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AutorTavares, Raphael
AutorWajnberg, Gabriel
AutorScherer, Nicole de Miranda
AutorPauletti, Bianca Alves
AutorCassoli, Juliana S.
AutorFerreira, Carlos Gil
AutorLeme, Adriana Franco Paes
AutorSouza, Patricia Savio de Araujo
AutorSouza, Daniel Martins de
AutorPassetti, Fabio
Data de acesso2018-03-08T12:16:43Z
Data de disponibilização2018-03-08T12:16:43Z
Data do publicação2017
CitaçãoTAVARES, Raphael; et al. Unveiling alterative splice diversity from human oligodendrocyte proteome data. Journal of Proteomics, v.151, p.293-301, May 2017.pt_BR
ISSN1874-3919pt_BR
URIhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25182
Idiomaengpt_BR
EditorElsevierpt_BR
Direito Autoralrestricted access
Palavras-chaveBioinformáticapt_BR
Palavras-chaveProteogenômicapt_BR
Palavras-chaveProteômicapt_BR
Palavras-chaveOligodendrogliapt_BR
Palavras-chaveProcessamento Alternativopt_BR
TítuloUnveiling alterative splice diversity from human oligodendrocyte proteome datapt_BR
Tipo do documentoArticle
DOI10.1016/j.jprot.2016.05.023
Resumo em InglêsOligodendrocytes produce and maintain the myelin sheath of axons in the central nervous system. Because misassembled myelin sheaths have been associated with brain disorders such as multiple sclerosis and schizophrenia, recent advances have been made towards the description of the oligodendrocyte proteome. The identification of splice variants represented in the proteome is as important as determining the level of oligodendrocyte-associated proteins. Here, we used an oligodendrocyte proteome dataset deposited in ProteomeXchange to search against a customized protein sequence file containing computationally predicted splice variants. Our approach resulted in the identification of 39 splice variants, including one variant from the GTPase KRAS gene and another from the human glutaminase gene family. We also detected the mRNA expression of five selected splice variants and demonstrated that a fraction of these have their canonical proteins participating in direct protein-protein interactions. In conclusion, we believe our findings contribute to the molecular characterization of oligodendrocytes and may encourage other research groups working with central nervous system disorders to investigate the biological significance of these splice variants. The splice variants identified in this study may encode proteins that could be targeted in novel treatment strategies and diagnostic methods.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Instituto Nacional de Câncer. Coordenação de Pesquisa Clínica. Unidade de Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Instituto Nacional de Câncer. Coordenação de Pesquisa Clínica. Unidade de Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoInstituto Nacional de Câncer. Coordenação de Pesquisa Clínica. Unidade de Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoCentro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Laboratório Nacional de Biociências. Laboratório de Espectrometria de Massa. Campinas, SP, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoUniversiidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia. Departamento de Bioquímica e Biologia de Tecidos. Laboratório de Neuroproteômica. Campinas, SP, Brasil .pt_BR
AfiliaçãoInstituto Nacional de Câncer. Coordenação de Pesquisa Clínica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.pt_BR
Afiliaçãoentro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais. Laboratório Nacional de Biociências. Laboratório de Espectrometria de Massa. Campinas, SP, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoUniversidade Federal Fluminense. Departamento de Imunobiologia. Niterói, RJ,Brasil / Instituto Nacional de Câncer. Programa de Biologia Celular. Rio de Janeiro, RJ, Brasilpt_BR
AfiliaçãoUniversiidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia. Departamento de Bioquímica e Biologia de Tecidos. Laboratório de Neuroproteômica. Campinas, SP, Brasil .pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Instituto Nacional de Câncer. Coordenação de Pesquisa Clínica. Unidade de Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.pt_BR
Palavras-chave em inglêsAlternative splicingpt_BR
Palavras-chave em inglêsBioinformaticspt_BR
Palavras-chave em inglêsOligodendrocytespt_BR
Palavras-chave em inglêsProteogenomicspt_BR
Palavras-chave em inglêsProteomicspt_BR
e-ISSN1876-7737
Data de embargo2030-01-01


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Nome:
rafael_tavares_etal_IOC_2017.pdf
Tamanho:
1.419Mb
Formato:
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