Author | Avelar, Grace Santos Tavares | |
Author | Gonçalves, Leilane Oliveira | |
Author | Guimarães, Frederico Gonçalves | |
Author | Guimarães, Paul Anderson Souza | |
Author | Rocha, Luiz Gustavo do Nascimento | |
Author | Carvalho, Maria Gabriela Reis | |
Author | Resende, Daniela de Melo | |
Author | Ruiz, Jeronimo Conceição | |
Access date | 2020-10-07T14:47:02Z | |
Available date | 2020-10-07T14:47:02Z | |
Document date | 2020 | |
Citation | AVELAR, Grace Santos Tavares et al. Diversity and genome mapping assessment of disordered and functional domains in trypanosomatids. Journal of Proteomics, v. 227, 10391, 2020 | pt_BR |
ISSN | 1874-3919 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43856 | |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | Elsevier B.V. | pt_BR |
Rights | restricted access | pt_BR |
Title | Diversity and genome mapping assessment of disordered and functional domains in trypanosomatids | pt_BR |
Type | Article | pt_BR |
DOI | 10.1016/j.jprot.2020.103919 | |
Abstract | The proteins that have structural disorder exemplify a class of proteins which is part of a new frontier in structural biology that demands a new understanding of the paradigm of structure/function correlations. In order to address the location, relative distances and the functional/structural correlation between disordered and conserved domains, consensus disordered predictions were mapped together with CDD domains in Leishmania braziliensis M2904, Leishmania infantum JPCM5, Trypanosoma cruzi CL-Brener Esmeraldo-like, Trypanosoma cruzi Dm28c, Trypanosoma cruzi Sylvio X10, Blechomonas ayalai B08-376 and Paratrypanosoma confusum CUL13 predicted proteomes. Our results depicts the role of protein disorder in key aspects of parasites biology highlighting: a) statistical significant association between genome structural location of protein disordered consensus stretches and functional domains; b) that disordered protein stretches appear in greater percentage at upstream or downstream position of the predicted domain; c) a possible role of structural disorder in several gene expression, control points that includes but are not limited to: i) protein folding; ii) protein transport and degradation; and iii) protein modification. In addition, for values of protein with disorder content greater than 40%, a small percentage of protein binding sites in IDPs/IDRs, a higher hypothetical protein annotation frequency was observed than expected by chance and trypanosomatid multigene families linked with virulence are rich in protein with disorder content. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistema. Rio de Janeiro, RJ, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistema. Rio de Janeiro, RJ, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistema. Rio de Janeiro, RJ, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Programa de Pós-graduação em Ciências da Saúde. Belo Horizonte, MG, Brazil/Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brazil | pt_BR |
Subject | Structural disorder | pt_BR |
Subject | Trypanosomatids | pt_BR |
Subject | Functional domains | pt_BR |
Subject | Multigene | pt_BR |