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NATURAL VARIATION OF THE CARDIAC TRANSCRIPTOME IN HUMANS
Genetic variation
Heart ventricles
Human heart
Ribosome profiling
Translatome
Autor(es)
Afiliação
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Departamento de Virologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Pesquisa Clínica em DST/AIDS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Pesquisa Clínica em DST/AIDS. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de janeiro. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Programa de Biologia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumo em Inglês
We investigated the gene-expression variation among humans by analysing previously published mRNA-seq and ribosome footprint profiling of heart left-ventricles from healthy donors. We ranked the genes according to their coefficient of variation values and found that the top 5% most variable genes had special features compared to the rest of the genome, such as lower mRNA levels and shorter half-lives coupled to increased translation efficiency. We observed that these genes are mostly involved with immune response and have a pleiotropic effect on disease phenotypes, indicating that asymptomatic conditions contribute to the gene expression diversity of healthy individuals.
Palavras-chave em inglês
Gene expression profilingGenetic variation
Heart ventricles
Human heart
Ribosome profiling
Translatome
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