Vigilância genômica ambiental de Enterococcus faecium resistentes à vancomicina disseminados por estações de tratamento de efluentes

Abstract

O surgimento de Enterococcus faecium resistente à vancomicina (VREfm) carreando o gene vanA e múltiplos determinantes de resistência antimicrobiana é uma preocupação relevante de saúde pública. Este microrganismo é um patógeno oportunista responsável por infecções nosocomiais e se encontra amplamente distribuído no meio ambiente, assim como em Estações de Tratamento de Efluentes (ETEs). As ETEs podem desempenhar um papel importante na disseminação da resistência antimicrobiana, transportando vários contaminantes ambientais emergentes, como genes de resistência aos antimicrobianos (ARGs). O presente estudo aborda uma investigação genômica de E. faecium, carreando o gene vanA recuperados de ETEs no Brasil. Foram avaliadas 16 amostras de cinco ETEs abastecidas com águas residuais de diferentes origens. O sequenciamento completo do genoma de oito isolados de E. faecium abrigando vanA foi realizado utilizando a plataforma Illumina MiSeq. Todos esses isolados apresentaram perfil multirresistente e cinco cepas eram provenientes de efluentes tratados. A análise genômica apontou a presença de múltiplos genes de resistência aos antimicrobianos que podem conferir resistência aos fármacos utilizados na clínica médica, como aminoglicosídeos (aph(3')-IIIa, ant(6')-Ia), macrolídeos (ermB, msrC) e tetraciclinas (tetM, tetL), sendo alguns desses genes alocados em plasmídeos. Além disso, a análise de Multilocus Sequence Typing revelou que 75% (6/8) dos E. faecium pertenciam ao CC17, que está frequentemente associado a surtos hospitalares. Nesta análise, também foram detectados novos alelos e cinco STs diferentes, três previamente descritos (ST32, ST168, ST253) e dois novos (ST1893 e ST1894). Portanto, nossos dados revelam a presença de VREfm abrigando diversos GRAs em ETEs, indicando a relevância de estudos sobre a disseminação da resistência antimicrobiana em águas residuais para fins de vigilância epidemiológica, uma vez que efluentes tratados são lançados em corpos hídricos receptores