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AMPLIFICAÇÃO DE ÁCIDOS NUCLEICOS PELA TÉCNICA DE LAMP COMO ALTERNATIVA PARA O DIAGNÓSTICO DE LEISHMANIOSES E COVID-19
leishmanioses
COVID-19
diagnóstico molecular
qRT-PCR
point-of-care
SARS-CoV-2
molecular diagnosis
LAMP
eishmaniases
qRT-PCR
SARS-CoV-2
point-of-care
Oliveira, Ellen Gonçalves | Fecha del documento:
2023
Director
Co-director
Miembros de la junta
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Resumen en portugues
A qRT-PCR é a técnica utilizada como padrão ouro para diagnóstico de COVID-19 e também é considerada um método sensível para diagnóstico das leishmanioses. Entretanto, seu custo elevado e necessidade de mão de obra qualificada limitam e inviabilizam sua aplicação em larga escala ou em campo. Sabe-se que a evolução de ambas as doenças depende da resposta imunológica do indivíduo que, aliada à dificuldade de acesso da população aos testes diagnósticos, resulta na subnotificação do número de casos, dificultando seu controle pelos órgãos de saúde pública. Até o início de outubro mais de 1 milhão de mortes por COVID-19 foram registrados e mais de 1 bilhão de pessoas estão sob risco de infecção por Leishmania. Diante disto, a técnica de amplificação isotérmica mediada por alça (LAMP) se mostra uma alternativa promissora para auxílio do diagnóstico destas doenças por ser de fácil execução, rápida e de baixo custo, sendo ideal sua aplicação no formato point-of-care (PoC). Os resultados obtidos neste trabalho mostraram, pela primeira vez, a identificação concomitante por LAMP das espécies de Leishmania infantum e L. braziliensis em amostras clínicas de cães com leishmaniose visceral (LV) e humanos com leishmaniose cutânea (LC), apresentando sensibilidades iguais a 88% e 58%, respectivamente. Além disso, a detecção do gene N de SARS-CoV-2 em swab nasofaríngeo apresentou até 97% de sensibilidade e 100% de especificidade, sendo possível mesmo quando não há extração de material genético, com ausência de reação cruzada com outros vírus respiratórios. Por se apresentar altamente específica, com sensibilidade satisfatória, ser rápida e de fácil execução, a viabilidade da aplicação da técnica em locais remotos e podem agilizar o processo de triagem de amostras clínicas. Tais características podem complementar e suprir as limitações da utilização da q-PCR no diagnóstico, mostrando-se como uma ferramenta promissora no auxílio de rastreamento e controle destas doenças.
Resumen en ingles
The qRT-PCR technique is used as gold standard method for diagnosing COVID-19 and is also considered a sensitive method for leishmaniasis diagnosis. However, its high cost and the need for qualified professionals limit its application on a large scale or in the field. It is known that the evolution of both diseases depends on the individual's immune response, which, together with the population's difficulty in accessing diagnostic tests, results in the underreporting of the number of cases, making it difficult to control for public health agencies. As of the beginning of October, more than 1 million COVID-19 deaths have been recorded and more than 1 billion people are at risk of Leishmania infection. Thus, loop-mediated isothermal amplification technique (LAMP) is a promising alternative to aid because of its easy-to-perform, fast and low-cost diagnosis, and its application as a point-of-care platform (PoC) is ideal. Results obtained in this work showed, for the first time, a concomitant identification by LAMP of Leishmania infantum and L. braziliensis species in dog clinics with visceral leishmaniasis (LV) and humans with cutaneous leishmaniasis (LC), with sensitivities varying to 88% and 58%, respectively. In addition, a detection of SARS-CoV-2 N gene in a nasopharyngeal swab presents up to 97% sensitivity and 100% specificity, being possible on free RNA extraction, with no cross reaction with other human respiratory viruses. Because of its high specificity, satisfactory sensitivity, being quick and easy to perform, can be applied in remote locations and streamline the screening trials process of clinical samples. Such characteristics can complement and supply as limitations of the use of q-PCR in the diagnosis, showing itself as a promising tool to help tracking and control of these diseases.
Palabras clave en portugues
LAMPleishmanioses
COVID-19
diagnóstico molecular
qRT-PCR
point-of-care
SARS-CoV-2
Palabras clave en ingles
COVID-19molecular diagnosis
LAMP
eishmaniases
qRT-PCR
SARS-CoV-2
point-of-care
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