Advisor | Pereira, Mirian Claudia de Souza | |
Advisor | Lechuga, Guilherme Curty | |
Author | Orlando, Lorraine Martins Rocha | |
Access date | 2022-06-15T23:46:05Z | |
Available date | 2022-06-15T23:46:05Z | |
Document date | 2021 | |
Citation | ORLANDO, Lorraine Martins Rocha. Otimização e atividade biológica de derivados de pirazol sobre Trypanosoma cruzi: análise computacional, ensaios de reversibilidade e modelo de cultivo 3D como potenciais ferramentas preditivas de eficácia. 2021. 96 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) - Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2021. | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/53295 | |
Abstract in Portuguese | A doença de Chagas é uma doença negligenciada que acomete 6-7 milhões de indivíduos no mundo, com a estimativa de 1,2 a 4 milhões de indivíduos infectados no Brasil. Esta doença centenária causa elevada morbidade e mortalidade, alcançando 10.000 mortes ao ano no mundo. Os fármacos utilizados na clínica, benzonidazol (BZ) e nifurtimox, possuem importantes limitações incluindo eficácia parcial na fase aguda (60-80%) e baixa eficiência na fase crônica, efeitos adversos graves, contraindicação para gestantes e portadores de insuficiência renal e hepática e ainda, como constatado para o BZ, incapaz de prevenir a cardiomiopatia chagásica e eliminar amastigotas dormentes na fase crônica da doença. Assim, a descoberta de novos fármacos efetivos e seguros é essencial para o manejo desta doença silenciosa. Neste estudo, cinco séries de derivados de pirazol, pirazol-carboxamida (séries 1(a-l) e 2(a-l)) e pirazol-imidazolina (3(a-n), 4(a-c) e 5(a-c)) foram elaboradas com base no composto hit, que possui cruzipaína como alvo, visando otimizar a atividade contra Trypanosoma cruzi. As análises in sílico de propriedades físico-químicas, utilizando o programa Datawarrior e SwissADME, revelaram um perfil de boa biodisponibilidade oral e ausência de promiscuidade dos derivados de pirazol, sem violação da regra de Lipinski e sem alerta de PAINS. Os derivados de pirazol não apresentaram citotoxicidade, alcançando valores de CC50> 160 μM. Ensaios de triagem fenotípica foram realizados contra formas tripomastigotas e amastigotas intracelulares de T. cruzi (clone Dm28c-luciferase) a fim de avaliar a atividade tripanocida dos derivados de pirazol in vitro. Os resultados revelaram que, em geral, os derivados de pirazol sintetizados possuem baixa atividade contra tripomastigotas (IC50>34 μM), mas três análogos de pirazol-imidazolina (3g, 3j e 3m) apresentaram atividade contra amastigotas intracelulares similar ao BZ (IC50 = 4,67±0,22), alcançando valores de IC50 entre 2,75 e 6,09 μM e índice de seletividade maior que 40. A análise da relação de estrutura-atividade revelou que a introdução de substituintes, como Cl, Br e metil, na posição meta do anel benzeno acarreta aumento da potência dos compostos, com os derivados 3j (pIC50=5,56) e 3m (pIC50=5,45) apresentando maior potência que o Bz (pIC50=5,33). Além disso, a posição orto do anel benzeno parece ser um domínio subótimo para substituições. Ainda, o efeito reversível da infecção foi avaliado para os análogos 3g, 3j e 3m. Nesta abordagem, os compostos foram removidos após 72h de tratamento das culturas de células VERO infectadas e o perfil de infecção avaliado por luminescência nas 72h subsequentes. Todos os derivados induziram redução significativa na carga parasitária, mas somente o composto 3m teve eficácia similar ao BZ (100 μM), sem recrudescência do parasitismo na concentração de 2 vezes o valor de IC90 (50 μM). A atividade dos derivados 3g, 3j e 3m também foi avaliada no modelo 3D de células VERO, mimetizando a organização tridimensional e fisiologia dos tecidos. Todos os análogos avaliados acarretaram redução significativa na carga parasitária, destacando-se o análogo 3m, que apresentou efeito similar ao BZ, com evidente redução do parasitismo no microtecido. A predição das propriedades ADMET demonstra que os compostos promissores apresentam boa absorção, são inibidores de CYP1A2 e substrato de CYP3A4 e glicoproteína P, não são mutagênicos ou carcinogênicos, mas apresentam hepatotoxicidade e inibição de hERG, sugerindo a possibilidade de alteração na condução elétrica do miocárdio. Por fim, as análises de atividade de enzimática, utilizando substrato fluorogênico, demonstraram que os análogos 3g, 3j e 3m não são potentes inibidores de cisteína protease, com valor máximo de 45% de inibição desta enzima. Em conjunto, os dados reforçam o potencial tripanocida do híbrido pirazol-imidazolina, cujas mudanças estruturais beneficiaram a atividade contra amastigotas intracelulares em modelos 2D e 3D, sugestivo de boa permeabilidade e absorção pelos tecidos e ainda, demonstraram atividade tripanocida sustentável, sem reativação da infecção in vitro. Novas propostas de otimização serão elaboradas a fim de potencializar a atividade tripanocida e avançar para ensaios pré-clínicos in vivo, contribuindo para a identificação de compostos com potencial de prosseguir em ensaios clínicos para terapia da doença de Chagas | pt_BR |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | Trypanosoma cruzi | pt_BR |
Subject in Portuguese | Pirazol | pt_BR |
Subject in Portuguese | 3D | pt_BR |
