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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/50398
SUSCEPTIBILIDADE ANTIMICROBIANA EM CEPAS DE NEISSERIA SPP. ISOLADAS DE PORTADORES ASSINTOMÁTICOS EM SALVADOR, BRASIL
Neisseria meningitidis
Neisseria lactamica
Susceptibilidade antimicrobiana
Concentração inibitória mínima
Genômica
Neisseria meningitidis
Neisseria lactamica
Antimicrobial susceptibility
Minimal inibitory concentration
Genomics
Santos, Juliana Costa de Araújo | Date Issued:
2021
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Abstract in Portuguese
INTRODUÇÃO: As espécies do gênero Neisseria colonizam a orofaringe de humanos e de muitos animais. Porém, apenas N. gonorrhoeae e N. meningitidis são bem estabelecidas como patógenos humanos. Essa colonização assintomática permite que espécies patogênicas e comensais, como N. lactamica, coabitem no mesmo nicho, facilitando a captação de DNA e a transferência horizontal de genes, havendo a possibilidade de gerar desde imunidade contra os meningococos a formar cepas invasivas multirresistente. OBJETIVO: Descrever características de resistência aos antimicrobianos, do ponto de vista fenotípico e genotípico, de cepas circulantes de Neisseria spp. isoladas de portadores assintomáticos, em Salvador, Bahia. MATERIAL E MÉTODOS: Um total de 169 amostras de Neisseria spp. foram incluídas no estudo, compreendendo as espécies N. meningitidis (n=105), N. lactamica (n=57), N. gonorrhoeae (n=3), 3 N. subflava (n=3) e N. polysaccharea (n=1). Essas amostras foram isoladas de material de orofaringe de estudantes de 11 a 24 anos de idade, em 2014 e 2016. O método de microdiluição em caldo, para determinar a concentração inibitória mínima (MIC) de 10 agentes antimicrobianos, foi realizado em 140 isolados de N. meningitidis (n=86) e N. lactamica (n=54), empregando os critérios de interpretação do CLSI, EUCAST e BrCAST. Além disso, através da análise das sequências do genoma completo disponíveis, foi realizado um estudo filogenético e investigada a presença de genes de resistência a antibióticos em 153 isolados de Neisseria spp. RESULTADOS: Os testes de susceptibilidade aos antimicrobianos mostraram que 12,8% (n=11/86) dos isolados de N. meningitidis apresentaram susceptibilidade reduzida para até quatro antibióticos. As amostras de N. lactamica foram sensíveis a todos os antimicrobianos testados, embora todas as amostras tenham demonstrado a presença dos genes penA, gyrA, rpoB, folP, e/ou de genes de resistência associados à bomba de efluxo (genes farABR, mtrCDER e macAB). CONCLUSÕES: Neste estudo, a presença de genes de resistência não esteve diretamente associada à expressão de resistência aos antibióticos. No entanto, a possibilidade de troca genética entre espécies de Neisseria demonstrou a importância da realização de estudos contínuos para investigar a dinâmica do perfil de suscetibilidade de espécies de Neisseria como N. meningitidis para possibilitar um tratamento eficiente das doenças associadas a essas bactérias.
Abstract
INTRODUCTION: Neisseria species are commonly found as part of the commensal microbiota in the upper respiratory tract of humans and many animals. Nevertheless, N. gonorrhoeae and N. meningitidis are quite common as human pathogens. The asymptomatic colonization allows pathogenic and commensal species, such as N. lactamica, to cohabit in the same niche, facilitating the uptake of DNA and horizontal transfer of genes, which may allow the generation of immunity against meningococci and multiresistant invasive strains. AIM: To describe antimicrobial resistance characteristics, from the phenotypic and genotypic point of view, of circulating strains of Neisseria spp. isolated from asymptomatic carriers in Salvador, Bahia. MATERIAL AND METHODS: A total of 169 Neisseria spp. were included in the study, comprising the species N. meningitidis (n=105), N. lactamica (n=57), N. gonorrhoeae (n=3), N. subflava (n=3) and N. polysaccharea (n=1). These samples were isolated from oropharyngeal material of 11- to 24-year-old students in 2014 and 2016. The broth microdilution method, to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) of 10 antimicrobial agents, was performed on 140 isolates of N. meningitidis (n=86) and N. lactamica (n=54), using the CLSI, EUCAST and BrCAST interpretation criteria. Furthermore, through the analysis of available complete genome sequences, a phylogenomic study was carried out and the presence of antibiotic resistance genes was investigated in 153 Neisseria spp. RESULTS: Antimicrobial susceptibility tests showed that 12.8% (n=11/86) of N. meningitidis isolates had reduced susceptibility to up to four antibiotics. The samples of N. lactamica were sensitive to all antimicrobials tested, although all samples demonstrated the presence of the genes penA, gyrA, rpoB, folP, and/or resistance genes associated with the efflux pump (genes farABR, mtrCDER and macAB). CONCLUSIONS: In this study, the presence of resistance genes was not directly associated with the expression of antibiotic resistance. However, the possibility of genetic exchange between Neisseria species demonstrated the importance of conducting continuous studies to investigate the dynamics of the susceptibility profile of Neisseria species such as N. meningitidis to enable an efficient treatment of diseases associated with these bacteria.
Keywords in Portuguese
Neisseria spp.Neisseria meningitidis
Neisseria lactamica
Susceptibilidade antimicrobiana
Concentração inibitória mínima
Genômica
Keywords
Neisseria spp.Neisseria meningitidis
Neisseria lactamica
Antimicrobial susceptibility
Minimal inibitory concentration
Genomics
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