Advisor | Reis, Mitermayer Galvão dos | |
Author | Morais, Luís da Conseição Martins | |
Access date | 2012-07-25T20:57:02Z | |
Available date | 2012-07-25T20:57:02Z | |
Document date | 2012 | |
Citation | MORAIS, L. da C. M. Epidemiologia molecular de Streptococcus pneumoniae sorotipos 1 e 5 isolados de doença invasiva em Moçambique. 2012. 100 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz, Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Salvador, 2012. | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/4244 | |
Abstract in Portuguese | Streptococcus pneumoniae é a principal causa de morbi-mortalidade no
mundo. Em Moçambique, os sorotipos 1 e 5 são os mais prevalentes. Este
estudo investigou a relação clonal de isolados de pneumococo obtidos de
doença invasiva entre o período de 2002-2007, utilizando três procedimentos
laboratoriais: Box-PCR, PFGE e MLST. Um total de 105 isolados (sendo 72 do
sorotipo 1 e 33 do sorotipo 5), foram submetidos a técnica de Box-PCR. O
sorotipo 5 apresentou cinco padrões, sendo um clonal com 20 isolados e quatro
padrões não clonais. O padrão A foi o predominante com 61% dos isolados,
enquanto que por PFGE, 100% dos isolados foram agrupados em um único
clone (clone A), e pela técnica de MLST foi identificado apenas um único ST (ST
289). Por outro lado, o sorotipo 1 apresentou maior diversidade clonal pelos três
métodos; por Box-PCR os isolados foram agrupados em 3 clones, sendo
predominante o padrão B com 58 isolados, padrão C e N com dois isolados
cada. Um total de 12 isolados foram não clonais. O clone B apresentou 20 subtipos,
sendo o mais frequente o sub-tipo B1 com 20 amostras idênticas, seguido
por B2, B6, B7 com 5 amostras idênticas cada. Por PFGE, 19 amostras
confirmaram ser do mesmo perfil clonal (clone B), enquanto que 12 amostras
demonstraram ser não clonais. Quando submetidos ao MLST, foram
identificados 6 STs; ST 217 (7 isolados), ST 853 (1 isolado), e quatro novos STs,
ST 4125, ST 2909, ST 3779 e ST 4166. O ST 217 pertence ao clone Suécia1-27
(ST217), identificados previamente em surtos de meningite na África, enquanto o
ST 289 foi identificado como um representante do clone Colômbia5-19 (ST289)
que circulam na América Latina desde 1994. A taxa de não susceptibilidade à
penicilina foi de 3%, e à cotrimoxazole foi de 39%. A maior taxa de resistência foi
encontrada entre os isolados de sorotipo 1. Este trabalho mostra a persistência
de dois sorotipos responsáveis por causar doença pneumocócica invasiva
graves, bem como seus respectivos clones em uma região do sul de
Moçambique. | pt_BR |
Language | eng | pt_BR |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | S. pneumoniae | pt_BR |
Subject in Portuguese | Sorotipos | pt_BR |
Subject in Portuguese | ST | pt_BR |
Subject in Portuguese | Surtos | pt_BR |
Title | Epidemiologia molecular de Streptococcus pneumoniae sorotipos 1 e 5 isolados de doença invasiva em Moçambique | pt_BR |
Type | Dissertation | pt_BR |
Defense date | 2012 | |
Departament | Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz | pt_BR |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz | pt_BR |
Place of Defense | Salvador | pt_BR |
Program | Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa | pt_BR |
Co-Advisor | Pedreira, Joice Neves Reis | |
Co-Advisor | Sigauque, Betuel Lázaro | |
Abstract | Streptococcus pneumoniae is the leading cause of morbidity and mortality
worldwide. In Mozambique, serotypes 1 and 5 are the most prevalent. This study
investigated the clonal relationship of isolates obtained from pneumococcal
invasive disease during the period of 2002-2007 using three laboratory
procedures: Box-PCR, PFGE and MLST. A total of 105 isolates (72 serotype 1
and 33 serotype 5) were submited to Box-PCR technique. The serotype 5
showed five patterns, one clonal with 20 isolates and four non-clonal patterns.
The pattern A, covered 61% of all isolates, whereas by PFGE, 100% of the
isolates have been grouped into a single clone (clone A), and by MLST was also
identified only one ST (ST 289). In another hand, serotype 1 had higher clonal
diversity by the three methods; by Box-PCR isolates have been grouped into
three clonal patterns, the pattern B being predominantly (58 isolates), C and N
with two isolates each. A total of 12 strains were non-clonal. Clone B showed 20
sub-types, the most common subtype B1 with 20 identical samples, followed by
B2, B6, B7 with 5 identical samples each. By PFGE, 19 samples confirmed with
the same profile clone (clone B), while 12 samples were non-clonal. By MLST, 6
STs were identified, ST 217 (7 isolates), ST 853 (one isolate) and four new STs,
ST 4125, ST 2909, ST 3779 and ST 4166. ST 217 belongs to Sweden1-27 clone
(ST217), previously identified in outbreaks of meningitis in Africa, while the ST
289 has been identified as a representative clone Colômbia5-19 clone (ST289)
that circulate in Latin America since 1994. The rate of non susceptibility to
penicilin was 3%, and 39% to cotrimoxazol. The highest resistance rate was
found among serotype 1 isolates. This results shows the persistence of two
serotypes responsible for cases of severe invasive pneumococcal disease, as
well as their respective clones in a region of southern Mozambique. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil | pt_BR |
Subject | S. pneumoniae | pt_BR |
Subject | Serotypes | pt_BR |
Subject | ST | pt_BR |
Subject | Outbreak | pt_BR |