Variabilidade genética no sistema de efluxo MexAB-OprM, e seu regulador direito MexR em Pseudomonas aeruginosa e seu impacto na estrutura tridimensional das proteínas

Abstract

A Pseudomonas aeruginosa é atualmente classificada como uma das bactérias de risco crítico a saúde pública, por possuir resistência a várias classes de antibióticos essa resistência da se por seus diversos mecanismos de resistência entre eles as β-lactamases, as carbapenemases, as proteínas porinas, e as bombas de efluxo. As Bombas de efluxo destacam-se dos outros mecanismos, um vez que são responsáveis pela excreção de várias classes de antibióticos e outros produtos nocivos a célula. Este de mecanismos de resistência é o principal responsável pela dificuldade no tratamento de infecções por Pseudomonas aeruginosa sendo regularmente necessárias novas abordagens terapêuticas. Assim estudo possui como objetivo, verificar a presença de mutações sistema de efluxo MexAB-OprM, e seu regulador, em Pseudomonas aeruginosa, e as alterações na estrutura 3D das proteínas que compõem esse sistema. Foi sequenciada o genoma das amostras Pa036, que e uma cepa de Pseudomonas PDR, isolada na UTI do Hospital 28 de agosta, provenientes da Bacterioteca do grupo DCDIA/ILMD, deste genoma utilizamos os genes MexA, MexB, OprM e MexR para o presente estudo, também utilizamos todos os genes depositados no genback até o mês dezembro 2018, foram selecionados todos os genes completos de MexA, MexB, OprM e MexR,, os genes selecionados para esse estudo foram então alinhados e comparados com a cepa padrão Pa01 para pesquisa de mutações. Foram selecionados 4.743 genes do Centro Nacional de Informação Biotecnológica (NCBI), sendo 706 genes de MexA, 551 MexB, 544 OprM, e 287 MexR. Foram identificados ao todo 1053 mutações, dessas 243 foram de tipos diferentes, onde 20 foram encontradas em MexA, 115 em MexB, 50 em OprM e 58 de MexR dentre essas mutações obtivemos:81 pertencestes ao grupo A, 48 ao Grupo B, 114 ao grupo C, e 1577 no grupo D. Os genes que apesentaram mutações foram selecionados para a construção dos modelos tridimensionais das proteínas utilizando o ModWEB. Os modelos gerados foram submetidos a validação no PROCHECK, todos os modelos que alcançaram similaridade maior que 90% seguiram para as analises subsequentes.A pesquisa de mutações do sistema de efluxo MexAB-OprM nos genomas de Pseudomonas aeruginosa triados do Genbank evidencia que essa bactéria, tem alta capacidade mutacional, sendo o regular MexR o principal afetado, assim induzindo a hiperexpressão desse sistema, estudos adicionais são recomendados para verificar o impacto direto dessas mutações no fenótipo de resistência dessas bactérias.