Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/56772
FILOGENÉTICA E AVALIAÇÃO DAS FAMÍLIAS DAS FERRO-SUPERÓXIDO DISMUTASE DE TRYPANOSOMA CRUZI COMO ALVOS DE NOVOS COMPOSTOS QUIMIOTERÁPICOS
ferro superóxido dismutase
defesa antioxidante
inferência filogenética
evolução molecular
alvos de fármacos
iron superoxide dismutase
antioxidant defense
phylogenetic inference
molecular evolution
Rios, Jéssica Silqueira Hickson | Date Issued:
2022
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Abstract in Portuguese
A doença de Chagas é uma zoonose negligenciada causada pelo protozoário parasito Trypanosoma cruzi. Dados epidemiológicos mostram que a doença afeta mais de seis milhões de pessoas no mundo. Os únicos fármacos disponíveis para o tratamento clínico são o benzonidazol e o nifurtimox. No entanto, ambos são muito tóxicos e a eficácia de cura principalmente na fase crônica da doença é baixa, sendo dependente de fatores como a susceptibilidade das cepas de T. cruzi aos fármacos e fisiologia do hospedeiro. O sistema de defesa antioxidante do parasito é um potencial alvo para a busca de novos compostos para tratamento da doença de Chagas. Esse mecanismo é responsável por manter o ambiente intracelular reduzido, protegendo o parasito contra o estresse oxidativo. As enzimas ferrosuperóxido dismutases (FeSODs) atuam neste sistema promovendo a metabolização do ânion superóxido em peróxido de hidrogênio e oxigênio. As FeSODs apresentaram resultados promissores como alvos de novos compostos anti-T. cruzi previamente testados. O ferro é ausente nas SODs humanas, o que reforça o potencial dessas enzimas como alvos de novas abordagens quimioterápicas. Além disso, os genes das FeSODs do tipo A, foram descritos como genes essenciais para parasitos do gênero Leishmania. O objetivo geral do presente estudo foi predizer a biodiversidade molecular e relações evolutivas dos genes codificadores das FeSODA e FeSOD-B em diferentes cepas de T. cruzi. Foram obtidas sequências dos genes da FeSODA e FeSOD-B de 35 cepas de T. cruzi (Discrete Typing Units - DTUs: Tcl a TcVI), de diferentes hospedeiros e regiões geográficas. Outras sequências de FeSODs foram recuperadas de bancos de dados públicos. Nossos resultados sugerem que as FeSODs do parasito são membros de famílias proteicas. A busca por sequências codificadoras dos diferentes tipos de FeSODs no genoma do parasito sugere que existam duas cópias do gene da FeSOD-A, quatro de FeSODB e outras quatro de FeSOD-C no clone híbrido CL Brener. A inferência filogenética revelou a presença de duas potenciais variantes funcionais de cada tipo de FeSOD estudada no parasito. Nossos resultados apoiam a hipótese de evolução dessas variantes por duplicação gênica seguida de divergência. As árvores apresentaram um grupo monofilético composto por todos os genes das cepas da DTU TcIV nas topologias de FeSOD-A e FeSOD-B. Hipotetizamos que a evolução dessas enzimas é concernente com parte da evolução de T. cruzi. Além disso, realizamos testes in vitro de dois compostos (mangafodipir e polaprezinc) que interagem com as FeSODs de T. cruzi, contra formas amastigotas e tripomastigotas do parasito. O mangafodipir teve um baixo efeito tripanocida e o polaprezinc foi inativo. Nosso estudo contribuiu para um melhor entendimento sobre a biodiversidade molecular das FeSODs de T. cruzi sob uma perspectiva evolutiva. Propomos uma abordagem eficaz para a pesquisa de potenciais famílias gênicas alvo de novos compostos tripanocidas.
Abstract
Chagas disease is a neglected zoonosis caused by protozoan parasite Trypanosoma cruzi. Epidemiologic data demonstrate that the disease affects over six million people worldwide. The only drugs available for the clinical treatment are the benzonidazol and nifurtimox. However, these drugs are highly toxic and the cure efficacy remains low in the disease chronic phase and dependent on factors such as the susceptibility of T. cruzi strains to the drugs and physiological conditions of the host. The antioxidant defense system of the parasite is a potential target for developing new drugs for the treatment of Chagas disease. This mechanism is responsible for keeping the intracellular environment reduced and protecting the parasite against oxidative stress. Superoxide dismutases (FeSODs) act in this system by promoting the metabolization of the superoxide anion into peroxide hydrogen and oxygen. Fe-SOD could be a promising target in the design of new anti-T. cruzi drugs that were previously tested. Iron (Fe) is absent in the human SODS, which reinforces that these enzymes are a promising molecular target for new hemotherapeutic approaches. In addition, FeSOD-A genes have been described as essential genes for Leishmania parasites. The general objective of the present study was to predict the molecular biodiversity and evolutionary relationship of the isoforms FeSOD-A and FeSOD-B coding genes in different T. cruzi strains. We obtained sequences of FeSOD-A and FeSOD-B genes from 35 T. cruzi strains (Discrete Typing Units - DTUs: Tcl to TcVI) isolated from different hosts and from different geographic areas. Other FeSOD sequences were retrieved from public databases. Our results suggest that the FeSODs of the parasite are members of protein families. The search for coding sequences of the different isoforms of the FeSODs in the parasite’s genome suggest that there are two copies of FeSOD-A, four of the FeSOD-B and other four copies of the FeSOD-C in the hybrid clone CL Brener. The phylogenetic inference revealed the presence of two potential functional variants of each isoform studied. We also propose that the two possible functional variants were originated by duplication events followed by divergence. The trees show a monophyletic group composed by all gene strains of DTU TcIV in the topologies of the FeSOD-A and FeSOD-B. We believe that the evolution of these enzymes is correlated with part of the evolution of T. cruzi. Furthermore, we performed in vitro tests of two drugs (mangafodipir and polaprezinc) that interact with FeSODs of T. cruzi, which act against amastigote and trypomastigote parasite stages. Mangafodipir had a low trypanocidal effect and polaprezinc was inactive. Our study contributed to a better understanding of the molecular biodiversity of the FeSODs of the T. cruzi from an evolutionary perspective. We provided an effective approach to the research of potential gene families which may be targets for new trypanocidal drugs.
Keywords in Portuguese
Trypanosoma cruzi,ferro superóxido dismutase
defesa antioxidante
inferência filogenética
evolução molecular
alvos de fármacos
Keywords
Trypanosoma cruziiron superoxide dismutase
antioxidant defense
phylogenetic inference
molecular evolution
Share