Advisor | Roque, André Luiz Rodrigues | |
Author | Berbigier, Alice Pereira | |
Access date | 2020-10-06T14:24:10Z | |
Available date | 2020-10-06T14:24:10Z | |
Document date | 2020 | |
Citation | BERBIGIER, Alice Pereira. Diversidade de tripanosomatídeos em pequenos mamíferos provenientes da Estação Biológica FIOCRUZ da Mata Atlântica, Rio de Janeiro. 2020. 83 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2020. | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43828 | |
Abstract in Portuguese | Tripanosomatídeos compreendem uma diversidade de protozoários parasitas que podem ser encontrados em diversas espécies de hospedeiros, incluindo os pequenos mamíferos (roedores, marsupiais e morcegos) que possuem papéis importantes nos ciclos de manutenção e transmissão desses parasitas. O diagnóstico molecular da infecção diretamente em tecidos dos seus hospedeiros podem resultar na detecção de espécies de tripanosomatídeos não detectadas em outras técnicas, como culturas, exame a fresco, ou sorologia. O objetivo deste estudo foi diagnosticar molecularmente a infecção e identificar a diversidade de tripanosomatídeos presentes em tecidos de pele, baço e fígado de pequenos mamíferos silvestres provenientes da Estação Biológica Fiocruz Mata Atlântica (EFMA), Rio de Janeiro/RJ, considerada uma área de proteção ambiental com diferentes níveis de degradação. Amostras biológicas de pequenos mamíferos capturados na EFMA foram submetidas anteriormente a outros exames diagnósticos: exames a fresco de sangue, culturas de sangue e tecidos, PCR em tecidos direcionado a infecção por Leishmania sp. e sorologia (RIFI), esta última apenas em amostras de roedores e marsupiais. As amostras de tecidos desses pequenos mamíferos foram submetidas à extração de DNA, seguida de uma reação em cadeia da polimerase (PCRnested) utilizando o marcador 18S rDNA Os produtos amplificados foram sequenciados e analisados por meio de inferência filogenética por máxima verossimilhança. O teste estatístico Qui-quadrado foi aplicado para avaliar a relação entre áreas de coletas com a taxa de infecção dos tripanosomatídeos detectados. Das 422 amostras de tecidos analisadas, 33 (7,8% = 26 indivíduos) foram positivas no diagnóstico molecular. Destas, 22 foram posicionadas filogeneticamente dentro do clado Trypanosoma cruzi: T. cruzi TcI (n=9), Trypanosoma dionisii (n=7), Trypanosoma rangeli A (n=1), Trypanosoma sp. Neobat 1 (n=3) e Trypanosoma sp. Neobat 4 (n=2). As 11 amostras não caracterizadas no nível de espécie foram classificadas como Trypanosomatidae. Dos 26 indivíduos positivos, 15 também haviam sido positivos nos outros testes diagnósticos, no qual o diagnóstico molecular diretamente em tecidos complementou e confirmou os resultados destas outras técnicas. Estes 26 hospedeiros positivos estavam distribuídos por todas as três áreas de captura da EFMA (peridomicílio (n=10), transição (n=10) e mata (n=6)). A análise estatística mostrou que não houve relação entre os diferentes níveis de degradação das áreas de captura com a distribuição dos tripanosomatídeos. A diversidade de tripanosomatídeos encontrada (5 diferentes espécies/genótipos) pode ser considerada elevada, visto que as áreas de coletas são relativamente pequenas, a diversidade faunística não é grande e o nível de influência antrópica é elevado. O diagnóstico molecular diretamente em tecidos se mostrou eficiente, pois além de diagnosticar a infecção por tripanosomatídeos em hospedeiros considerados previamente negativos, também diagnosticou parasitas que até o momento só podem ser detectados por meio do diagnóstico molecular, como os genótipos de Trypanosoma sp. Neobat 1 e 4. | pt_BR |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | Trypanosomatina | pt_BR |
Subject in Portuguese | Diagnóstico | pt_BR |
Subject in Portuguese | Roedoresparasitologia | pt_BR |
Subject in Portuguese | Marsupiaisparasitologia | pt_BR |
Subject in Portuguese | Quirópterosparasitologia | pt_BR |
Title | Diversidade de tripanosomatídeos em pequenos mamíferos provenientes da Estação Biológica FIOCRUZ da Mata Atlântica, Rio de Janeiro | pt_BR |
Type | Dissertation | |
Defense date | 2020 | |
Departament | Instituto Oswaldo Cruz | pt_BR |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | pt_BR |
Place of Defense | Rio de Janeiro | pt_BR |
Program | Programa de Pós-Graduação em Biologia Parasitária | pt_BR |
Abstract | Trypanosomatids comprises a parasite diverse group that can infect several host species, including small mammals. Rodents, marsupials and bats may present important roles in the maintenance and transmission cycle of trypanosomatids. The infection\2019s molecular diagnosis directly from host tissues can result in detection of species not diagnosed in others techniques, such as cultures, fresh blood exam, or serology. The aim of this study was to diagnose the infection and identify by molecular diagnosis the trypanosomatid diversity in wild small mammals\2019 skin, spleen and liver tissues. These small mammals are from the Estação Biológica Fiocruz Mata Atlântica (EFMA), Rio de Janeiro/RJ, an environmental protected area with different levels of disturbance. These small mammals were previously subjected to other diagnostic tests: fresh blood exam, blood and tissue cultures, tissue PCR for Leishmania sp. infection and serological test (RIFI), the latter being only used in rodent and marsupial. Tissue samples from these small mammals were subjected to DNA extraction, followed by a polymerase chain reaction (nested-PCR) using the 18S rDNA target. The amplified products were sequenced and analyzed using phylogenetic inference by maximum likelihood. The Chisquare statistical test was applied to evaluate the relation between small mammals capture areas with the trypanosomatid infection rates Of 422 tissue samples analyzed, 33 (7.8% = 26 individuals) were positive in the molecular diagnosis. Of these, 22 were phylogenetically within the Trypanosoma cruzi clade: T. cruzi TcI (n = 9), Trypanosoma dionisii (n = 7), Trypanosoma rangeli A (n = 1), Trypanosoma sp. Neobat 1 (n = 3) and Trypanosoma sp. Neobat 4 (n = 2). Eleven samples not characterized at the species level were classified as Trypanosomatidae. Of the 26 positive individuals, 15 were also positive in other diagnostic tests and the molecular diagnosis complemented and confirmed these previous results. The 26 infected hosts were distributed across the three EFMA capture areas (peridomicile (n = 10), transition (n = 10) and forest (n = 6)). Statistical analysis showed that there was no difference in the infection distribution among the three areas with different degradation levels. The detected Trypanosomatid diversity (five different species/genotypes) can be considered high, since the capture areas are relatively small, the fauna diversity is poor, and the anthropic influence level is high. Molecular diagnosis directly in tissues proved to be an efficient method, because in addition to diagnose trypanosomatid infection in previously hosts considered negative, it also diagnosed parasites that until now were only detected through this technique, such as the genotypes of Trypanosoma sp. Neobat 1 and 4. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
DeCS | Trypanosomatina | pt_BR |
DeCS | Diagnóstico | pt_BR |
DeCS | Roedoresparasitologia | pt_BR |
DeCS | Marsupiaisparasitologia | pt_BR |
DeCS | Quirópterosparasitologia | pt_BR |