Advisor | Nogueira, Joseli Maria da Rocha | |
Author | Ramos, Tatiane Mendes Varela | |
Access date | 2024-03-01T02:12:10Z | |
Available date | 2024-03-01T02:12:10Z | |
Document date | 2023 | |
Citation | RAMOS, Tatiane Mendes Varela. Isolamento, identificação e avaliação do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos de Leptospira spp. isoladas de águas do Rio Carioca na cidade do Rio de Janeiro. 2023. 87 f. Tese (Doutorado em Saúde Pública e Meio Ambiente) - Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca, Fundação Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, 2023. | en_US |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62862 | |
Abstract in Portuguese | A leptospirose é uma zoonose global causada por espiroquetas do gênero Leptospira. A infecção em humanos geralmente ocorre pelo contato com água e solo, contaminados com a urina de animais infectados. O ambiente é a principal fonte de infecção que precisa ser investigado, levando em consideração os problemas relacionados ao processo de urbanização desordenada, que incluem condições inadequadas de saneamento básico e infraestrutura inadequada das cidades. Neste estudo, nós investigamos a presença de cepas de Leptospira spp. em cinco pontos do Rio Carioca, localizado na região metropolitana da cidade do Rio de Janeiro, o qual tem sofrido o impacto do processo de urbanização. Um total de 5 amostras foram coletadas de diferentes pontos do rio, usando tubos estéreis e foram filtradas em membranas de porosidade 0.45 µm e 0.22 µm, respectivamente. Um volume de 0,5 mL de cada amostra foi inoculado nos meios EMJH e Fletcher semi-sólidos, contendo 5-fluorouracil (100µg/mL). As culturas foram examinadas por microscopia de campo escuro, para evidenciar a morfologia do gênero Leptospira. O teste de aglutinação microscópica (MAT), utilizando um painel de 18 anti-soros de referência foi usado para sorotipagem das cepas isoladas. A detecção dos genes de patogenicidade (flaB e lipL41) e do marcador de gênero (rrs), foi realizada através da técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR). O sequenciamento do gene ppk foi realizado para identificação das espécies. A suscetibilidade à penicilina, cefotaxima, ampicilina, doxiciclina e azitromicina foi testada pela técnica de microdiluição e a Concentração Inibitória Mínima (CIM) foi determinada. Cinco cepas de Leptospira sp. foram obtidas a partir das amostras testadas, correspondendo ao isolamento em 100% dos pontos de coleta O gênero foi confirmado para as cepas CLEP 00366 a 370, através da morfologia observada ao microscópio e pelo sequenciamento do gene rrs, o qual codifica a subunidade 16S do RNA ribossomal. A análise filogenética baseada no gene ppk, recentemente descrito como importante candidato para classificação filogenética, revelou uma correlação das cepas CLEP 00368, 00366 e 00370 com as espécies L. idonii (85,0%), L. noumeaensis (88,0%) e L. bandrabouensis (98,0%) respectivamente. Devido ao percentual de similaridade com espécies já conhecidas ter sido inferior a 98,7%, esse resultado pode indicar que estas cepas pertencem a espécies do gênero Leptospira ainda não descritas. Investigações futuras serão conduzidas para confirmar este resultado. A cepa CLEP 00367 mostrou uma correlação de 99% com a espécie L.bromii, anteriormente realcionada a doença em humanos. A cepa CLEP 00366 apresentou os maiores valores de CIM para todos os antibióticos testados, o que sugere a influência do impacto antropogênico sobre local de coleta, o qual possui considerável número de edificações no seu entorno, o que pode contribuir para o surgimento de cepas resistentes aos antibióticos. A cepa CLEP 00370 foi isolada do ponto mais degradado do Rio Carioca e apresentou os segundos maiores valores de CIM para penicilina, doxiciclina, cefotaxima e ampicilina, colaborando com a hipótese de que a contaminação pela ação humana pode influenciar no perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos. Considerando o impacto da leptospirose no conceito da Saúde Única, nossos resultados confirmam a importância da investigação da presença de Leptospira spp. no ambiente, que representa a maior fonte de contaminação para o homem e os animais. | en_US |
Language | por | pt_BR |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | Taxonomia | pt_BR |
Subject in Portuguese | Suscetibilidade aos Antimicrobianos | pt_BR |
Subject in Portuguese | Ambiente | pt_BR |
Subject in Portuguese | Leptospira spp. | pt_BR |
