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Title: Caracterização genômica de poliovírus derivado da vacina isolada a partir de amostras ambientais
Other Titles: Genomic characterization of vaccine-derived poliovirus from the environment
Advisor: Silva, Edson Elias da
Members of the board: Arentz, Luz Alba Maria Garcete Fornells
Silva, Edson Elias da
Marin, Victor Augustus
Authors: Gregio, Catia Regina Valério
Affilliation: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract: Cinco cepas P1/Sabin, 20 cepas P2/Sabin e 2 cepas P3/Sabin isolados a partir de amostras do meio ambiente no Brasil foram analisadas. Neste estudo todos os isolados foram caracterizadas pelo seqüenciamento parcial da região 5 não codificante (NCR) e pelo seqüenciamento completo do gene da proteína VP1, com o objetivo de demonstrar mutações, as quais são importantes para a reversão à neurovirulência. O seqüenciamento parcial da região 5'NCR revelou que todos os poliovírus isolados do sorotipo 1 apresentaram populações de revertentes G480 ->A e os 2 isolados do sorotipo 3 apresentaram a reversão U472 ->C. Nenhum isolado do sorotipo 2 apresentou mutação A481 ->G. O completo seqüenciamento da região de VP1 demonstrou que nenhum isolado P1/Sabin apresentou substituição nucleotídica, as 2 cepas P3/Sabin apresentaram VP1-6 (Thr ->Iso) e 16 cepas P2/Sabin apresentaram VP1-109 (Lys ->Arg). O isolado P2/26183 também apresentou mutações VP1-103 (Ser ->Lys) e VP1-116 (Val ->Gly), enquanto P2/26184 apresentou VP1-155 (Cys ->Tyr). As regiões 2C e 3D do genoma foram investigadas pelo uso de primers que hibridizam nestas áreas com o objetivo de verificar a presença de recombinação. Nenhuma cepa envolvida no estudo foi identificada como recombinante. Nenhum poliovírus derivado da vacina foi detectado.
Abstract: Five strains of P1/Sabin, 20 strains of P2/Sabin and 2 strains of P3/Sabin isolated from environmental samples in Brazil were analyzed. In this study all isolates were characterized by partial genomic sequencing of the 5’ noncoding region (NCR) and the complete VP1 protein gene VP1, with the objective of finding mutations, which are important for neurovirulence reversion. Partial sequencing of 5’NCR revealed that all type 1 poliovirus isolates had the G→A substitution at the nt 480 and the 2 type 3 poliovirus isolates had the U→C substitution at the nt 472. None type 2 isolate had A→G substitution 481. The complete sequencing of the VP1 region showed that none P1/Sabin strain had nucleotide substitution, the 2 P3/Sabin strain had VP1"6 (Thr→Iso) and 16 P2/Sabin strain had VP1"109 (Lys→Arg). The isolate P2/26183 also presented mutations VP1"103 (Ser→Lys) and VP1"116 (Val→Gly), while P2/26184 showed VP1"155 (Cys→Tyr). The 2C and 3D regions of the viral genome were investigated by the use of primers that hybridize in these areas with the objective to verify the presence of recombination. None of the strain involved in this study was identified as recombinant. None vaccine derived poliovirus was detected.
keywords: Seqüenciamento nucleotídico
RT-PCR
Vacina Sabin
DeCS: Vacina Antipólio Oral
Poliovirus
Reação em Cadeia da Polimerasa Via Transcriptase Reversa
Vigilância Sanitária
Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real
Issue Date: 2006
Citation: GREGIO, C. R. V. Caracterização genômica de poliovírus derivado da vacina isolada a partir de amostras ambientais. 2006. 141 f. Tese (Doutorado em Vigilância Sanitária)- Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2006.
Date of defense: 2006-12-15
Place of defense: Rio de Janeiro/RJ
Defense institution: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde
Program: Programa de Pós-Graduação em Vigilância Sanitária
Copyright: open access
Appears in Collections:INCQS - Teses de Doutorado

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