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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66289
A COMPARATIVE ANALYSIS OF INNATE IMMUNE RESPONSES AND THE STRUCTURAL CHARACTERIZATION OF SPIKE FROM SARS-COV-2 GAMMA VARIANTS AND SUBVARIANTS
Produção científica do Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo (vigente até jan/2023).
Author
Scovino, Aline Miranda
Dahab, Elizabeth Chen
Lima, Israel Diniz
Silveira, Etiele de Senna
Barroso, Shana Priscila Coutinho
Cardoso, Karina Martins
Nico, Dirlei
Makhoul, Gustavo José
Silva Junior, Elias Barbosa da
Lima, Célio Geraldo Freire de
Freire-de-Lima, Leonardo
Fonseca, Leonardo Marques da
Valente, Natalia
Nacife, Valeria
Machado, Ana
Araújo, Mia
Vieira, Gustavo Fioravanti
Pauvolid-Corrêa, Alex
Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de
Lima, Alexandre Morrot
Dahab, Elizabeth Chen
Lima, Israel Diniz
Silveira, Etiele de Senna
Barroso, Shana Priscila Coutinho
Cardoso, Karina Martins
Nico, Dirlei
Makhoul, Gustavo José
Silva Junior, Elias Barbosa da
Lima, Célio Geraldo Freire de
Freire-de-Lima, Leonardo
Fonseca, Leonardo Marques da
Valente, Natalia
Nacife, Valeria
Machado, Ana
Araújo, Mia
Vieira, Gustavo Fioravanti
Pauvolid-Corrêa, Alex
Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de
Lima, Alexandre Morrot
Affilliation
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Biociências. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil.
Marinha do Brasil. Hospital Naval Marcílio Dias. Instituto de Pesquisa Biomédica. Laboratório de Biologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Marinha do Brasil. Hospital Naval Marcílio Dias. Instituto de Pesquisa Biomédica. Laboratório de Biologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Castelo Branco. Curso de Medicina. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Biociências. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade La Salle. Programa de Pós-Graduação em Saúde e Desenvolvimento Humano. Canoas, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Texas A&M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences. Texas, USA / Universidade Federal de Viçosa. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Departamento de Veterinária. Laboratório de Virologia Veterinária de Viçosa. Viçosa, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Biociências. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil.
Marinha do Brasil. Hospital Naval Marcílio Dias. Instituto de Pesquisa Biomédica. Laboratório de Biologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Marinha do Brasil. Hospital Naval Marcílio Dias. Instituto de Pesquisa Biomédica. Laboratório de Biologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Castelo Branco. Curso de Medicina. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Biociências. Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brasil / Universidade La Salle. Programa de Pós-Graduação em Saúde e Desenvolvimento Humano. Canoas, RS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Texas A&M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences. Texas, USA / Universidade Federal de Viçosa. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Departamento de Veterinária. Laboratório de Virologia Veterinária de Viçosa. Viçosa, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Imunoparasitologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Faculdade de Medicina. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
The SARS-CoV-2 P.1 variant, responsible for an outbreak in Manaus, Brazil, is distinguished by 12 amino acid differences in the S protein, potentially increasing its ACE-2 affinity and immune evasion capability. We investigated the innate immune response of this variant compared to the original B.1 strain, particularly concerning cytokine production. Blood samples from three severe COVID-19 patients were analyzed post-infection with both strains. Results showed no significant difference in cytokine production of mononuclear cells and neutrophils for either variant. While B.1 had higher cytopathogenicity, neither showed viral replication in mononuclear cells. Structural analyses of the S protein highlighted physicochemical variations, which might be linked to the differences in infectivity between the strains. Our studies point out to the increased infectivity of P.1 could stem from altered immunogenicity and receptor-binding affinity.
Publisher
MDPI
Citation
SCOVINO, Aline Miranda et al. A comparative analysis of innate immune responses and the structural characterization of spike from SARS-CoV-2 gamma variants and subvariants. Microorganisms, v. 12, n. 4, p. 1-19, 2 Apr. 2024.DOI
10.3390/microorganisms12040720ISSN
2076-2607Notes
Produção científica do Laboratório de Imunoparasitologia.Produção científica do Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo (vigente até jan/2023).
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