| Author | Lery, Leticia M. S. | |
| Author | Coelho, Ana | |
| Author | von Kruger, Wanda M. A. | |
| Author | Gonçalves, Mayla S. M. | |
| Author | Santos, Marise F. | |
| Author | Valente, Richard H. | |
| Author | Santos, Eidy O. | |
| Author | Rocha, Surza L. G. | |
| Author | Perales, Jonas | |
| Author | Domont, Gilberto B. | |
| Author | Teixeira, Katia R. S. | |
| Author | Bertalan, Marcelo | |
| Author | Ferreira, Paulo C. G. | |
| Author | Bisch, Paulo M. | |
| Access date | 2019-03-14T11:27:57Z | |
| Available date | 2019-03-14T11:27:57Z | |
| Document date | 2008 | |
| Citation | LERY, Leticia M. S. et al. Protein expression profile of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5, a sugarcane endophytic plant growth-promoting bacterium. Proteomics, v.8, p.1631-1644, 2008. | pt_BR |
| ISSN | 1615-9853 | pt_BR |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/32067 | |
| Language | eng | pt_BR |
| Publisher | Wiley 12 Months | pt_BR |
| Rights | restricted access | |
| Subject in Portuguese | Metabolismo bacteriano | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Cana de açúcar | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Agricultura sustentável | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Gluconacetobacter diazotrophicus | pt_BR |
| Title | Protein expression profile of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5, a sugarcane endophytic plant growth-promoting bacterium | pt_BR |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1002/pmic.200700912 | |
| Abstract | This is the first broad proteomic description of Gluconacetobacter diazotrophicus, an endophytic bacterium, responsible for the major fraction of the atmospheric nitrogen fixed in sugarcane in tropical regions. Proteomic coverage of G. diazotrophicus PAL5 was obtained by two independent approaches: 2-DE followed by MALDI-TOF or TOF-TOF MS and 1-DE followed by chromatography in a C18 column online coupled to an ESI-Q-TOF or ESI-IT mass spectrometer. The 583 identified proteins were sorted into functional categories and used to describe potential metabolic pathways for nucleotides, amino acids, carbohydrates, lipids, cofactors and energy production, according to the Enzyme Commission of Enzyme Nomenclature (EC) and Kyoto Encyclopedia of genes and genomes (KEGG) databases. The identification of such proteins and their possible insertion in conserved biochemical routes will allow comparisons between G. diazotrophicus and other bacterial species. Furthermore, the 88 proteins classified as conserved unknown or unknown constitute a potential target for functional genomic studies, aiming at the understanding of protein function and regulation of gene expression. The knowledge of metabolic fundamentals and coordination of these actions are crucial for the rational, safe and sustainable interference on crops. The entire dataset, including peptide sequence information, is available as Supporting Information and is the major contribution of this work. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Unidade Multidisciplinar de Genômica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Unidade Multidisciplinar de Genômica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Química. Departamento de Bioquímica. Laboratório de Química de Proteínas. Rio de Janeiro | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Fisiologia e Farmacodinâmica. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Fisiologia e Farmacodinâmica. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Fisiologia e Farmacodinâmica. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Departamento de Fisiologia e Farmacodinâmica. Laboratório de Toxinologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Embrapa Agrobiologia. Seropédica, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Rede Proteômica do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Unidade Multidisciplinar de Genômica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | pt_BR |
| Subject | Bacterial metabolism | pt_BR |
| Subject | Gluconacetobacter diazotrophicus | pt_BR |
| Subject | Sugarcane | pt_BR |
| Subject | Sustainable agriculture | pt_BR |
| e-ISSN | 1615-9861 | |
| Embargo date | 2022-01-01 | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 02 Fome zero e agricultura sustentável | |
