Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/46099
Tipo
ArtículoDerechos de autor
Acceso abierto
Objetivos de Desarrollo Sostenible
03 Saúde e Bem-EstarColecciones
- ENSP - Artigos de Periódicos [2350]
- IOC - Artigos de Periódicos [12791]
Metadatos
Mostrar el registro completo del ítem
WASTEWATER-BASED EPIDEMIOLOGY AS A USEFUL TOOL TO TRACK SARS-COV-2 AND SUPPORT PUBLIC HEALTH POLICIES AT MUNICIPAL LEVEL IN BRAZIL
SARS-CoV-2
Políticas públicas de saúde
Sequenciamento de genoma inteiro
Epidemiologia baseada em águas residuais
Rede Genômica Fiocruz
GENOMAHCOV
SARS-CoV-2
Public health policies
Wastewater-based epidemiology
Whole-genome sequencing
A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/
Autor
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Sergio Arouca.. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Prefeitura de Niterói, Secretaria Municipal de Saúde. Coordenação de Vigilância Epidemiológica. Niterói, RJ, Brasil.
Prefeitura de Niterói. Sistema de Gestão da Geoinformação- SIGeo. Niterói, RJ, Brasil.
Prefeitura de Niterói. Sistema de Gestão da Geoinformação- SIGeo. Niterói, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Sergio Arouca.. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Prefeitura de Niterói, Secretaria Municipal de Saúde. Coordenação de Vigilância Epidemiológica. Niterói, RJ, Brasil.
Prefeitura de Niterói. Sistema de Gestão da Geoinformação- SIGeo. Niterói, RJ, Brasil.
Prefeitura de Niterói. Sistema de Gestão da Geoinformação- SIGeo. Niterói, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumen en ingles
Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) wastewater-based epidemiology (WBE) has been applied as a complementary approach for spatial tracking of coronavirus disease 2019 cases (COVID-19) as well as early warning of the occurrence of infected populations. The present study presents the result of the monitoring of sanitary sewerage in the municipality of Niterói, a metropolitan region of Rio de Janeiro (Brazil) and its use as a complementary indicator in the surveillance of COVID- 19 cases, thus assisting actions of public health from local authorities. Twelve composite raw sewage samples were weekly collected from two wastewater treatment plants (WWTPs) and alternately from 17 sewer pipes (SP) from surrounding neighbourhoods and slums throughout 20 weeks (April 15th to August 25th, 2020). Two hundred twenty-three samples were concentrated using the ultracentrifugation-based method and SARS-CoV-2 RNA detected and quantified by RT-qPCR using primers and probe targeting the N2 genome. SARS-CoV-2 RNA was detected in 84.3% (188/223) of samples with a positive rate ranging from 42% (5/12) in the first week of monitoring to 100% during the peak of epidemic with viral concentration ranging from 3.1 to 7.1 log 10 genome copies / 100 mL throughout the studied period. Positive rates were higher in WWTPs when compared to SP, being useful tool for monitoring trends in the evolution of the COVID-19 curve, while SP data were more effective when health public interventions were needed. Whole-genome sequencing using Illumina MiSeq System confirmed the lineage of three genomes as B.1.1.33 (clade G) containing the nucleotide substitutions observed in strains that circulate in the Rio de Janeiro during the period of this study. In addition, geoprocessing tool was used to build heat maps based on SARS-CoV-2 data from sewage samples, which were weekly updated and available online to the general population as an indicator of the ongoing epidemic situation in Niterói city, raising public awareness.
Palabras clave en portugues
COVID-19SARS-CoV-2
Políticas públicas de saúde
Sequenciamento de genoma inteiro
Epidemiologia baseada em águas residuais
Rede Genômica Fiocruz
GENOMAHCOV
Palabras clave en ingles
COVID-19SARS-CoV-2
Public health policies
Wastewater-based epidemiology
Whole-genome sequencing
Editor
Elsevier
Referencia
PRADO, Tatiana et al. Wastewater-based epidemiology as a useful tool to track SARS-CoV-2 and support public health policies at municipal level in Brazil. Water Research, v. 191, p. 1-12, 2021.DOI
10.1016/j.watres.2021.116810ISSN
0043-1354Notas
Since January 2020 Elsevier has created a COVID-19 resource centre with free information in English and Mandarin on the novel coronavirus COVID19. The COVID-19 resource centre is hosted on Elsevier Connect, the company's public news and information website. Elsevier hereby grants permission to make all its COVID-19-related research that is available on the COVID-19 resource centre - including this research content - immediately available in PubMed Central and other publicly funded repositories, such as the WHO COVID database with rights for unrestricted research re-use and analyses in any form or by any means with acknowledgement of the original source. These permissions are granted for free by Elsevier for as long as the COVID-19 resource centre remains active.A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/
Compartir