Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/54943
Tipo
DisertaciónDerechos de autor
Acceso restringido
Fecha del embargo
2023-06-18
Colecciones
Metadatos
Mostrar el registro completo del ítem
DESENVOLVIMENTO E AVALIAÇÃO DA TÉCNICA DE AMPLIFICAÇÃO MEDIADA POR CIRCUITO ISOTÉRMICO (RT LAMP-PCR) PARA O DIAGNÓSTICO MOLECULAR DO MAYARO VÍRUS
Técnicas de Amplificação de Ácido Nucleico
RNA Viral
Técnicas de Diagnóstico Molecular
DNA Polimerase Dirigida por RNA
Silva, Caroline Targino Alves da. | Fecha del documento:
2021
Miembros de la junta
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil
Resumen en portugues
O vírus Mayaro (MAYV), agente etiológico da febre Mayaro, uma doença febril aguda clinicamente semelhante à febre Chikungunya, tem ocasionado pequenos surtos no Brasil. A incidência crescente em regiões não endêmicas é uma preocupação para a saúde pública, pois indica que o MAYV está se espalhando, podendo ocorrer futuras epidemias. Muitos casos de MAYV foram primeiramente diagnosticados como outros arbovírus, especialmente como CHIKV, devido à similaridade entre os sintomas e ocorrência de reatividade cruzada, o que pode levar à subnotificação da doença. Assim, o estabelecimento de métodos de diagnóstico mais específicos são de extrema importância para o controle dessa doença. Atualmente, o diagnóstico molecular de MAYV é realizado através da técnica de RT-PCR. Entretanto, o custo elevado, a necessidade de mão de obra especializada e de equipamentos sofisticados, limita a capacidade de diagnóstico em laboratórios com infraestrutura limitada. Neste trabalho, foi desenvolvida uma plataforma de transcriptase reversa seguida de amplificação isotérmica mediada por loop (RT-LAMP-PCR) para a detecção de MAYV em amostras humanas e de mosquitos. Os primers específicos para detecção de MAYV foram desenhados e sintetizados, e a técnica para detecção de MAYV foi padronizada. Os melhores resultados de amplificação foram obtidos a 70°C por 30 min de incubação. As concentrações ótimas de Mg2+, enzima Bst 3.0 e dNTPs foram 6 mM, 0,12 U/µL e 1,8 mM, respectivamente. Também foi observado que a reação não necessita de todos os primers para o desempenho, funcionando sem os primers do loop. O teste mostrou-se específico para detecção de MAYV quando testado frente a outros arbovírus e foi capaz de detectar o vírus em amostras humanas de soro, urina, saliva e em mosquitos experimentalmente infectados. Além disso, o teste foi até 1.000 vezes mais sensível e 29 vezes mais barato que a RT-qPCR para detecção de MAYV em amostras de soro.
Resumen en ingles
Mayaro virus (MAYV), the etiological agent of Mayaro fever, an acute febrile illness clinically similar to Chikungunya fever, has caused small outbreaks in Brazil. The increasing incidence in non-endemic regions is a public health concern, as it indicates that MAYV is spreading and that future epidemics may occur. Many cases of MAYV were first diagnosed as other arboviruses, especially as CHIKV due to the high similarity between symptoms and the occurrence of cross-reactivity, which can lead to sub-notification of the disease. Considering that, the establishment of more specific diagnostic methods is extremely important for disease control. Currently, the molecular diagnosis of MAYV is performed using the RT-PCR. However, the high cost, the need for specialized labor and sophisticated equipment limits the diagnostic capacity in laboratories with limited infrastructure and in developing countries, such as Brazil. In this project, a reverse transcriptase followed by loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP-PCR) platform was developed for MAYV detection in human and mosquito samples. The specific primers for MAYV were designed and synthesized, and the technique for the detection of MAYV in humans was optimized. The best amplification results were obtained at 70°C for 30 minutes of incubation, and the optimal concentrations of Mg2+, Bst 3.0 enzyme and dNTPs were 6 mM, 0.12 U/µl and 1.8 mM, respectively. Furthermore, it was observed that the reaction does not require all primers, functioning without loop primers (LF and LB). The test proved to be specific for MAYV detection when tested against other arboviruses and was able to detect the virus in human samples of serum, urine, saliva, and experimentally infected mosquitoes. Furthermore, the assay was up to 1.000 times more sensitive and 29 times cheaper than the RT-qPCR for MAYV detection in serum samples.
DeCS
Infecções por AlphavirusdiagTécnicas de Amplificação de Ácido Nucleico
RNA Viral
Técnicas de Diagnóstico Molecular
DNA Polimerase Dirigida por RNA
Compartir