Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/31713
INTEGRATED ANALYSIS OF ETHIONAMIDE RESISTANCE LOCI IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS CLINICAL ISOLATES
Mycobacterium tuberculosis
Resistência à etionamida
Análise integrada
Isolados clínicos
Locos
Mycobacterium tuberculosis
Ethionamide resistance
Integrated analysis
Clinical isolates
Loci
Author
Silva, Duanne Alves da
Ferreira, Nicole Victor
Rego, Amanda Mendes
Barbosa, Pamela Chrystina Pinto
Machado, Rodrigo Fernandes
Pimentel, Alessandra
Reis, Lusiano Motta dos
Pina, Lucindo Cardoso de
Redner, Paulo
Caldas, Paulo Cesar de Souza
Montes, Fátima Cristina Onofre Fandinho
Borga, Liamar
Leite, Suzanne Pereira
Rocha, Jorge Luiz da
Bastos, Leonardo Soares
Ramos, Jesus Pais
Degrave, Wim Maurits Sylvain
Antunes, Luis Caetano Martha
Galvão, Teca Calcagno
Ferreira, Nicole Victor
Rego, Amanda Mendes
Barbosa, Pamela Chrystina Pinto
Machado, Rodrigo Fernandes
Pimentel, Alessandra
Reis, Lusiano Motta dos
Pina, Lucindo Cardoso de
Redner, Paulo
Caldas, Paulo Cesar de Souza
Montes, Fátima Cristina Onofre Fandinho
Borga, Liamar
Leite, Suzanne Pereira
Rocha, Jorge Luiz da
Bastos, Leonardo Soares
Ramos, Jesus Pais
Degrave, Wim Maurits Sylvain
Antunes, Luis Caetano Martha
Galvão, Teca Calcagno
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Cientifica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro,RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Cientifica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Centro de Referência Prof. Hélio Fraga. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro,RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Tuberculosis patients taking second line drugs such as ethionamide (ETH) have often experienced previous treatment failure and usually have a complex history of disease and treatment that can span decades. Mutations in the ETH activating enzyme, EthA, confer resistance through undescribed mechanisms. To explore the impact of EthA mutations on ETH resistance, data from a total of 160 ETHR isolates was analysed. The most frequently mutated positions are within regions that display sequence conservation with the active site of OTEMO, another FAD-containing NADH-binding Baeyer-Villiger monooxygenase (BVMO), or with the sugar binding site of galectin-4N. Additionally, to look at a possible role of EthR on ETH resistance we purified an EthR mutant identified in a clinical isolate, F110L, and found it to bind the ethA-ethR intergenic region with higher affinity than the wild type regulator in gel shift assays. The ability of cyclic di-GMP to enhance DNA binding is maintained in the EthR mutant. To our knowledge, this is the first ETH resistance study that combines sequence and resistance data of clinical isolates with functional and structural information.
Keywords in Portuguese
TuberculoseMycobacterium tuberculosis
Resistência à etionamida
Análise integrada
Isolados clínicos
Locos
Keywords
TuberculosisMycobacterium tuberculosis
Ethionamide resistance
Integrated analysis
Clinical isolates
Loci
Share