Title | Isolamento, identificação e avaliação do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos de Leptospira spp. isoladas de águas do Rio Carioca na cidade do Rio de Janeiro | pt_BR |
Alternative title | Isolation, identification and evaluation of the antimicrobial susceptibility profile of Leptospira spp. isolated from Carioca River at Rio de Janeiro City | en_US |
Type | Thesis | |
Defense date | 2023-02-28 | |
Departament | Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca | en_US |
Defense Institution | Fundação Oswaldo Cruz | en_US |
Place of Defense | Rio de Janeiro | en_US |
Program | Programa de Pós-Graduação em Saúde Pública e Meio Ambiente | en_US |
Co-Advisor | Balassiano, Ilana Teruszkin | |
Co-Advisor | Fernandes, Kayo Cesar Bianco | |
Abstract | Leptospirosis is a global zoonotic disease caused by spirochetes of the genus Leptospira. Human infection usually occurs by contact with water and soil contaminated with the urine of chronically infected animals. The environment becomes a infection source that needs to be investigated, considering the issues related to the disordered urbanization process, which includes the inappropriate conditions of the infrastructure of the cities and basic sanitation. These factors may influence the emergence of antimicrobial resistant strains. In this study, we evaluated the presence of Leptospira spp. in five points of the Carioca River, located in the metropolitan region of Rio de Janeiro city, which had an impact of the urbanization process. Five samples were collected at different points of the river, using sterile tubes, and went through 0.45 µm and 0.22 µm pore size membrane filters, respectively. A volume of 0.5mL of each sample was inoculated into both semisolid EMJH and Fletcher mediums containing 5- fluorouracil (100µg/mL). The cultures were examined by dark-field microscopy to evidence Leptospira morphology. Microscopic agglutination test (MAT), using a panel of 18 reference antisera, was applied for serotyping isolated strains. The detection of the pathogenicity (flaB and lipL41) and the genus (rrs) markers was carried out using the polymerase chain reaction (PCR) technique. The ppk gene sequencing was performed to identify the species. Antimicrobial susceptibility for penicillin, cefotaxime, ampicillin, doxycycline, and azithromycin was tested by the microdilution technique and the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) was determined. Five Leptospira sp. strains could be recovered from the water samples tested, corresponding to isolations in 100% of the collection points The presence of the genus was confirmed by cell morphology under microscopy and sequencing of the rrs gene, which encodes the ribosomal RNA16S (CLEP 00366 to 370). The phylogenetic analysis based on ppk gene, recently described as an important candidate for phylogenetic classification, showed a genetic correlation of strains CLEP 00368, 00366 and 00370 close to L. idonii (85,0%), L. noumeaensis (88,0%) e L. bandrabouensis (98,0%) species, respectively. Due to the low percentage (less than 98,7%) of similarity among species previously described, this result may indicate that these strains belong to species of the genus Leptospira not yet described. Further investigations will be necessary to confirm this result. Strain CLEP 00367 strain showed a closer correlation with L. bromii (99%) specie, previously related with disease in humans. CLEP 00366 strain presented higher MIC values to all tested antibiotics, which suggests the influence of anthropogenic impact at the collection point, which has a considerable number of buildings around, that can contribute to the emergence of antibiotic-resistant strains. CLEP 00370 was isolated at the most damaged point at Carioca River and presented the second higher CIM values to penicillin, doxycycline, cefotaxime, and ampicillin antibiotics, corroborating with the hypothesis that the contamination by human action can influence the profile of antimicrobials susceptibility. Considering the impact of leptospirosis on the One Health approach, our results confirm the importance of investigating the presence of Leptospira spp. in the environment, which represents the main source of contamination for man and animals. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Subject | Leptospira spp. | en_US |
Subject | Taxonomy | en_US |
Subject | Environment | en_US |
Subject | Antimicrobial Susceptibility | en_US |
DeCS | Leptospirose | pt_BR |
DeCS | diagnóstico | pt_BR |
DeCS | Classificação | pt_BR |
DeCS | Meio Ambiente | pt_BR |
DeCS | Anti-Infecciosos | pt_BR |
DeCS | Revisão | pt_BR |