Advisor | Oliveira, Rosely Maria Zancope | pt_BR |
Advisor | Muniz, Mauro de Medeiros | pt_BR |
Author | Silva, Fernando Almeida da | pt_BR |
Access date | 2018-03-07T14:17:56Z | |
Available date | 2018-03-07T14:17:56Z | |
Document date | 2015 | |
Citation | SILVA, Fernando Almeida da. Desempenho de métodos laboratoriais no diagnóstico de infecções fúngicas pulmonares em pacientes do Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. 2015. 112 f. Dissertação (Mestrado em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosas)-Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas, Rio de Janeiro, 2015. | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25115 | |
Abstract in Portuguese | Infecções pulmonares são geralmente comuns em hospedeiros imunocomprometidos. Entre as infecções pulmonares, pneumocistose, histoplasmose e criptococose são as mais importantes infecções fúngicas na população imunocomprometida, especialmente quando a contagem de células TCD4+ está abaixo de 200 células/m3. Pneumonias fúngicas podem ser fulminantes e o diagnóstico dessas infecções pode ser difícil. O diagnóstico definitivo necessita de evidências microbiológicas ou histopatológicas, mas em alguns fungos, a cultura é demorada e pode levar de 2 a 4 semanas para se obter um resultado positivo, atrasando a decisão clínica. No diagnóstico convencional, baseado no exame direto, cultura, histopatologia ou imunocitoquímica, estes fungos são frequentemente confundidos com outros microrganismos e o diagnóstico diferencial é necessário. Métodos moleculares podem oferecer uma contribuição muito importante para o diagnóstico porque os resultados são rápidos. O objetivo principal desse trabalho foi comparar o rendimento de métodos convencionais e métodos moleculares para diagnóstico, como cultura, imunofluorescência direta, imunocitoquímica, calcofluor, Grocott e nested PCR para detectar sequencia parcial específica de Histoplasma capsulatum e Pneumocystis jirovecii e qPCR Multiplex para detectar simultaneamente sequencias de P. jirovecii, H. capsulatum e Cryptococcus neoformans Foram analisadas 40 amostras respiratórias de indivíduos imunocomprometidos, como escarro induzido (n = 22), lavado traqueal (n = 10), lavado broncoalveolar (n = 5) e escarro espontâneo (n= 3). Comparando os resultados obtidos por essas diferentes metodologias, os métodos convencionais não se mostraram satisfatórios, não apresentando resultados positivos no calcofluor e na imunocitoquímica, somente dois resultados positivos para C. neoformans na cultura, duas amostras positivas para H. capsulatum na coloração pelo Grocott e seis amostras positivas para P. jirovecii na imunofluorescência direta. Utilizando a metodologia molecular qPCR multiplex, duas amostras foram positivas para C. neoformans, uma positiva para P. jirovecii e 11 para H. capsulatum. A nested PCR mostrou o melhor desempenho, detectando 12 amostras positivas para P. jirovecii e 28 positivas para H. capsulatum e demonstrou nove casos clínicos de coinfecção por esses fungos mostrando a importância do uso de diversas ferramentas diagnósticas para investigar a presença de possíveis agentes fúngicos. Os resultados do presente estudo foram similares aos descritos na literatura. A nested PCR foi o melhor método para detectar P. jirovecii nas amostras respiratórias e uma boa ferramenta para detectar H. capsulatum em espécimes clínicos humanos, assim como, apresentou alta sensibilidade quando comparada com métodos tradicionais | pt_BR |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | Pneumocystis Carinii | pt_BR |
Subject in Portuguese | Imunoensaio | pt_BR |
Subject in Portuguese | Diagnóstico | pt_BR |
Subject in Portuguese | Pneumonia | pt_BR |
Subject in Portuguese | Fungos | pt_BR |
Title | Desempenho de métodos laboratoriais no diagnóstico de infecções fúngicas pulmonares em pacientes do Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas | pt_BR |
Type | Dissertation | pt_BR |
Defense date | 2015 | pt_BR |
Departament | Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas | pt_BR |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | pt_BR |
Place of Defense | Rio de Janeiro | pt_BR |
Program | Programa de Pós-Graduação em Pesquisa Clínica em Doenças Infecciosas | pt_BR |
Abstract | Pulmonary infections are usually common in immunocompromised hosts. Among the pulmonary infections, pneumocystosis, histoplasmosis, and cryptococcosis are the most important fungal infections in the immunocompromised population, especially when the TCD4+ cells count are below 200 cells/m3. Fungal pneumonia can be fulminant and the diagnosis of these infections can be difficult. Definitive diagnosis requires histopathological or microbiological evidences, but in some fungi, the culture is time consuming and can take up to 2-4 weeks to yield a positive result, delaying the clinical decisions. In the conventional diagnosis, based on direct examination, culture, histopathology, or immunocytochemistry these fungi are frequently mislead with other microorganisms and the differential diagnosis is necessary. Molecular methods can offer a very important contribution to diagnosis because the results are faster. The main objective of this work was to compare the performance of conventional and molecular diagnostic methods, such as culture, direct immunofluorescence, immunocytochemistry, Calcofluor, Grocott, and nested PCR to detect partial specific sequence of Histoplasma capsulatum and Pneumocystis jirovecii and qPCR Multiplex to detect simultaneously sequences of P. jirovecii, H. capsulatum and Cryptococcus neoformans We analyzed 40 respiratory samples of immunocompromised individuals, such as induced sputum (n = 22), tracheal wash (n = 10), bronchoalveolar lavage (n = 5), and spontaneous sputum (n = 3). Comparing the results obtained by these different methodologies, the conventional methods were not satisfactory, yielding no positive results in calcofluor and immunocytochemistry, just two positive results for C. neorformans in culture, two samples positive for H. capsulatum in the Grocott staining, and six positive samples to P. jirovecii in direct immunofluorescence. Using the qPCR multiplex molecular methodology two samples was positive to C. neoformans, one positive to P. jirovecii and 11 positive to H. capsulatum. The nested PCR has shown the best performance detecting 12 samples positive for P. jirovecii and 28 positive for H. capsulatum and demonstrated nine clinical cases of co-infection with these fungi, showing the importance of using several diagnostic tools to investigate the presence of possible fungal agents. The results of the present study were similar to the described in the literature. The nested PCR has been the best method to detect of P. jirovecii in respiratory samples and a good tool to detect H. capsulatum in human clinical specimens as well, presenting higher sensitivity when compared with traditional diagnostic tests | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |