| Author | Nóbrega, Maria Soares | |
| Author | Silva, Bruno Sergio de Oliveira | |
| Author | Leomil, Luciana | |
| Author | Tschoeke, Diogo Antonio | |
| Author | Campeão, Mariana Esteves | |
| Author | Garcia, Gizele Duarte | |
| Author | Dias, Graciela Maria | |
| Author | Vieira, Verônica Viana | |
| Author | Thompson, Cristiane Carneiro | |
| Author | Thompson, Fabiano Lopes | |
| Access date | 2019-02-14T14:34:59Z | |
| Available date | 2019-02-14T14:34:59Z | |
| Document date | 2018 | |
| Citation | NÓBREGA, Maria Soares et al. Description of Alteromonas abrolhosensis sp. nov., isolated from sea water of Abrolhos Bank, Brazil. Antonie van Leeuwenhoek, v. 111, p. 1131-1138, 18 Jan. 2018. | |
| ISSN | 0003-6072 | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/31645 | |
| Description | Produção científica do Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. | pt_BR |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Springer | |
| Rights | restricted access | |
| Title | Description of Alteromonas abrolhosensis sp. nov., isolated from sea water of Abrolhos Bank, Brazil | en_US |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1007/s10482-018-1016-x | |
| Abstract | Two Gram-negative, motile, aerobic bacteria isolated from waters of the Abrolhos Bank were classified through a whole genome-based taxonomy. Strains PEL67Eᵀ and PEL68C shared 99% 16S rRNA and dnaK sequence identity with Alteromonas marina SW-47ᵀ and Alteromonas macleodii ATCC 27126ᵀ. In silico DNA–DNA Hybridization, i.e. genome-to-genome distance (GGD), average amino acid identity (AAI) and average nucleotide identity (ANI) showed that PEL67Eᵀ and PEL68C had identity values between 33–36, 86–88 and 83–84%, and 85–86 and 83%, respectively, towards their close neighbors A. macleodii ATCC 27126ᵀ and A. marina SW-47ᵀ. The DNA G + C contents of PEL67Eᵀ and PEL68C were 44.5%. The phenotypic features that differentiate PEL67Eᵀ and PEL68C strains from their close neighbors were assimilation of galactose and activity of phosphatase, and lack of mannitol, maltose, acetate, xylose and glycerol assimilation and lack of lipase, α and β-glucosidase activity. The new species Alteromonas abrolhosensis is proposed. The type strain is PEL67Eᵀ (= CBAS 610ᵀ = CAIM 1925ᵀ). | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Tecnologia. Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de Engenharia. Laboratório de Sistemas Avançados de Gestão da Produção. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade. Núcleo de Ecologia e Desenvolvimento Sócio-Ambiental de Macaé. Macaé, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Microbiologia Paulo de Góes. Macaé, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Laboratório de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Tecnologia. Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de Engenharia. Laboratório de Sistemas Avançados de Gestão da Produção. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Departamento de Biologia Marinha. Laboratório de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Subject | Alteromonas | en_US |
| Subject | Comparative genomics | en_US |
| Subject | Genomes | en_US |
| Subject | Genomic taxonomy | en_US |
| e-ISSN | 1572-9699 | |
| Embargo date | 2030-01-01 | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 14 Vida na água | |
