Caracterização fenotípica e genética de Escherichia coli de origem urinária resistente aos antibióticos, isolados em Quito, Equador

Abstract

Escherichia coli é o principal agente causador das infecções urinárias de origem comunitária e hospitalar, frequentemente associado à multirresistência antibiótica. O objetivo do presente estudo foi a caracterização genética de Escherichia coli uropatogênica com perfil de resistência fenotípica aos antibióticos betalactâmicos, fluoroquinolonas e aminoglicosídeos, procurando o clone pandêmicos ST131, em 156 amostras de origem comunitária e hospitalar isolados na cidade de Quito, Equador, no período janeiro a dezembro de 2011. O perfil de resistência foi determinado através de difusão em ágar, para a detecção fenotípica de \03B2-lactamases de espectro estendido (ESBLs) usando o método de disco de aproximação (Jarlier) em Ágar Muller Hinton e as recomendações do CLSI 2013, adicionando-se cefoxitina para detecção de \03B2-lactamases tipo AmpC. A detecção genotípica de resistência foi realizada através de PCR e sequenciamento, e a similaridade clonal por Multilcus Sequence Typing (MLST) e Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). Os resultados da resistência fenotípica foram, Amoxicilina/ácido clavulânico 32,6% (51/79), ampicilina 87,8% (137/156), aztreonam 14,7% (23/156), cefalotina 48,1%(75/156), cefoxitina 7,6%(12/156), cefepima 7,7% (12/156), cefotaxima 19,2% (30/156), ceftazidima 12,5% (20/156), ciprofloxacina 50,6% (79/156), gentamicina 21,7% (35/156), amicacina 5,7% (9/156), trimetoprim/sulfametoxazole 77,5% (121/156), salientando que todas as amostras foram 100% suscetíveis para ertapenem Enquanto à produção de ESBL, 22,4% (35/156) dos isolados foram produtores. Na análise genética, os genes ESBL caracterizados foram: blaCTX-M 60% (21/35) (dezessete CTX-M-15, três CTX-M-14 e um CTX-M-2), blaSHV 68.6% (2/35), blaTEM 37,1% (13/35) e blaAmpC 11,4% (4/35, variante CMY-2). Na resistência às fluoroquinolonas, os genes caracterizados foram aac(6´)-Ib-cr 54,4% (43/79) e o gene qnrB19 60,8% (48/79); e na resistência para os aminoglicosídeos, os genes encontrados foram aac(6`)-Ib 74,3% (29/39), aac(3´)-IIa 71,7% (28/39) e o gene ant(2´´)-Ia em 5,1% (2/39). Finalmente, a tipagem genotípica por PFGE demonstrou o grande polimorfismo genético nas cepas estudadas e, o MLST por Atchman identificou o clone ST131-B2 de E. coli produtor de CTX-M-15 em todos os ST43 identificados pelo Instituto Pasteur. Concluindo, este estudo demonstra o alto grau de resistência para os antibióticos de primera escolha no tratamento empírico das infecções do trato urinário, e a disseminação de genes de resistência e clones patogênicos como ST131-B2 E. coli nos ambientes comunitárias e hospitalares.