Author | Teixeira, Marcus de Melo | |
Author | Almeida, Luiz Gonzaga Paula de | |
Author | Barreira, Paula Kubitschek | |
Author | Alves, Fernanda Lourenço | |
Author | Kioshima, Érika Seki | |
Author | Abadio, Ana Karina Rodrigues | |
Author | Fernandes, Larissa | |
Author | Derengowski, Lorena da Silveira | |
Author | Ferreira, Karen Spadari | |
Author | Souza, Rangel C. | |
Author | Ruiz, Jeronimo Conceição | |
Author | Andrade, Nathalia C. de | |
Author | Paes, Hugo C. | |
Author | Nicola, André M. | |
Author | Albuquerque, Patrícia | |
Author | Gerber, Alexandra L. | |
Author | Martins, Vicente de Paulo | |
Author | Peconick, Luísa Defranco Ferreira | |
Author | Viggiano Neto, Alan | |
Author | Chaucanez, Claudia B. | |
Author | Silva, Patrícia A. | |
Author | Cunha, Oberdan de Lima | |
Author | Oliveira, Fabiana F. M. de | |
Author | Santos, Tayná Cristina dos | |
Author | Barros, Amanda L. N. | |
Author | Soares, Marco Aurélio | |
Author | Oliveira, Luciana M. de | |
Author | Souza, Marjorie Mendes Marini e | |
Author | Villalobos-Duno, Héctor | |
Author | Cunha, Marcel Menezes Lyra da | |
Author | Hoog, Sybren de | |
Author | Silveira, José F. da | |
Author | Henrissat, Bernard | |
Author | Niño-Vega, Gustavo A. | |
Author | Cisalpino, Patrícia Silva | |
Author | Mora-Montes, Héctor M. | |
Author | Almeida, Sandro Rogerio de | |
Author | Stajich, Jason E. | |
Author | Bezerra, Leila Maria Lopes | |
Author | Vasconcelos, Ana Tereza Ribeiro | |
Author | Felipe, Maria Sueli Soares | |
Access date | 2015-03-02T13:13:51Z | |
Available date | 2015-03-02T13:13:51Z | |
Document date | 2014 | |
Citation | TEIXEIRA, Marcus de Melo et al. Comparative genomics of the major fungal agents of human and animal Sporotrichosis: Sporothrix schenckii and Sporothrix brasiliensis. BMC Genomics, v. 15, p. 1-22, 2014. | pt_BR |
ISSN | 1471-2164 | |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/9577 | |
Language | por | pt_BR |
Publisher | BioMed Central | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Title | Comparative genomics of the major fungal agents of human and animal Sporotrichosis: Sporothrix schenckii and Sporothrix brasiliensis | pt_BR |
Type | Article | pt_BR |
DOI | 10.1186/1471-2164-15-943 | |
Abstract | Background: The fungal genus Sporothrix includes at least four human pathogenic species. One of these species, S. brasiliensis, is the causal agent of a major ongoing zoonotic outbreak of sporotrichosis in Brazil. Elsewhere, sapronoses are caused by S. schenckii and S. globosa. The major aims on this comparative genomic study are: 1) to explore the presence of virulence factors in S. schenckii and S. brasiliensis; 2) to compare S. brasiliensis, which is cat-transmitted and infects both humans and cats with S. schenckii, mainly a human pathogen; 3) to compare these two species to other human pathogens (Onygenales) with similar thermo-dimorphic behavior and to other plant-associated Sordariomycetes.
Results: The genomes of S. schenckii and S. brasiliensis were pyrosequenced to 17x and 20x coverage comprising a total of 32.3 Mb and 33.2 Mb, respectively. Pair-wise genome alignments revealed that the two species are highly syntenic showing 97.5% average sequence identity. Phylogenomic analysis reveals that both species diverged about 3.8-4.9 MYA suggesting a recent event of speciation. Transposable elements comprise respectively 0.34% and 0.62% of the S. schenckii andS. brasiliensis genomes and expansions of Gypsy-like elements was observed reflecting the accumulation of repetitive elements in the S. brasiliensis genome. Mitochondrial genomic comparisons showed the presence of group-I intron encoding homing endonucleases (HE’s) exclusively in S. brasiliensis. Analysis of protein family expansions and contractions in theSporothrix lineage revealed expansion of LysM domain-containing proteins, small GTPases, PKS type1 and leucin-rich proteins. In contrast, a lack of polysaccharide lyase genes that are associated with decay of plants was observed when compared to other Sordariomycetes and dimorphic fungal pathogens, suggesting evolutionary adaptations from a plant pathogenic or saprobic to an animal pathogenic life style.
Conclusions: Comparative genomic data suggest a unique ecological shift in the Sporothrix lineage from plant-association to mammalian parasitism, which contributes to the understanding of how environmental interactions may shape fungal virulence. . Moreover, the striking differences found in comparison with other dimorphic fungi revealed that dimorphism in these close relatives of plant-associated Sordariomycetes is a case of convergent evolution, stressing the importance of this morphogenetic change in fungal pathogenesis. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Petrópolis, RJ, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Biologia Celular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Microbiologia. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Estadual de Maringá. Departamento de Análises Clínicas. Maringá, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Programa de Pós-Graduação em Ciências e Tecnologias em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de São Paulo. Instituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas René Rachou. Grupo Informática de Biossistemas. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Biologia Celular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Católica de Brasília. Pós-Graduação em Ciências Genômicas e Biotecnologia. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brazil | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Microbiologia. Belo Horizonte, MG, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Programa de pós-graduação em Bioinformática. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de São Paulo. Departamento de Microbiologia Imunobiologia e Parasitologia. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Instituto Venezolano de Investigaciones Cientificas. Centro de Microbiología y Biología Celular. Caracas, Venezuela. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Biologia Celular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | CBS-KNAW Fungal Biodiversity Centre. Utrecht, The Netherlands. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de São Paulo. Departamento de Microbiologia Imunobiologia e Parasitologia. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Aix-Marseille Université. Centre National de la Recherche Scientifique. CNRS, Marseille, France. | pt_BR |
Affilliation | Instituto Venezolano de Investigaciones Cientificas. Centro de Microbiología y Biología Celular. Caracas, Venezuela. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia.Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidad de Guanajuato. Departamento de Biología. Guanajuato, Mexico. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de São Paulo. Departamento de Análises Clínicas e Toxicológicas. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | University of California. Department of Plant Pathology & Microbiology. Riverside, CA, USA. | pt_BR |
Affilliation | Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia Roberto Alcântara Gomes. Departamento de Biologia Celular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Nacional de Computação Científica. Petrópolis, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de Brasília. Programa de pós-graduação em Medicina Tropical. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Subject | Sporothrix schenckii | pt_BR |
Subject | Sporothrix brasiliensis | pt_BR |
Subject | Comparative genomics | pt_BR |
Subject | Fungal evolution | pt_BR |