| Author | Almeida-de-Oliveira, Natália Ketrin | |
| Author | Abreu-Fernandes, Rebecca | |
| Author | Lavigne, Aline Rosa | |
| Author | Pina-Costa, Anielle | |
| Author | Perce-da-Silva, Daiana de Souza | |
| Author | Catanho, Marcos | |
| Author | Rossi, Átila Duque | |
| Author | Brasil, Patrícia | |
| Author | Daniel-Ribeiro, Cláudio Tadeu | |
| Author | Ferreira-da-Cruz, Maria de Fátima | |
| Access date | 2023-08-07T17:23:24Z | |
| Available date | 2023-08-07T17:23:24Z | |
| Document date | 2020 | |
| Citation | ALMEIDA-DE-OLIVEIRA, Natália Ketrin et al. Exploration of Plasmodium vivax merozoite surface proteins 1 and 7 genetic diversity in Brazilian Amazon and Rio de Janeiro Atlantic Forest. Infection, Genetics and Evolution, v. 86, p. 1-11, Dec. 2020. | en_US |
| ISSN | 1567-1348 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/59910 | |
| Sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES; https://www.capes.gov.br/) by Doctoral Fellowship that NKAO is recipient; Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq; http://www.cnpq.br/) by Research Productivity Fellowships whom CTDR (310445/2017-5) and MFFC (306025/2018-3) are recipients; “Cientistas do Nosso Estado” from the Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado de Rio de Janeiro (FAPERJ; http://www.faperj.br/), number grant CTDR (E-26/202.921/2018) and MFFC (E-26/203.295/2015) are. This work was also supported by the IOC/FIOCRUZ of Health ministry of Brazil, CPD-MalCenter of reference malaria diagnoses at Oswaldo Cruz Foundation. | en_US |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Elsevier | en_US |
| Previous version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/44911 | en_US |
| Rights | open access | |
| Title | Exploration of Plasmodium vivax merozoite surface proteins 1 and 7 genetic diversity in Brazilian Amazon and Rio de Janeiro Atlantic Forest | en_US |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1016/j.meegid.2020.104592 | |
| Abstract | Plasmodium vivax merozoite surface proteins (PvMSP) 1 and 7 are considered vaccine targets. Genetic diversity knowledge is crucial to assess their potential as immunogens and to provide insights about population structure in different epidemiological contexts. Here, we investigate the variability of pvmsp-1₄₂, pvmsp-7E, and pvmsp-7F genes in 227 samples from the Brazilian Amazon (BA) and Rio de Janeiro Atlantic Forest (AF). pvmsp-1₄₂ has 63 polymorphisms - 57 nonsynonymous - generating a nucleotide diversity of π = 0.009 in AF, and π = 0.018 in BA. In pvmsp-7E, 134 polymorphisms - 103 nonsynonymous - generate the nucleotide diversity of π = 0.027 in AF, and π = 0.042 in BA. The pvmsp-7F has only two SNPs - A610G and A1054T –, with nucleotide diversity of π = 0.0004 in AF, and π = 0.0007 in BA. The haplotype diversity of pvmsp-1₄₂, pvmsp-7E, and pvmsp-7F genes is 0.997, 1.00, and 0.649, respectively. None of the pvmsp-1₄₂ or pvmsp-7E sequences are identical to the Salvador 1 strain's sequence. Conversely, most of pvmsp-7F sequences (94/48%) are identical to Sal-1. We evaluated eight Bcell epitopes in pvmsp-7E, four of them showed higher nucleotide diversity compared to pvmsp-7E's epitopes. Positive selection was detected in pvmsp-1₄₂ pvmsp-7E central region, and pvmsp-7F with Tajima's D. In pvmsp-7E, the significant nucleotide and haplotype diversities with low genetic differentiation, could be indicative of balancing selection. The genetic differentiation of pvmsp-1₄₂ (0.315) and pvmsp-7F (0.354) genes between AF and BA regions is significant, which is not the case for pvmsp-7E (0.193). We conclude that pvmsp-1₄₂ and pvmsp-7E have great genetic diversity even in AF region, an enclosure area with deficient transmission levels of P. vivax zoonotic malaria. In both Brazilian regions, pvmsp-1₁₉, pvmsp-7E, and pvmsp-7F are conserved, most likely due to their roles in parasite survival, and could be considered potential targets for a “blood-stage vaccine”. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Doenças Febris Agudas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Centro Universitário Serra dos Órgãos. Teresópolis, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Faculdade de Medicina de Petrópolis. Laboratório de Imunologia Básica e Aplicada. Petrópolis, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Doenças Febris Agudas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Malária. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Centro de Pesquisa, Diagnóstico e Treinamento em Malária. Laboratório de Referência para a Malária na Extra-Amazônia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Subject | P. vivax | en_US |
| Subject | Pvmsp-1 | en_US |
| Subject | Pvmsp-7E | en_US |
| Subject | Pvmsp-7F | en_US |
| Subject | Genetic diversity | en_US |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 10 Redução das desigualdades | |
