Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas (PGBCS): Recent submissions
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Searching for TPP riboswitch in the human genome and comparison with others from different species
| Date Issued: 2018Riboswitches são sensores de RNA que afetam os processos pós-transcricionais através de sua capacidade de se conectar a metabólitos. A classe de tiamina pirofosfato (TPP) riboswitch é a mais difundida entre os riboswitches ... -
Descrição da Biodiversidade Molecular de Hypancistrus zebra (Loricariidae: Siluriformes), uma Espécie de Peixe Ornamental Ameaçada de Extinção
| Date Issued: 2018Os impactos das atividades humanas na Terra são tão profundos que a proposta de definição de uma nova época geológica, o Antropoceno, tem sido amplamente debatida. Nesta nova época, a perda da biodiversidade destaca-se ... -
Metodologia de desenvolvimento de data marts para apoio à decisão baseado no uso de ontologias e estudo de caso para a priorização de alvos de fármacos em tripanossomatídeos
| Date Issued: 2018A anotação de texto semântico permite a associação de conceitos presentes em uma ontologia a expressões textuais (termos), que são legíveis por agentes de software. No cenário científico, isso é particularmente útil, porque ... -
O que Dados Transcriptômicos Revelam sobre a Biodiversidade e Evolução de Loricarioidei (Siluriformes)
| Date Issued: 2018A biodiversidade é uma entidade multidimensional, que se refere a diferentes elementos e níveis de variabilidade da vida na Terra. As tecnologias de sequenciamento de ácidos nucleicos de alto desempenho, aliadas à biologia ... -
Identificação de alvos terapêuticos para a bactéria multirresistente P. aeruginosa CCBH4851 através da análise de redes metabólicas
| Date Issued: 2018Infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS) é um grave problema de saúde pública. Elas podem estar associadas à morbidade e mortalidade e são responsáveis pelos aumentos da hospitalização de pacientes. Neste contexto, ... -
Estudo da interação do scFv do anticorpo Rituximab com a alça do receptor CD20: avaliação da energia livre de ligação pelo método ABF para proposição de biobetters
| Date Issued: 2018Diante da relevância dos casos de câncer no mundo, o estudo de alternativas para o tratamento é de extrema importância, e uma delas é a obtenção de anticorpos monoclonais (mAbs) que interagem com maior eficiência com seus ... -
Filodinâmica de Elementos Transponíveis e seu uso no controle genético de vetores de doenças infecciosas
| Date Issued: 2012As doenças transmitidas por mosquitos têm grande custo de vidas e socio-econômico, especialmente em países tropicais em desenvolvimento, e por isso é uma prioridade para a Organização Mundial da Saúde. Novas propostas para ... -
Cálculos de Potenciais de Superfície para Análise de Drogabilidade
| Date Issued: 2015A seleção de um alvo (macromolécula) com potencial terapêutico é uma etapa chave na maioria dos programas de desenvolvimento de fármacos. A habilidade de prever se uma proteína em particular possui alta afinidade por um ... -
Identificação in silico de potenciais inibidores da ribose 5-fosfato isomerase de Trypanosoma cruzi
| Date Issued: 2017A doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, afeta aproximadamente sete milhões de pessoas, principalmente na América Latina, e causa 7000 mortes ao ano. Os tratamentos disponíveis são insatisfatórios e ... -
O impacto de pequenas deleções genômicas em domínios protéicos identificadas a partir de dados de rna-seq de amostras de pacientes de adenocarcinoma de pulmão
| Date Issued: 2017Inserções e deleções (INDELs) são exemplos de alterações na sequência de DNA. As alterações causadas por deleções genômicas podem modificar nucleotídeos da região codificadora de proteínas com potencial para alterar os ... -
Utilização de RNAs não codificadores pequenos na distinção de amostras humanas de câncer de pulmão e de células do sangue
| Date Issued: 2017Os RNAs não codificadores pequenos, como piRNAs, snoRNAs e miRNAs, atuam em diversas etapas do metabolismo celular, participando de processos como controle da expressão gênica, metilação e pseudouridilação de rRNAs e ... -
Estudo de metaloproteases de Leishmania (Viannia) braziliensis pertencentes ao cromossomo 10 da família M8
| Date Issued: 2017O genoma de Leishmania (Viannia) braziliensis possui um número significante de genes de metaloproteases. Entretanto, não se sabe por que esse parasito apresenta uma grande quantidade de genes em um determinado cromossomo. ... -
Melhoramento de docking-based virtual screening usando abordagem de deep learning
| Date Issued: 2017Funções de pontuação são um dos grandes problemas na metodologia de Docking- Based Virtual Screening - DBVS, pois elas não são capazes de classificar de forma confiável ligantes docados. Nesse trabalho propomos um novo ... -
Análise do perfil de expressão de microRNAs, RNAs que interagem com PIWI e RNAs nucleolares pequenos em diferentes subtipos de câncer de tiroide
| Date Issued: 2017O câncer de tiroide é um relevante problema de saúde pública por ser o tumor maligno mais comum do sistema endócrino. Para a obtenção de melhores tratamentos, estratégias distintas vêm sendo desenvolvidas, dentre elas a ... -
Análise do comportamento de oviposição do mosquito Aedes aegypti em Paquetá/RJ
| Date Issued: 2017Aedes aegypti é um dos mais importantes insetos vetores, sendo responsável pela transmissão dos vírus da dengue, chikungunya e Zika no Brasil, causando atualmente grande impacto para a saúde pública. O mosquito é ... -
Atracamento molecular virtual assistido por dados experimentais de relaxação de prótons
| Date Issued: 2016O presente trabalho tem como premissa avaliar se o uso de dados experimentais de relaxação de prótons obtidos por ressonância magnética nuclear pode melhorar o desempenho de programas de atracamento molecular virtual. Para ... -
Predição computacional das interações proteína-proteína em espécies do gênero Cryptococcus spp
| Date Issued: 2016A biologia de sistemas procura modelar sistemas complexos, usufruindo de conteúdos interdisciplinares e possibilitando a integração da informação biológica disponível sobre determinado organismo. Nesse contexto, uma das ... -
Desenvolvimento de Novos Potenciais Antagonistas de Integrinas da Família β1 através de Docking Molecular e Desenho de novo
| Date Issued: 2017A migração celular é um processo fundamental para o funcionamento do sistema linfo-hematopoiético, incluindo tanto o tráfego fisiológico de leucócitos quanto a gênese e manutenção de diferentes respostas inflamatórias. ... -
Representação multidimensional da Rede da Vida a partir de distâncias intergenômicas
| Date Issued: 2017Esta dissertação trata de métodos de cálculo de distâncias intergenômicas a partir do conjunto de proteínas preditas de organismos e da representação de distâncias intergenômicas em um modelo tridimensional da Rede da Vida. ... -
Estruturação populacional de Rhodnius neglectus (Hemiptera: Reduviidae), no bioma cerrado e em áreas de transição cerrado-caatinga
| Date Issued: 2016A doença de Chagas no bioma cerrado e em áreas de transição cerrado-caatinga pode ser transmitida por triatomíneos silvestres nativos e, portanto, estratégias tradicionais de controle vetorial (borrifação de inseticidas ...