Advisor | Paula, Vanessa Salete de | |
Author | Lopes, Amanda de Oliveira | |
Access date | 2021-10-13T19:01:01Z | |
Available date | 2021-10-13T19:01:01Z | |
Document date | 2021 | |
Citation | LOPES, Amanda de Oliveira. Epidemiologia e diversidade genética do Gammaherpesvírus humano 8 no Brasil e no mundo. 2021. 129 f. Tese (Doutorado em Biologia Parasitária) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2021. | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/49367 | |
Abstract in Portuguese | O Gammaherpesvírus humano 8 (HHV-8) está associado a várias neoplasias que podem ocorrer em indivíduos infectados pelo Vírus da imunodeficiência humana (HIV), como mulheres grávidas coinfectadas com HIV/HHV-8. Essas gestantes apresentam alto risco de desenvolvimento de neoplasias associadas, como sarcoma de Kaposi (SK), além de aumento da carga viral e transmissão vertical desses vírus. O HHV-8 consiste em seis clados principais (A-F) com base na sequência genética da fase de leitura aberta (ORF) K1. Esses clados exibem claro agrupamento entre indivíduos de diferentes grupos étnicos e de diferentes regiões geográficas. No entanto, existem relatos conflitantes sobre a distribuição global dos diferentes genótipos do HHV-8, incluindo as informações sobre os genótipos do HHV-8 que circulam atualmente no Brasil, país com população humana que varia muito na etnia. Os objetivos deste estudo foram (i) estimar a prevalência da infecção causada por HHV-8 em gestantes portadoras de HIV no Rio de Janeiro, Brasil; (ii) caracterizar isolados de HHV-8 de pacientes com HIV/SK residindo no Brasil baseado na análise filogenética da região codificadora da ORF K1 e (iii) analisar as origens putativas desses isolados; e (iv) determinar a distribuição mundial dos diferentes genótipos do HHV-8 com base na análise filogenética da região codificadora da ORF K1. Como principais resultados, destacamos: (i) a baixa soroprevalência do HHV-8 em gestantescom HIV residentes no Brasil; (ii) a identificação dos genótipos A, B e C presentes empacientes brasileiros com HIV/SK; (iii) a identificação das origens putativas desses isolados: os isolados de HHV8/A parecem estar associados a vírus detectados da Ucrânia, Rússia e do grupo étnico tártaro; os isolados de HHV-8/B parecem estar associados a vírus detectados do Congo e da República Democrática do Congo; e os isolados de HHV-8/C parecem estar associados a vírus detectados da Austrália, Argélia, Inglaterra e Guiana Francesa; (iv) a descrição da distribuição global dos genótipos HHV-8, no qual os genótipos A e C estão presentes em todos os continentes, mas são altamenteprevalentes na Europa e na África; o genótipo B é mais prevalente na África, mas também foi identificado na América Central e do Sul e na Europa; o genótipo D é raroe foi relatado no Leste Asiático e na Oceania; o genótipo incomum E foi identificado em populações ameríndias na América do Sul; e o genótipo F também é raro, mas foiidentificado na África, América e Europa; e (v) a identificação do Brasil sendo o país com maior diversidade de genótipos de HHV-8 do mundo, apresentando cinco genótipos (A, B, C, E e F). Esses resultados fornecem novas informações sobre a epidemiologia e a diversidade do HHV-8 no Brasil e no mundo, fornecendo uma base para futuros estudos epidemiológicos e evolutivos do HHV-8. | pt_BR |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | Gammaherpesvirinae | pt_BR |
Subject in Portuguese | Epidemiologia | pt_BR |
Subject in Portuguese | Variação Genética | pt_BR |
Title | Epidemiologia e diversidade genética do Gammaherpesvírus humano 8 no Brasil e no mundo | pt_BR |
Type | Thesis | pt_BR |
Defense date | 2021 | |
Departament | Instituto Oswaldo Cruz | pt_BR |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | pt_BR |
Place of Defense | Rio de Janeiro | pt_BR |
Program | Programa de Pós-Graduação em Biologia Parasitária | pt_BR |
Abstract | Human gammaherpesvirus 8 (HHV-8) is associated with several neoplasias that may occur in individuals infected with Human immunodeficiency virus (HIV), such as pregnant women coinfected with HIV/HHV-8. These pregnant women are at high risk of development of neoplasias, such as Kaposi\2019s sarcoma (KS), increased viral load, and vertical transmission of these viruses. HHV-8 consists of six major clades (A-F) based on genetic sequence of open reading frame (ORF) K1. These clades exhibit clear clustering among individuals in different ethnic groups and from different geographic regions. However, there are few conflicting reports regarding the global distribution of the different HHV-8 genotypes, including the information about the HHV-8 genotypes currently circulating in Brazil, country with human population that varies greatly in ethnicity. The objectives of this study were (i) to estimate the prevalence of infection caused by HHV-8 in pregnant women with HIV in Rio de Janeiro, Brazil; (ii) to characterize HHV-8 isolates from HIV/KS patients residing in Brazil based on phylogenetic analysis of ORF K1 coding region and (iii) to analyze the putative origins of these isolates; and (iv) to determine the worldwide distribution of different HHV-8 genotypes based on the phylogenetic analysis of ORF K1 coding region. As main results, we highlight (i) the low seroprevalence of HHV- 8 in pregnant women with HIV living in Brazil; (ii) the identification of genotypes A, B and C present in Brazilian patients with HIV/SK; (iii) the identification of putative originsof these isolates: HHV-8/A isolates appear to be from Ukraine, Russia and the Tartar ethnic group; the HHV-8/B isolates appear to be from Congo and the Democratic Republic of Congo; and the HHV-8/C isolates appear to be from Australia, Algeria, England and French Guiana; (iv) the description of global distribution of HHV-8 genotypes, which genotypes A and C are present on all continents, but highly prevalent in Europe and Africa; genotype B is more prevalent in Africa, but has also been identified in Central and South America and Europe; genotype D is rare and hasbeen reported in East Asia and Oceania; the unusual genotype E has been identified in Amerindian populations in South America; and the F genotype is also rare, but has been identified in Africa, America and Europe; (v) the identification of country with thegreatest genotypic diversity in the world founded in the Brazil, presenting five HHV-8 genotypes (A, B, C, E and F). These results provide new information on the epidemiology and diversity of HHV-8 in Brazil and in the world, providing a basis for future epidemiological and evolutionary studies of HHV-8. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
DeCS | Gammaherpesvirinae | pt_BR |
DeCS | Epidemiologia | pt_BR |
DeCS | Variação Genética | pt_BR |