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AutorMedeiros, Julliane Dutra
AutorRabelo, Leite Laura
AutorPylro, Victor Satler
AutorOliveira, Francislon Silva de
AutorAlmeida, Viviani Mendes de
AutorFernandes, Gabriel Rocha
AutorSalim, Anna Christina de Mattos
AutorAraújo, Flavio Marcos Gomes de
AutorVolpini, Angela Cristina
AutorOliveira, Guilherme Correa de
AutorCuadros-Orellana, Sara
Data de acesso2018-07-19T18:02:57Z
Data de disponibilização2018-07-19T18:02:57Z
Data do publicação2017
CitaçãoMEDEIROS, Julliane Dutra et al. Single-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp. in acid mine drainage. Mol Ecol., v. 26, n. 20, p. 5541-5551,2017pt_BR
ISSN0962-1083pt_BR
URIhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/27604
Idiomaengpt_BR
EditorBlackwell Scientific Publicationspt_BR
Direito Autoralrestricted accesspt_BR
Palavras-chaveSistemas CRISPR-Caspt_BR
Palavras-chaveHydrotalea sp.pt_BR
Palavras-chavedrenagem de mina ácidapt_BR
Palavras-chaveresistência de metalpt_BR
Palavras-chavegenômica unicelularpt_BR
TítuloSingle-cell sequencing unveils the lifestyle and CRISPR-based population history of Hydrotalea sp. in acid mine drainagept_BR
Tipo do documentoArticle
DOI10.1111/mec.14294
Resumo em InglêsAcid mine drainage (AMD) is characterized by an acid and metal-rich run-off that originates from mining systems. Despite having been studied for many decades, much remains unknown about the microbial community dynamics in AMD sites, especially during their early development, when the acidity is moderate. Here, we describe draft genome assemblies from single cells retrieved from an early-stage AMD sample. These cells belong to the genus Hydrotalea and are closely related to Hydrotalea flava. The phylogeny and average nucleotide identity analysis suggest that all single amplified genomes (SAGs) form two clades that may represent different strains. These cells have the genomic potential for denitrification, copper and other metal resistance. Two coexisting CRISPR-Cas loci were recovered across SAGs, and we observed heterogeneity in the population with regard to the spacer sequences, together with the loss of trailer-end spacers. Our results suggest that the genomes of Hydrotalea sp. strains studied here are adjusting to a quickly changing selective pressure at the microhabitat scale, and an important form of this selective pressure is infection by foreign DNA.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biologicas. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biologicas. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Universidade de São Paulo. Escola de Agricultura Luiz de Queiroz. Departamento de Ciencias do Solo. Piracicaba, SP, Brazil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biologicas. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biologicas. Belo Horizonte, MG, Brazil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazilpt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazilpt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazilpt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazilpt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Vale Instituto de Tecnologia. Desenvolvimento Sustentável. Belém, PA, Brazil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Informática de Biossistemas e Genomica de Grupos. Belo Horizonte, MG, Brazil/Universidad Católica del Maule. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales. Centro de Biotecnología de los Recursos Naturales. Talca, Chile.pt_BR
Palavras-chave em inglêsCRISPR-Cas systemspt_BR
Palavras-chave em inglêsHydrotalea sp.pt_BR
Palavras-chave em inglêsacid mine drainagept_BR
Palavras-chave em inglêsmetal resistancept_BR
Palavras-chave em inglêssingle-cell genomicspt_BR
Data de embargo2100-01-01


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Single-cell sequencing unveils ...
Tamanho:
346.1Kb
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