Title | Otimização e atividade biológica de derivados de pirazol sobre Trypanosoma cruzi: análise computacional, ensaios de reversibilidade e modelo de cultivo 3D como potenciais ferramentas preditivas de eficácia | pt_BR |
Type | Dissertation | |
Defense date | 2021 | |
Departament | Instituto Oswaldo Cruz | pt_BR |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | pt_BR |
Degree level | Mestrado Acadêmico | pt_BR |
Place of Defense | Rio de Janeiro | pt_BR |
Program | Programa de Pós-Graduação em Biologia Parasitária | pt_BR |
Abstract | Chagas disease is a neglected disease that affects 6-7 million individuals worldwide, with an estimated 1.2 to 4 million infected individuals in Brazil. This century-old disease causes high morbidity and mortality, reaching 10,000 deaths per year worldwide. The drugs used in the clinic, benznidazole (BZ) and nifurtimox, have important limitations including partial efficacy in the acute phase (60-80%) and low efficiency in the chronic phase, serious adverse effects, contraindication for pregnant women and patients with renal and liver failure and yet, as observed for BZ, unable to prevent Chagas cardiomyopathy and eliminate dormant amastigotes in the chronic phase of the disease. Thus, the discovery of new effective and safe drugs is essential for the management of this silent disease. In this study, five series of pyrazole, pyrazole-carboxamide (series 1(a-l) and 2(a-l)) and pyrazole-imidazoline (3(a-n), 4(a-c) and 5(a-c)) derivatives were elaborated based on the hit compound, which has cruzipain as a target, aiming to optimize the activity against Trypanosoma cruzi. In silico analyzes of physicochemical properties, using the Datawarrior and SwissADME software, revealed a profile of good oral bioavailability and absence of promiscuity of pyrazole derivatives, without violating Lipinski's rule and without PAINS alert. Pyrazol derivatives did not show cytotoxicity, reaching values of CC50 > 160 μM. Phenotypic screening assays were performed against trypomastigote and intracellular amastigote forms of T. cruzi (Dm28c-luciferase clone) to evaluate the trypanocidal activity of pyrazole derivatives in vitro. The results revealed that, in general, the synthesized pyrazole derivatives have low activity against trypomastigotes (IC50 > 34 μM), but three pyrazol-imidazoline analogues (3g, 3j and 3m) showed activity against intracellular amastigotes similar to BZ (IC50 = 4.67±0.22), reaching IC50 values between 2.75 and 6.09 μM and selectivity index greater than 40. The analysis of the structure-activity relationship revealed that the introduction of substituents, such as Cl, Br and methyl, in the meta position of the benzene ring increases the potency of the compounds, with the derivatives 3j (pIC50=5.56) and 3m (pIC50=5.45) showing greater potency than BZ (pIC50=5.33). Furthermore, the ortho position of the benzene ring appears to be a suboptimal domain for substitutions. Furthermore, the reversible effect of the infection was evaluated for analogues 3g, 3j and 3m. In this approach, compounds were removed after 72h of treatment from infected VERO cell cultures and the infection profile assessed by luminescence in the subsequent 72h. All derivatives induced significant reduction in parasite load, but only compound 3m had similar efficacy to BZ (100 μM), without recrudescence of parasitism at a concentration of 2-fold the IC90 value (50 μM). The activity of 3g, 3j and 3m derivatives was also evaluated in the 3D model of VERO cells, mimicking the three-dimensional organization and physiology of tissues. All the analogues evaluated caused a significant reduction in the parasite load, highlighting the 3m analogue, which showed a similar effect to BZ, with an evident reduction in parasitism in the microtissue. The prediction of ADMET properties demonstrates that the promising compounds have good absorption, are inhibitors of CYP1A2 and substrate of CYP3A4 and P-glycoprotein, are not mutagenic or carcinogenic, but present hepatotoxicity and hERG inhibition, suggesting the possibility of alteration in electrical conduction of the myocardium. Finally, the enzymatic activity analysis, using a fluorogenic substrate, demonstrated that the analogues 3g, 3j and 3m are not potent cysteine protease inhibitors, with a maximum value of 45% inhibition of this enzyme. Together, the data reinforce the trypanocidal potential of the pyrazol-imidazoline hybrid, whose structural changes benefited the activity against intracellular amastigotes in 2D and 3D models, suggestive of good tissue permeability and absorption, and demonstrated sustainable trypanocidal activity, without reactivation of the parasitism in vitro. New optimization proposals will be developed to enhance the trypanocidal activity and advance to pre-clinical in vivo trials, contributing to the identification of compounds with potential to continue in clinical trials for the therapy of Chagas disease | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Member of the board | Alves, Carlos Roberto | |
Member of the board | Kalabrese, Kátia | |
Member of the board | Bourguignon, Saulo Cabral | |
Member of the board | Barrias, Emilie | |
Member of the board | Salomão, Kelly | |
DeCS | Trypanosoma cruzi | pt_BR |
DeCS | Pirazóis | pt_BR |
DeCS | Pesquisa Comparativa da Efetividade | pt_BR |