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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/17601
A PLATAFORMA PDTIS DE BIOINFORMÁTICA: DA SEQÜÊNCIA À FUNÇÃO
Biologia Computacional
Banco de Dados
Genoma
Análise de Sequências
Alternative title
The PDTIS bioinformatics platform: from sequence to functionAuthor
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular. Manguinhos, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Desde os anos 1980, a Bioinformática tem adquirido uma importância crescente nas ciências biológicas. Devido à complexidade de ferramentas tanto de hardware quanto de software, e a necessidade de ter-se um gerenciamento especializado de infra-estruturas de rede, processamento e armazenamento de dados, muitas instituições de pesquisa organizaram um núcleo de bioinformática (core facility, CPD, Centro de (Bio)informática etc.). Neste artigo, descrevemos uma evolução típica de atividades na área de bioinformática e a organização de um núcleo mínimo com suporte institucional. Desde o final da década de 1980, a Fiocruz tem contribuído para o estabelecimento e desenvolvimento da Bioinformática no Rio de Janeiro, através de diferentes iniciativas. Iniciando com cursos de análise de seqüências ministrados na Fiocruz, hoje a instituição conta com um serviço permanente de Bioinformática, integrado a outras atividades estratégicas desenvolvidas, através de uma rede temática de plataformas com suporte de um Programa de Desenvolvimento Tecnológico em Insumos para a Saúde (PDTIS), cujas principais atribuições concentram-se no suporte, no estabelecimento de novas metodologias e na participação ativa em projetos de desenvolvimento tecnológico. Neste artigo, descrevemos a Plataforma PDTIS de Bioinformática, o seu escopo, os seus recursos e as suas atividades de suporte, ensino e pesquisa, considerando que muitos outros centros de pesquisa encontram-se em situação similar O surgimento da Bioinformática como uma nova área do conhecimento e um histórico de seu desenvolvimento na Fiocruz também são apresentados, de forma resumida.
Abstract
Since the eighties, Bioinformatics has acquired a growing importance in the biological sciences. Due to the complexity
of hardware and software tools, and the need for a specialized management of network infrastructure, data processing
and storage, many research institutions organized a bioinformatics core facility. In this work, we describe typical
bioinformatics activities and the organization of a bioinformatics core with institutional support. Since the end of the
1980s, Fiocruz has contributed for the development and establishment of Bioinformatics in Rio de Janeiro, through
different initiatives. Starting with sequence analysis courses, today our institution has a permanent Bioinformatics
service, integrated with other strategic activities through a thematic network of technological platforms imbedded
in the Program for Technological Development of Health Products (PDTIS), where the main attributions of such
platforms are concentrated in support, establishment of new methodologies and active participation in research
projects and technological development.
In this paper we present the PDTIS Bioinformatics Platform, its scope, resources and its support, teaching and
research activities. Bioinformatics has emerged as a new scientific area and a short history of its development at
Fiocruz is also summarized.
Keywords in Portuguese
BioinformáticaBiologia Computacional
Banco de Dados
Genoma
Análise de Sequências
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