMC e células do
lavado bucal, seguida por clonagem molecular, seqüenciamento de DNA e a análise computacional
foram realizadas. A diferença entre as medianas da carga proviral foi significativa, comparando os
indivíduos com provírus detectado em células lavado bucal (n = 8) e os 18 indivíduos sem provírus
detectado em células lavado bucal (101278.5 vs 23290.0 cópias por 106 PBMC, p = 0.0245). A
análise filogenética, comparando clones de lavado bucal e PBMC, não mostrou nenhum perfil
clonal entre os indivíduos com carga proviral detectada em células do lavado bucal e também não
mostrou significância estatística no teste de Hudson. A diversidade genética, entre os clones de
PBMC e lavado bucal variou de 0,003 a 0,008. O perfil de sítios de modificação pós-traducional no
fragmento de tax analisado foi equivalente entre os grupos analisados. Todas as seqüências
analisadas foram classificadas como subgrupo transcontinental do subtipo Cosmopolita. | pt_BR |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | HTLV-1 | |
Subject in Portuguese | Virus linfotropico de celulas T Humanas 1 | |
Subject in Portuguese | Carga viral | |
Subject in Portuguese | Saliva | |
Title | Mutações na região LTR do HTLV e sua implicação na presença do vírus na saliva e origem na Bahia | pt_BR |
Type | Dissertation | pt_BR |
Defense date | 2010 | |
Departament | Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz | pt_BR |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz | pt_BR |
Place of Defense | Salvador | pt_BR |
Program | Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa | pt_BR |
Abstract | HTLV-1/HIV-1 coinfection is associated with severe clinical manifestations, marked
immunodeficiency and opportunistic pathogenic infections, as well as risk behavior. Salvador, the
capital of the State of Bahia, Brazil, has the highest HTLV-1 prevalence (1.74%) found in Brazil.
Few studies exist which describe this coinfection found in Salvador and its surrounding areas, much
less investigate how these viruses circulate or assess the relationship between them. HTLV-1 is the
etiological agent of ATL, HAM/TSP and inflammatory disturbs, including salivary disorders. Few
studies attempts to analyze the HTLV-1 intrahost variations into different corporeal fluids and their
impact on HTLV outcome infection. To investigate the prevalence of HTLV/HIV coinfection in
surrounding areas, as well as the molecular epidemiology of HTLV, a cross sectional study was
carried out involving 107 women infected with HIV-1 from the DST/HIV/AIDS Reference Center
located in the neighboring City of Feira de Santana. Patient samples were submitted to ELISA and
HTLV infection was confirmed using Western Blot and Polymerase Chain Reaction (PCR).
Phylogenetic analysis using Neighbor-Joining (NJ) and Maximum Likelihood (ML) was performed
on HTLV LTR sequences in order to gain further insights about molecular epidemiology and the
origins of this virus in Bahia. . Another study was performed to determine the proviral load and
HTLV-1 tax-LTR intra-host variations from PBMC and mouthwash cells from HTLV-1 infected
individuals. To investigate the proviral load a real-time PCR was performed and to analyze the
intrahost variations a nested-PCR, followed by molecular cloning, DNA sequencing and
computational analysis were performed. Four out of five reactive samples were confirmed to be
infected with HTLV-1, and one with HTLV-2. The seroprevalence of HTLV among HIV-1
coinfected women was found to be 4.7%. Phylogenetic analysis of the LTR region from four
HTLV-1 sequences showed that all isolates were clustered into the main Latin American group
within the Transcontinental subgroup of the Cosmopolitan subtype. The HTLV-2 sequence was
classified as the HTLV-2c subtype. It was also observed that four HTLV/HIV-1 coinfected women
exhibited risk behavior with two having parenteral exposures, while another two were sex workers.
Conclusion: This paper describes the characteristics of coinfected patients. This coinfection is
known to be severe and further studies should be conducted to confirm the suggestion that HTLV-1
is spreading from Salvador to surrounding areas. The difference between the proviral load medians
was significant, comparing the individuals with provirus detected on mouthwash cells (n = 8) and
the 18 individuals without provirus detected on mouthwash cells (101278.5 vs 23290.0 copies per
106 PBMC, p=0.0245). The analysis, comparing mouthwash and PBMC clones, with regard to the
HTLV-1 intrahost variation, showed no clonal profile among the individuals with proviral load
detected on mouthwash cells, with no statistic significance on Hudson test. The mean diversity
within PBMC and mouthwash clones ranged from 0.003 from 0.008. Results of posttranslational
modification sites in tax fragment were equivalent between the analyzed groups. All analyzed
sequences were classified into the Transcontinental subgroup of Cosmopolitan subtype. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
Subject | HTLV-1 | |
Subject | Human T cell lymphotropic virus 1 | |
Subject | Viral load | |
Subject | Saliva | |
Author | Castro Filho, Bernardo Galvão | pt_BR |