| Author | Graf, Tiago | |
| Author | Bello, Gonzalo | |
| Author | Naveca, Felipe Gomes | |
| Author | Gomes, Marcelo | |
| Author | Cardoso, Vanessa Leiko Oikawa | |
| Author | Silva, Alexandre Freitas da | |
| Author | Dezordi, Filipe Zimmer | |
| Author | Santos, Mirleide Cordeiro dos | |
| Author | Santos, Katia Correa de Oliveira | |
| Author | Batista, Érika Lopes Rocha | |
| Author | Magalhães, Alessandro Leonardo Álvares | |
| Author | Vinhal, Fernando | |
| Author | Miyajima, Fábio | |
| Author | Faoro, Helisson | |
| Author | Khouri, Ricardo | |
| Author | Wallau, Gabriel Luz | |
| Author | Delatorre, Edson | |
| Author | Siqueira, Marilda Mendonça | |
| Author | Resende, Paola Cristina | |
| Access date | 2022-05-02T16:17:12Z | |
| Available date | 2022-05-02T16:17:12Z | |
| Document date | 2022 | |
| Citation | GRAF, Tiago et al. Phylogenetic-based inference reveals distinct transmission dynamics of SARS-CoV-2 lineages Gamma and P.2 in Brazil. iScience, v. 25 n. 104156 , p. 1–16, 2022. | pt_BR |
| ISSN | 2589-0042 | pt_BR |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/52502 | |
| Description | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ | |
| Language | por | pt_BR |
| Publisher | Cell Press | pt_BR |
| Rights | open access | |
| Subject in Portuguese | SARS-CoV-2 | pt_BR |
| Subject in Portuguese | COVID-19 | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Linhagem P.2 | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Linhagem Gamma | pt_BR |
| Title | Phylogenetic-based inference reveals distinct transmission dynamics of SARS-CoV-2 lineages Gamma and P.2 in Brazil | pt_BR |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1016/ j.isci.2022.104156 | |
| Abstract | The COVID-19 epidemic in Brazil experienced two major lineage replacements until mid-2021. The first was driven by lineage P.2, in late 2020, and the second by lineage Gamma, in early 2021. To understand how these SARS-CoV-2 lineages spread in Brazil, we analyzed 11,724 genomes collected throughout the country
between September 2020 and April 2021. Our findings indicate that lineage P.2 probably emerged in July 2020 in the Rio de Janeiro state and Gamma in November 2020 in the Amazonas state. Both states were the main hubs of viral disseminations to other Brazilian locations. We estimate that Gamma was 1.56– 3.06 times more transmissible than P.2 in Rio de Janeiro and that the median effective reproductive number (Re) of Gamma varied according to the geographic context (Re = 1.59–3.55). In summary, our findings support that lineage Gamma was more transmissible and spread faster than P.2 in Brazil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Grupo de Métodos Analíticos em Vigilância Epidemiológica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Belém, PA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Instituto Adolfo Lutz. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Secretaria Municipal de Saúde de Aparecida de Goiânia. Aparecida de Goiânia, GO, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Secretaria Municipal de Saúde de Aparecida de Goiânia. Aparecida de Goiânia, GO, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Lab HLAGYN. Goiânia. GO, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Eusébio, CE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal do Espírito Santo. Centro de Ciencias Exatas, Naturais e da Saude. Departamento de Biologia. Alegre, ES, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
| Subject | Lineage P.2 | pt_BR |
| Subject | Lineage Gamma | pt_BR |
| Subject | Disease Transmission, Infectious | pt_BR |
| Subject | Pandemics | pt_BR |
| Subject | Communicable Period | pt_BR |
| Subject in Spanish | Transmisión de Enfermedad Infecciosa | pt_BR |
| Subject in Spanish | Pandemias | pt_BR |
| Subject in Spanish | Periodo de Transmisión | pt_BR |
| Subject in French | Transmission de maladie infectieuse | pt_BR |
| Subject in French | Pandémies | pt_BR |
| Subject in French | Période de Transmission | pt_BR |
| DeCS | Transmissão de Doença Infecciosa | pt_BR |
| DeCS | Pandemias | pt_BR |
| DeCS | Período de Transmissibilidade | pt_BR |
