Author | Motta, Maria Cristina Machado | |
Author | Martins, Allan Cezar de Azevedo | |
Author | Souza, Silvana Sant’Anna de | |
Author | Catta-Preta, Carolina Moura Costa | |
Author | Silva, Rosane | |
Author | Klein, Cecilia Coimbra | |
Author | Almeida, Luiz Gonzaga Paula de | |
Author | Cunha, Oberdan de Lima | |
Author | Ciapina, Luciane Prioli | |
Author | Brocchi, Marcelo | |
Author | Colabardini, Ana Cristina | |
Author | Lima, Bruna de Araujo | |
Author | Machado, Carlos Renato | |
Author | Soares, Celia Maria de Almeida | |
Author | Probst, Christian Macagnan | |
Author | Menezes, Claudia Beatriz Afonso de | |
Author | Thompson, Claudia Elizabeth | |
Author | Bartholomeu, Daniella Castanheira | |
Author | Gradia, Daniela Fiori | |
Author | Pavoni, Daniela Parada | |
Author | Grisard, Edmundo C. | |
Author | Fantinatti-Garboggini, Fabiana | |
Author | Marchini, Fabrício Klerynton | |
Author | Rodrigues-Luiz, Gabriela Flavia | |
Author | Wagner, Glauber | |
Author | Goldman, Gustavo Henrique | |
Author | Fietto, Juliana Lopes Rangel | |
Author | Elias, Maria Carolina | |
Author | Goldman, Maria Helena S. | |
Author | Sagot, Marie-France | |
Author | Pereira, Maristela | |
Author | Stoco, Patrıcia H. | |
Author | Mendonça-Neto, Rondon Pessoa de | |
Author | Teixeira, Santuza Maria Ribeiro | |
Author | Maciel, Talles Eduardo Ferreira | |
Author | Mendes, Tiago Antonio de Oliveira | |
Author | Urmenyi, Turan P. | |
Author | Souza, Wanderley de | |
Author | Schenkman, Sergio | |
Author | Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro de | |
Access date | 2016-09-22T19:12:42Z | |
Available date | 2016-09-22T19:12:42Z | |
Document date | 2013 | |
Citation | Motta, Maria Cristina Machado et al. Predicting the Predicting the Proteins of Angomonas deanei, Strigomonas culicis and their respective endosymbionts reveals new aspects of the Trypanosomatidae Family. PLoS ONE, v. 8, n. 4, p. 1-20, 2013. | pt_BR |
ISSN | 1932-6203 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/15925 | |
Sponsorship | Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ), Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). | pt_BR |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | Iratxe Puebla | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Title | Predicting the Proteins of Angomonas deanei, Strigomonas culicis and their respective endosymbionts reveals new aspects of the Trypanosomatidae Family | pt_BR |
Type | Article | pt_BR |
DOI | 10.1371/journal.pone.0060209 | pt_BR |
Abstract | Endosymbiont-bearing trypanosomatids have been considered excellent models for the study of cell evolution because the host protozoan co-evolves with an intracellular bacterium in a mutualistic relationship. Such protozoa inhabit a single invertebrate host during their entire life cycle and exhibit special characteristics that group them in a particular phylogenetic cluster of the Trypanosomatidae family, thus classified as monoxenics. In an effort to better understand such symbiotic association, we used DNA pyrosequencing and a reference-guided assembly to generate reads that predicted 16,960 and 12,162 open reading frames (ORFs) in two symbiont-bearing trypanosomatids, Angomonas deanei (previously named as Crithidia deanei) and Strigomonas culicis (first known as Blastocrithidia culicis), respectively. Identification of each ORF was based primarily on TriTrypDB using tblastn, and each ORF was confirmed by employing getorf from EMBOSS and Newbler 2.6 when necessary. The monoxenic organisms revealed conserved housekeeping functions when compared to other trypanosomatids, especially compared with Leishmania major. However, major differences were found in ORFs corresponding to the cytoskeleton, the kinetoplast, and the paraflagellar structure. The monoxenic organisms also contain a large number of genes for cytosolic calpain-like and surface gp63 metalloproteases and a reduced number of compartmentalized cysteine proteases in comparison to other TriTryp organisms, reflecting adaptations to the presence of the symbiont. The assembled bacterial endosymbiont sequences exhibit a high A+T content with a total of 787 and 769 ORFs for the Angomonas deanei and Strigomonas culicis endosymbionts, respectively, and indicate that these organisms hold a common ancestor related to the Alcaligenaceae family. Importantly, both symbionts contain enzymes that complement essential host cell biosynthetic pathways, such as those for amino acid, lipid and purine/pyrimidine metabolism. These findings increase our understanding of the intricate symbiotic relationship between the bacterium and the trypanosomatid host and provide clues to better understand eukaryotic cell evolution. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Ultraestrutura Celular Hertha Meyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Ultraestrutura Celular Hertha Meyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Ultraestrutura Celular Hertha Meyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Metabolismo Macromolecular Firmino Torres de Castro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Ultraestrutura Celular Hertha Meyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Metabolismo Macromolecular Firmino Torres de Castro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil. / Centre de Recherche Inria Grenoble-Rhône-Alpes. Villeurbanne, France. / Université de Lyon. Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive. Villeurbanne, France. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia. Departamento de Genética, Evolução e Bioagentes. Campinas, SP, Brasil.l | pt_BR |
Affilliation | Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto. Departamento de Ciências Farmacêuticas. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia. Departamento de Genética, Evolução e Bioagentes. Campinas, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Goiás. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Biologia Molecular. Goiânia, GO, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Biologia Molecular de Tripanossomatídeos. Curitiba, PR, Brasil. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Genômica Funcional. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Estadual de Campinas. Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas. Campinas, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Biologia Molecular de Tripanossomatídeos. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Genômica Funcional. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Estadual de Campinas. Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas. Campinas, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Genômica Funcional. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto. Departamento de Ciências Farmacêuticas. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Viçosa. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular. Viçosa, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Instituto Butantan. Laboratório Especial de Ciclo Celular. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de São Paulo. Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto. Departamento de Biologia. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Centre de Recherche Inria Grenoble-Rhône-Alpes. Villeurbanne, France. / Université de Lyon. Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive. Villeurbanne, France. | Fr |
Affilliation | Universidade Federal de Goiás. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Biologia Molecular. Goiânia, GO, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Viçosa. Centro de Ciências Biológicas e da Saúde. Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular. Viçosa, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Parasitologia. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Metabolismo Macromolecular Firmino Torres de Castro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Ultraestrutura Celular Hertha Meyer. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de São Paulo. Escola Paulista de Medicina. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Subject | Endosymbiont-bearing trypanosomatids | pt_BR |
Subject | Trypanosomatidae | pt_BR |
Subject | Angomonas deanei | pt_BR |
Subject | Strigomonas culicis | pt_BR |
DeCS | Trypanosomatina | pt_BR |
DeCS | Células Eucarióticas | pt_BR |
DeCS | Simbiose | pt_BR |