Author | Gonzaga, Rosa Maria S | |
Author | Rodart, Itatiana Ferreira | |
Author | Reis, Mitermayer Galvão dos | |
Author | Ramalho Neto, Cícero Eduardo | |
Author | Silva, Denise Wanderlei | |
Access date | 2013-01-11T20:33:14Z | |
Available date | 2013-01-11T20:33:14Z | |
Document date | 2008 | |
Citation | GONZAGA, R. M. S. et al. Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 39, n.4, p. 644-647, dec. 2008. | pt_BR |
ISSN | 1517-8382 | |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6174 | |
Abstract in Portuguese | A frequência de genótipos do vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos anti-HCV no estado de Alagoas, Brasil, foi determinada através da RT-PCR aninhada da região 5'NCR seguida pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A RT-PCR aninhada utilizando primers genótipo-específicos da região core foi efetuada quando não foi possível determinar o genótipo pelo primeiro método. Níveis detectáveis de HCV-RNA estavam presentes em 115 (74,7 por cento) das 154 amostras de soro. O genótipo 1 foi o mais freqüente (77,4 por cento), contra 20,9 por cento do genótipo 3 e 0,8 por cento do genótipo 2. O subtipo 1b foi predominante (65,2 por cento), seguido pelos subtipos 1a (8,7 por cento) e 3a (6,1 por cento). Co-infecção (1a/3a) foi detectada em 0,8 por cento das amostras. Não foram encontradas diferenças significativas quanto à prevalência do genótipo 1 em relação ao que tem sido obtido de pacientes soropositivos anti-HCV de outras localidades do Brasil. Este é o primeiro relato da presença do genótipo 2 no estado. | pt_BR |
Language | eng | pt_BR |
Rights | open access | |
Title | Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil | pt_BR |
Type | Article | pt_BR |
Abstract | We determined the frequency of hepatitis C virus (HCV) genotypes in anti-HCV seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil, by means of nested-reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-nested-PCR) followed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of amplified fragments of the 5ïNCR. The nested-PCR with genotype-specific primers from the core region was carried out when detection was not possible by the first approach. Detectable HCV-RNA was present in 115 (74.7 percent) of 154 serum samples. Genotype 1 was the most frequent (77.4 percent), against 20.9 percent of genotype 3 and 0.8 percent of genotype 2. Subtype 1b was predominant (65.2 percent), followed by subtypes 1a (8.7 percent), and 3a (6.1 percent). Coinfection (1a/3a) was detected in 0.8 percent of the samples. Indeed, there was no significant differences in the prevalence of genotype 1 compared to what has been obtained from anti-HCV seropositive patients from other locations in Brazil. Here we report for the first time the genotype 2 in the state of Alagoas. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Alagoas. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Maceió, AL, Brasil | pt_BR |
Subject | Hepatitis C virus | pt_BR |
Subject | 5’NCR | pt_BR |
Subject | Core region | pt_BR |
Subject | RT-nested-PCR | pt_BR |
Subject | Genotypes | pt_BR |
DeCS | Viroses | pt_BR |
DeCS | Vírus da Hepatite | pt_BR |
DeCS | Genótipo | pt_BR |
DeCS | Frequência do Gene | pt_BR |
DeCS | Reação em Cadeia da Polimerase | pt_BR |
DeCS | Polimorfismo Genético | pt_BR |
DeCS | Hepacivirus/isolamento & purificação | pt_BR |
DeCS | Sorotipagem | pt_BR |
DeCS | Pacientes | pt_BR |
DeCS | Métodos | pt_BR |
DeCS | Técnicas | pt_BR |
DeCS | Procedimentos Clínicos | pt_BR |
DeCS | Humanos | pt_BR |
DeCS | In Vitro | pt_BR |
DeCS | Relatos de Casos | pt_BR |