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AutorAraújo, Thessika Hialla Almeida
AutorBarreto, Fernanda Khouri
AutorMenezes, Aline Dórea Luz
AutorLima, Clayton Pereira Silva de
AutorOliveira, Rodrigo Santos de
AutorLemos, Poliana da Silva
AutorCastro, Bernardo Galvão
AutorKashima, Simone
AutorFarre, Lourdes
AutorBittencourt, Achilea Lisboa
AutorCarvalho, Edgar Marcelino de
AutorSantos, Luciane Amorim
AutorRego, Filipe Ferreira de Almeida
AutorMiranda, Aline Cristina Andrade Mota
AutorNunes, Márcio Roberto Teixeira
AutorAlcantara, Luiz Carlos Junior
Data de acesso2020-03-10T17:14:47Z
Data de disponibilização2020-03-10T17:14:47Z
Data do publicação2020
CitaçãoARAÚJO, Thessika Hiala Almeida et al. Complete genome sequence of human T-cell lymphotropic type 1 from patients with different clinical profiles, including infective dermatitis. Infection, Genetics and Evolution, v. 79, p. 1-7, 2020.pt_BR
ISSN1567-1348pt_BR
URIhttps://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/40279
Idiomaengpt_BR
EditorElsevierpt_BR
Direito Autoralrestricted access
Palavras-chaveHTLV-1pt_BR
Palavras-chaveGenoma completopt_BR
Palavras-chaveVariações de nucleotídeospt_BR
TítuloComplete genome sequence of human T-cell lymphotropic type 1 from patients with different clinical profiles, including infective dermatitispt_BR
Tipo do documentoArticle
DOI10.1016/j.meegid.2019.104166
Resumo em InglêsThe HTLV-1 is the first human retrovirus and is associated with several clinical syndromes, however, the pathogenesis of these clinical manifestations is still not fully understood. Furthermore, there are few complete genomes publicly available, about 0.12 complete genomes per 10,000 infected individuals and the databases have a major deficiency of sequences information. This study generated and characterized 31 HTLV-1 complete genomes sequences derived from individuals with Tropical Spastic Paraparesis/HTLV-1-Associated Myelopathy (TSP/HAM), Adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL), infective dermatitis associated to HTLV-1 (IDH) and asymptomatic patients. These sequences are associated to clinical and epidemiological information about the patients. The sequencing data generated on Ion Torrent PGM platform were assembled and mapped against the reference HTLV-1 genome. These sequences were genotyped as Cosmopolitan subtype, Transcontinental subgroup. We identified the variants in the coding regions of the genome of the different clinical profiles, however, no statistical relation was detected. This study contributed to increase of HTLV-1 complete genomes in the world. Furthermore, to better investigate the contribution of HTLV-1 mutations for the disease outcome it is necessary to evaluate the interaction of the viral genome and characteristics of the human host.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Muniz. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Muniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Muniz. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoInstituto Evando Chagas. Belém, PA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoInstituto Evando Chagas. Belém, PA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoInstituto Evando Chagas. Belém, PA. Brasil.pt_BR
AfiliaçãoEscola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Brasil / Bellvitge Biomedical Research Institute. Catalan Institute of Oncology. Barcelona, Spain.pt_BR
AfiliaçãoUniversidade Federal da Bahia. BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Muniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Muniz. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoUniversidade Católica do Salvador. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoUniversidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, Brasil.pt_BR
AfiliaçãoFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.pt_BR
Palavras-chave em inglêsHTLV-1pt_BR
Palavras-chave em inglêsComplete genomept_BR
Palavras-chave em inglêsNucleotide variationpt_BR
e-ISSN1567-7257
Data de embargo2025-01-01


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LuizCarlosJunior_FernandaBarre ...
Tamanho:
382.8Kb
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