Author | Ludwig, Adriana | |
Author | Schemberger, Michelle Orane | |
Author | Gazolla, Camilla Borges | |
Author | Gama, Joana de Moura | |
Author | Duarte, Iraine | |
Author | Lopes, Ana Luisa Kalb | |
Author | Mathias, Carolina | |
Author | Petters‑Vandresen, Desirrê Alexia Lourenço | |
Author | Zattera, Michelle Louise | |
Author | Bruschi, Daniel Pacheco | |
Access date | 2022-02-21T18:36:04Z | |
Available date | 2022-02-21T18:36:04Z | |
Document date | 2021 | |
Citation | LUDWIG, Adriana et al. Transposable elements expression in Rhinella marina (cane toad) specimens submitted to immune and stress challenge. Genetica, n. 149, p. 335–342, 2021. | pt_BR |
ISSN | 1573-6857 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/51346 | |
Language | por | pt_BR |
Publisher | Springer | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | RNA-Seq | pt_BR |
Subject in Portuguese | Retrotransposons | pt_BR |
Subject in Portuguese | Rhinella marina | pt_BR |
Title | Transposable elements expression in Rhinella marina (cane toad) specimens submitted to immune and stress challenge | pt_BR |
Type | Article | pt_BR |
Abstract | Transposable elements (TEs) are important components of eukaryotic genomes and compose around 30% of the genome of Rhinella marina, an invasive toad species. Considering the possible role of TEs in the adaptation of populations, we have analyzed the expression of TEs in publicly available spleen tissue transcriptomic data generated for this species after immune and stress challenge. By analyzing the transcriptome assembly, we detected a high number of TE segments. Moreover, some distinct TE families were diferentially expressed in some conditions. Our result shows that several TEs are capable of being transcribed in R. marina and they could help to generate a rapid response of specimens to the environment. Also, we can suggest that these TEs could be activated in the germinative cells as well producing variability to be selected and shaped by the evolutionary processes behind the success of this invasive species. Thus, the TEs are important targets for investigation in the context of R. marina adaptation. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Estadual de Ponta Grossa. Departamento de Fitotecnia e Fitossanidade. Laboratório de Biotecnologia Aplicada a Fruticultura. Ponta Grossa, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde. Curitiba, PR, Brasil. / Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Programa de Pós-Graduação em Genética. Curitiba, PR, Brasil. / Universidade Federal do Paraná. Departamento de Genética. Laboratório de Citogenética Evolutiva e Conservação Animal, Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
Subject | Transcriptome | pt_BR |
Subject | Retroelements | pt_BR |
Subject | Adaptation | pt_BR |
Subject in Spanish | Transcriptoma | pt_BR |
Subject in Spanish | Adaptación | pt_BR |
Subject in French | Transcriptome | pt_BR |
Subject in French | Rétroéléments | pt_BR |
DeCS | Transcriptoma | pt_BR |
DeCS | Retroelementos | pt_BR |
DeCS | Adaptação | pt_BR |
e-ISSN | 1573-6857 | |