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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66893
DETECTION OF TUBERCULOSIS DRUG RESISTANCE: A COMPARISON BY MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS MLPA ASSAY VERSUS GENOTYPE®MTBDRPLUS
MLPA
GenoType MTBDRplus
resistência à isoniazida
resistência à rifampicina
resistência a múltiplos fármacos
MLPA
GenoType MTBDRplus
isoniazid resistance
rifampicin resistance
multidrug resistance
Author
Dos Santos, Paula Fernanda Gonçalves
Costa, Elis Regina Dalla
Ramalho, Daniela M.
Rossetti, Maria Lucia
Barcellos, Regina Bones
Nunes, Luciana De Souza
Esteves, Leonardo Souza
Rodenbusch, Rodrigo
Anthony, Richard M.
Bergval, Indra
Sengstake, Sarah
Viveiros, Miguel
Kritski, Afrânio
Oliveira, Martha M.
Costa, Elis Regina Dalla
Ramalho, Daniela M.
Rossetti, Maria Lucia
Barcellos, Regina Bones
Nunes, Luciana De Souza
Esteves, Leonardo Souza
Rodenbusch, Rodrigo
Anthony, Richard M.
Bergval, Indra
Sengstake, Sarah
Viveiros, Miguel
Kritski, Afrânio
Oliveira, Martha M.
Affilliation
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil / Universidade Luterana do Brasil, Porto Alegre, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil / Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Centro de Biotecnologia, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Porto Alegre, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil
Royal Tropical Institute, KIT Biomedical Research, Amsterdam, Netherlands
Royal Tropical Institute, KIT Biomedical Research, Amsterdam, Netherlands
Royal Tropical Institute, KIT Biomedical Research, Amsterdam, Netherlands
Universidade Nova de Lisboa, Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Unidade de Microbiologia Médica, Global Health and Tropical Medicine, Lisboa, Portugal
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil / Universidade Luterana do Brasil, Porto Alegre, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil / Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Centro de Biotecnologia, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Porto Alegre, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil
Fundação Estadual de Produção e Pesquisa em Saúde, Centro de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, Porto Alegre, Brazil
Royal Tropical Institute, KIT Biomedical Research, Amsterdam, Netherlands
Royal Tropical Institute, KIT Biomedical Research, Amsterdam, Netherlands
Royal Tropical Institute, KIT Biomedical Research, Amsterdam, Netherlands
Universidade Nova de Lisboa, Instituto de Higiene e Medicina Tropical, Unidade de Microbiologia Médica, Global Health and Tropical Medicine, Lisboa, Portugal
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro, Faculdade de Medicina, Programa Acadêmico de Tuberculose, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica, Rio de Janeiro, Brazil / Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose, Rio de Janeiro, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
CONTEXTO: Para lidar com o surgimento da tuberculose multirresistente (MDR-TB), novos métodos moleculares que podem ser usados rotineiramente para rastrear uma ampla gama de marcadores genéticos relacionados à resistência a medicamentos no genoma do Mycobacterium tuberculosis são urgentemente necessários.
OBJETIVO: Avaliar o desempenho da amplificação de sonda dependente de ligaton multiplex (MLPA) contra Genotype® MTBDRplus para detectar resistência à isoniazida (INHr) e rifampicina (RIFr).
MÉTODO: 96 isolados de cultura caracterizados para identificação, teste de suscetibilidade a medicamentos (DST) e sequenciamento dos genes rpoB, katG e inhA foram avaliados pelos ensaios MLPA e Genotype®MTBDRplus.
RESULTADOS: Com o sequenciamento como padrão de referência, a sensibilidade (SE) para detectar INHr foi de 92,8% e 85,7%, e a especificidade (SP) foi de 100% e 97,5%, para MLPA e Genotype®MTBDRplus, respectivamente. Em relação ao RIFr, SE foi de 87,5% e 100%, e SP foi de 100% e 98,8%, respectivamente. O valor de Kappa foi idêntico entre Genotype®MTBDRplus e MLPA em comparação com o DST padrão e sequenciamento para detecção de INHr [0,83 (0,75-0,91)] e RIFr [0,93 (0,88-0,98)].
CONCLUSÃO: Comparado ao Genotype®MTBDRplus, MLPA mostrou sensibilidade semelhante para detectar resistência a INH e RIF. Os resultados obtidos pelos ensaios MLPA e Genotype®MTBDRplus indicam que ambos os testes moleculares podem ser usados para a detecção rápida de TB resistente a medicamentos com alta precisão. O MLPA tem o valor agregado de fornecer informações sobre as linhagens circulantes de M. tuberculosis.
Abstract
BACKGROUND: To cope with the emergence of multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB), new molecular methods that can routinely be used to screen for a wide range of drug resistance related genetic markers in the Mycobacterium tuberculosis genome are urgently needed.
OBJECTIVE: To evaluate the performance of multiplex ligaton-dependent probe amplification (MLPA) against Genotype® MTBDRplus to detect resistance to isoniazid (INHr) and rifampicin (RIFr).
METHOD: 96 culture isolates characterised for identification, drug susceptibility testing (DST) and sequencing of rpoB, katG, and inhA genes were evaluated by the MLPA and Genotype®MTBDRplus assays.
RESULTS: With sequencing as a reference standard, sensitivity (SE) to detect INHr was 92.8% and 85.7%, and specificity (SP) was 100% and 97.5%, for MLPA and Genotype®MTBDRplus, respectively. In relation to RIFr, SE was 87.5% and 100%, and SP was 100% and 98.8%, respectively. Kappa value was identical between Genotype®MTBDRplus and MLPA compared with the standard DST and sequencing for detection of INHr [0.83 (0.75-0.91)] and RIFr [0.93 (0.88-0.98)].
CONCLUSION: Compared to Genotype®MTBDRplus, MLPA showed similar sensitivity to detect INH and RIF resistance. The results obtained by the MLPA and Genotype®MTBDRplus assays indicate that both molecular tests can be used for the rapid detection of drug-resistant TB with high accuracy. MLPA has the added value of providing information on the circulating M. tuberculosis lineages.
Keywords in Portuguese
tuberculoseMLPA
GenoType MTBDRplus
resistência à isoniazida
resistência à rifampicina
resistência a múltiplos fármacos
Keywords
tuberculosisMLPA
GenoType MTBDRplus
isoniazid resistance
rifampicin resistance
multidrug resistance
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