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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/42670
Type
DissertationCopyright
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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-EstarCollections
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SISTEMA DE INFORMAÇÃO GEOGRÁFICA E ESTATÍSTICA ESPACIAL PARA O MONITORAMENTO DE BACTÉRIA MULTIRRESISTENTE EM HOSPITAL: UM MODELO COM COMPLEXO KLEBSIELLA PNEUMONIAE RESISTENTE A CARBAPENEMAS
Infecção Hospitalar
Klebsiella Pneumoniae
Sistemas de Informação Geográfica
Infecção Hospitalar
Klebsiella Pneumoniae
Sistemas de Informação Geográfica
Silva, Priscila Pinho da | Date Issued:
2019
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Introdução: A resistência aos antimicrobianos tem se tornado, nas últimas décadas, um grande desafio aos hospitais, uma vez que as opções terapêuticas para tratar infecções causadas por bactérias com múltiplos mecanismos de resistência estão muito limitadas. Klebsiella pneumoniae com perfil de resistência é um bom exemplo na atualidade de patógeno adquirido em hospital, que frequentemente causa colonização e infecção, com elevados índices de morbidade e mortalidade, e aumento nos custos do sistema de saúde. Objetivo: entender a dinâmica da circulação de bactérias multirresistentes (MDR), usando membros do complexo K. pneumoniae como modelo, por meio de Sistema de Informação Geográfico (SIG) e estatística espacial, dentro de uma unidade hospitalar, é uma inovação que pode ajudar no aprimoramento da prevenção e controle da resistência aos antimicrobianos. Métodos: Este estudo é um subprojeto de pesquisas prospectivas, em resistência antimicrobiana, que vêm sendo realizadas em um hospital federal, terciário, de aproximadamente 500 leitos, localizado no Rio de Janeiro. Todas as detecções de K. pneumoniae, de amostras clínicas e de vigilância, provenientes de pacientes admitidos em enfermarias intensivas e não intensivas do hospital, pelo sistema Vitek-2 (BioMérieux), durante 2014 a 2016, foram classificados de acordo com o perfil de susceptibilidade antimicrobiana em MDR, possível resistência estendida (XDR), ou possível pan-resistente (PDR). A estrutura física do hospital foi mapeada, em corte longitudinal, em escala, por meio do software AutoCAD e transferido para os QGis para permitir o geoprocessamento intra-hospitalar Posteriormente, as detecções de bactérias do complexo K. pneumoniae e os pacientes albergando cepas com diferentes perfis de resistência aos antimicrobianos foram georreferenciados por enfermarias e investigadas no espaço e no tempo. Para a detecção de sinais de cluster, teste de probabilidade por permutação espaço-temporal foi utilizado. Resultados: Do total de 759 isolados estudados, de unidades intensivas (40%, n=303) e não intensivas (60%, n=456), 62% (472/759) eram cepas MDR, sendo 30% (138/472) possível XDR e 6% (28/472) possível PDR. Um aumento significativo no perfil de resistência de complexo K. pneumoniae foi observado durante os anos de estudo. Dois clusters espaço-temporais de pacientes albergando cepas do complexo K. pneumoniae resistentes a carbapenemas foram identificados, sendo um dos clusters afetando pacientes que se encontravam internados em enfermarias de adultos e pediatria, localizadas em diferentes andares, o qual dificilmente seria percebido pelo protocolo regular de vigilância de bactérias MDR utilizado em hospitais Discussão: O uso desta técnica em ambiente hospitalar, onde dados de cepas e de pacientes albergando bactéria MDR podem ser demonstrados e estudados por meio de mapa digital, aumenta o entendimento da circulação de bactéria MDR e do risco de transmissão. O geoprocessamento intra-hospitalar com análise estatística espaço-temporal de bactéria MDR tem o potencial de facilitar a detecção precoce de surto e se tornar uma ferramenta para as instituições de saúde, no combate à resistência aos antimicrobianos.
Abstract
Antimicrobial resistance has become in the last decades a challenge in hospitals as the therapeutic options for the treatment of infections caused by bactéria with multiple drug resistance mechanisms are limited. Klebsiella pneumoniae with antimicrobial resistance profile is currently a good example of a hospital-acquired pathogen that frequently causes colonization and infection, with high rates of morbidity and mortality, and na increase in the cost of the healthcare system. Understanding the dynamics of the circulation of multidrug-resistant (MDR) bactéria, using complex Klebsiella pneumoniae isolates as a model, by Geographic Information System (GIS) with spatio-temporal statistics, within a hospital unit, is na innovation that may help to improve the prevention and control of antimicrobial resistance. Methods: This study is a subproject of clinical, epidemiological and laboratory prospective research proects in antimicrobial resistance that have been carried out in a federal, tertiary hospital of appoximately 500-beds, located in Rio de Janeiro. All microbiological results of complex K. pneumoniae, from clinical and surveillance samples of pacientes admitted to the intensive (ICUs) and non-intensive care wards, which were identified by Vitek-2 system (BioMérieux), during 2014 to 2016, were classified according to their antimicrobial susceptibility profiles in MDR, possible extensively drug-resistant (XDR) or pan-drug resistant (PDR) Base and longitudinal map with scale of the hospital\2019s physical structure were developed in AutoCAD and taken to QGis software, providing intrahospital geoprocessing. Thereafter, isolates, without repetitions, and patients harbouring members of complex K. pneumoniae with diferente antimicrobial resistance profile were georreferenced by the hospital wards. We used space-time permutation probability test for cluster signals detection. Results: Of the total of 759 studied isolates from intensive (40%, n=303) and non-intensive (60%, n=456) clinical áreas, 62% (472/759) were MDR, with 30% (138/472) possible XDR and 6% (28/472) possible PDR. A significant increase in the resistance profiles of complex K. pneumoniae was observed during the years of study. Two spatiotemporal clusters of patients with carbapenem-resistant complex K. pneumoniae were also identified, with one cluster occurring in adult and pediatric wards, located on diferente floors, that could not be perceived by the protocolo f regular MDR surveillance used in hospitals. Duiscussion: The use of this technique in a hospital setting, where strains of and patients with antimicrobial resistant bactéria can be demonstrated and studied spactially and temporally through digital hospital maps, increases the understanding of bacterial circulation and the risk of active transmission. Hospital GIS with space-time statistical analysis of MDR bactéria has the potential to facilitate early detection of hospital outbreaks and may become a new tool for health institutions in combating antimicrobial resistance.
Keywords in Portuguese
Resistência Microbiana a MedicamentosInfecção Hospitalar
Klebsiella Pneumoniae
Sistemas de Informação Geográfica
DeCS
Resistência Microbiana a MedicamentosInfecção Hospitalar
Klebsiella Pneumoniae
Sistemas de Informação Geográfica
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