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LEPTOSPIRA INTERROGANS SOROVAR COPENHAGENI E ICTEROHAEMORRHAGIAE: RELAÇÃO EVOLUTIVA, DIFERENÇAS GENÉTICAS E ASSOCIAÇÃO COM DESFECHO CLÍNICO
Santos, Luciane Amorim | Fecha del documento:
2015
Autor
Director
Co-director
Miembros de la junta
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Resumen en portugues
A leptospirose é a zoonose mais disseminada mundialmente por infectar diversas espécies
diferentes de animais mamíferos. Apresenta 22 espécies identificadas, sendo dez patogênicas,
cinco intermediarias e sete saprofiticas, além de apresentar mais de 250 sorovares diferentes. Em
Salvador, Leptospira interrogans sorovar Copenhageni é a causadora da epidemia urbana na
cidade e apresenta ratos como seu hospedeiro reservatório. As formas clínicas da leptospirose
podem variar de assintomática a formas graves. As manifestações clínicas mais graves envolve o
desenvolvimento da síndrome Hemorrágica pulmonar severa, e óbito do paciente. Estudos para
entender as diferenças genéticas entre as diferentes espécies e sorovares é de extrema importância
para identificar fatores de virulência da bactéria, genes que possam está associado aos diferentes
formas clinicas, e sua capacidade de se adaptar aos diferentes ambientes. Neste trabalho foi
estudado o genoma de dois importantes serovares de L. interrogans, o sorovar Copenhageni e o
serovar Icterohaemorrhagiae, e suas diferenças genéticas e associação com dados clínicos e
epidemiológicos. Um total de 141 isolados tiveram seus genomas sequenciados. Foi construindo
e validado um pipeline para a o mapeamento e construção dos genomas e a identificação de SNPs
e Indels. Os resultados encontrados demostraram um alta similaridade entre os isolados dos dois
serovares, de diferentes regiões geográficas e isolados em anos diferentes. As sequências deste
estudo se mostram conservadas ao longo do tempo sem apresentar nenhuma mutação associada
as diferentes forma clínicas da doença, indicando que outros fatores, tais como os do hospedeiro,
podem estar envolvidos na diversidade de sintomatologia. Na comparação do genoma dos
isolados de L. interrogans, sorovar Copenhageni e sorovar Icterohaemorrhagiae foi identificado
apenas uma mutação que as difere geneticamente. Essa mutação está presente no gene LIC12008
que produz uma proteína hipotética, e que a sua avaliação in silico demostrou estar envolvida na
síntese de LPS, justificando assim as diferenças encontradas no teste serológico. Além disto,
também foram avaliadas as diferenças entre 20 das 22 espécies de Leptospira, para identificar
possíveis fatores de virulência e genes que possam estar envolvidos na patogênese e adaptação da
bactéria ao ambiente. Estudos de fatores genéticos da Leptospira pode auxiliar ao manejo da
doença, com uma melhor assistência e terapia para os pacientes, desenvolvimento de vacinas e
diagnostico desta doença negligenciada.
Resumen en ingles
There are 22 different species of Leptospira spp. in which 10 are pathogenic, 5 intermediate and
7 saprophytic species. In Salvador the Leptospira interrogans sorovar Copenhageni is the main
serovar detected, responsible for the urban epidemics, and has rats as their main host. The clinical
manifestations of leptospirosis can vary from asymptomatic form to severe disease like
pulmonary hemorrhagic syndrome, and death. Studies to understand de genetic differences
among the species and serovars are of great importance to identify virulence factors, genes that
could be related to the different clinical manifestations and its capacity to adapt in different
environments. Here, the genome of two epidemiologically important serovar of the L.
interrogans, the serovar Copenhageni and serovar Icterohaemorrhagiae, and their genetic
differences and the association of these differences with epidemiological and clinical data were
studied. A total of 141 strains were genome sequenced. A pipeline for the genome mapping and
variant call were constructed and validated. The results showed a high similarity among the
strains from both serovars from different geographic locations and year of isolation. The
sequences from this study showed to be very conserved, not presenting any mutation associated
with the different clinical outcome, indicating that other factors, like host factors, could be related
to the diversity of clinical outcome. Only one genetic mutation was detected in the genome
comparison of the strains belonging to the L. interrogans sorovar Copenhageni and sorovar
Icterohaemorrhagiae. This mutation was found in the gene LIC12008 that produce a hypothetical
protein, in which its in silico analysis reviled that this protein could be related to the LPS
synthesis, justifying the serological test differences between the two serovar. Besides that, the
differences between 20 of the 22 species of Leptospira identified were evaluated to detect
possibly virulence factors and genes that could be involved in the pathogenesis and adaptation.
Studies of the Leptospira virulence factors can give support to the disease management, giving a
better assistance and treatment to the patients and developing vaccines and better diagnostic for
the neglected disease
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