Advisor | Zahner, Viviane | |
Author | Carramaschi, Isabel Nogueira | |
Access date | 2020-01-27T11:52:23Z | |
Available date | 2020-01-27T11:52:23Z | |
Document date | 2019 | |
Citation | CARRAMASCHI, Isabel Nogueira. Dípteros muscoides como veiculadores de bactérias resistentes aos antimicrobianos. 2019. 184 f. Tese (Doutorado em Biodiversidade e Saúde) – Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2019. | |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/39512 | |
Abstract in Portuguese | Dípteros muscoides desempenham papel significante na disseminação de microrganismos. O principal objetivo deste estudo foi isolar bactérias resistentes aos antimicrobianos, a partir de dípteros muscoides, coletados em 5 pontos diferentes: no entorno e no lixo de um hospital municipal, na Zona Norte do Rio de Janeiro, assim como na Fiocruz e Quinta da Boa Vista, Rio de Janeiro. As moscas foram capturadas utilizando armadilhas de garrafa pet contendo isca atrativa, levadas ao Laboratório de Entomologioa Médica e Forense, IOC/Fiocruz, e identificadas utilizando chaves dicotômicas. Após esse procedimento foram maceradas em salina 0,85% estéril. Este extrato foi diluído e plaqueado em diferentes meios de cultura, contendo ou não antibiótico (ceftriaxona e polimixina, a 1 mg/L e 8 mg/L, respectivamente). Foram realizados o isolamento, a purificação das colônias e o teste de sensibilidade aos antimicrobianos (TSA) por disco difusão, utilizando os antibióticos cefepime, ceftazidima, cefoxitina, meropenem, gentamicina, tetraciclina e ciprofloxacina, cloranfenicol e trimetoprimsulfametoxazol (Sensifar). Foram realizadas 16 coletas, e um total de 197 isolados bacterianos foram obtidos a partir dos 117 dipteros muscoides. Os isolados foram identificados por sequenciamento parcial do gene 16S rRNA e por MALDITOF-MS (Brucker). Do total, 46 isolados apresentaram perfil de não sensibilidade (perfil resistente e intermediário) a pelo menos dois antimicrobianos diferentes, enquanto dez isolados foram classificados como multirresistentes. Análise de cluster feita pelo programa Statistica revelou diferença significativa entre o Ponto 5 e os demais pontos, quanto ao número de isolados não sensíveis. Setenta e três amostras foram submetidas para detecção de genes de resistência aos β-lactâmicos, aminoglicosídeos e colistina, através de PCR. Destas, apenas sete foram positivas. Três cepas de importância foram encontradas: Raoultella ornithinolytica positiva para o gene blaKPC˗₂, e para os principais elementos do transposon Tn4401, além dos grupos de incompatibilidade plasmideal IncK; Escherichia coli positiva para o gene blaNDM˗₁, Inc A/C, a partir da qual foram obtidas transconjugantes utilizando E. coli J53 como receptora e K. pneumoniae positiva para blaNDM˗₁ e grupo IncY. Todas as três cepas foram aac(6')-Ib e Int1 (integron de classe 1) positivas. O sequenciamento total da cepa 23 (K. pneumoniae ST 3997 blaNDM˗₁ positiva) revelou a presença de diversos genes de resistências. A não hibridização com sonda específica e não obtenção de transconjugantes sugerem a presença cromossomal de blaNDM˗₁. Através da técnica de PFGE, analisamos o perfil genético dos isolados de origem clínica (urinocultura e hemocultura) e os isolados obtidos a partir de mosca, pertencentes à espécie K. pneumoniae, porém não foi detectado o mesmo clone nos dois ambientes. Nesse sentido, destaca-se a importância das moscas na disseminação (e reservatórios) de bactérias resistentes aos antimicrobianos. | pt_BR |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | Dípteros Muscoides | pt_BR |
Subject in Portuguese | Antimicrobianos | pt_BR |
Subject in Portuguese | Genes de resistência aos antimicrobianos | pt_BR |
Title | Dípteros muscoides como veiculadores de bactérias resistentes aos antimicrobianos | pt_BR |
Type | Thesis | |
Defense date | 2019-09-30 | |
Departament | Instituto Oswaldo Cruz | |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | |
Degree level | Doutorado | |
Place of Defense | Rio de Janeiro/RJ | |
Program | Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Saúde | |
Co-Advisor | Rangel, Karyne | |
Abstract | Muscoid dipters play a significant role in the spread of microorganisms. The main objective of this study was to isolate antimicrobial-resistant bacteria from Diptera collected nearby and waste-free of a municipal hospital in the North Zone of Rio de Janeiro, as well as in Fiocruz and Quinta da Boa Vista in Rio de Janeiro. The flies were caught using bottle traps containing attractive bait, taken to the Laboratório de Entomologia Médica e Forense, IOC / Fiocruz, and identified using dichotomous keys. The flies were macerated in 0.85% saline. This extract was diluted and coated in different culture media, including or not antibiotic (ceftriaxone and polymyxin, 1mg/L and 8mg/L, respectively). After isolation and purification of the colonies, antimicrobial susceptibility testing (TSA) was performed with antibiotics cefepime, ceftazidime, cefoxitin, meropenem, gentamicin, tetracycline, ciprofloxacin, chloramphenicol and trimethoprim-sulfamethoxazole. 16 collections were done, and a total of 197 bacterial strains were obtained from 117 dipterous muscoids. Identification were performed by partial sequencing of the 16S rRNA gene and by MALDI TOF MS (Brucker). In total, 46 strains were identified as non-sensitiv for less than two different antimicrobials, while 10 were classified as multidrug resistant (MDR). Cluster analysis by the Statistics program revealed significant difference between Point 5 and the other collecting points. 73 strains were submitted for detection of β-lactam, aminoglycoside and colistin resistance genes by PCR. Of these, only 7 were positive. Three types of importance were found: Raoultella ornithinolytica positive for blaKPC˗₂, and for the major elements of the Tn4401 transposon, in addition to IncK plasmid incompatibility group; Escherichia coli positive for the blaNDM˗₁ gene, Inc A/C, from which transconjugants were obtained using E. coli J53 as receptors; and K. pneumoniae blaNDM˗₁ and IncY positive. All three were positive to aac(6')-Ib and INT1 (class 1 integration). Whole genome sequencing of strain 23 (K. pneumoniae ST 3997 blaNDM˗₁ positive) revealed the presence of several resistance genes. Non-hybridization with specific probe and no transconjugants suggests the chromosomal presence of blaNDM˗₁. Using the PFGE technique, we analyzed the genetic profile of clinical strains (urine culture and blood culture) and environmental strains (isolated from flies), to the species K. pneumoniae, but the samed clone was not detected in both environments. In this sense, we highlight the importance of flies in the dissemination (and reservoirs) of antimicrobial resistant bacteria. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Member of the board | Assef, Ana Paula D’Allincourt Carvalho | |
Member of the board | Souza, Claudia Rezende Vieira de Mendonça | |
Member of the board | D'Almeida, José Mario | |
Member of the board | Galvão, Teca Calcagno | |
Member of the board | Santos, Letícia Miranda Lery | |
DeCS | Dipteros | pt_BR |
DeCS | Anti-infecciosos | pt_BR |
DeCS | Vetores de Doenças | pt_BR |
DeCS | Bactérias | pt_BR |
DeCS | Farmacorresistência Bacteriana | pt_BR |