Author | Azevedo, Pedro Henrique Rodrigues de Alencar | |
Author | Carvalho, Priscila Goes Camargo de | |
Author | Constant, Larissa Esteves Carvalho | |
Author | Costa, Stephany da Silva | |
Author | Silva, Celimar Sinézia da | |
Author | Rosa, Alice dos Santos | |
Author | Souza, Daniel Dias Coutinho de | |
Author | Tucci, Amanda Resende | |
Author | Ferreira, Vivian Neuza dos Santos | |
Author | Oliveira, Thamara Kelcya Fonseca de | |
Author | Borba, Nathalia Roberto Resende | |
Author | Rodrigues, Carlos Rangel | |
Author | Albuquerque, Magaly Girão | |
Author | Dias, Luiza Rosaria Sousa | |
Author | Costa, Rafael Garrett da | |
Author | Miranda, Milene Dias | |
Author | Silva, Diego Allonso Rodrigues dos Santos da | |
Author | Lima, Camilo Henrique da Silva | |
Author | Muri, Estela Maris Freitas | |
Access date | 2024-10-11T17:45:28Z | |
Available date | 2024-10-11T17:45:28Z | |
Document date | 2024 | |
Citation | AZEVEDO, Pedro Henrique Rodrigues de Alencar et al. Statine-based peptidomimetic compounds as inhibitors for SARS-CoV-2 main protease (SARS-CoV-2 Mpro). Nature, v. 14, n. 8991, p. 1-16, 18 Apr. 2024. | |
ISSN | 0028-0836 | |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66481 | |
Description | Produção científica do Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. | pt_BR |
Sponsorship | This research was funded by the following Brazilian governmental agencies: "Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior" (CAPES) [Grant Numbers 88881.506711/2020-01, 88887.648435/2021-00, 88887.636136/2021-00, 88887.717861/2022-00, 88887.694990/2022-00, 88887.719751/2022-00], "Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico" (CNPq) [Grant Number 312027/2022-2], "Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro" (FAPERJ) [Grant Numbers E-26/201.426/2022, E-26/201.574/2021, E-26/210.068/2021, E-26/205.966/2022, E-26/205.967/2022, SEI-260003/019723/2022] and "Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, FIOTEC (IOC)" [Grant Number IOC-023-FIO-18-2-58]. | |
Language | eng | en_US |
Publisher | Nature Research | |
Rights | open access | |
Title | Statine-based peptidomimetic compounds as inhibitors for SARS-CoV-2 main protease (SARS-CoV-2 Mpro) | en_US |
Type | Article | |
DOI | 10.1038/s41598-024-59442-4 | |
Abstract | COVID-19 is a multisystemic disease caused by the SARS-CoV-2 airborne virus, a member of the Coronaviridae family. It has a positive sense single-stranded RNA genome and encodes two non-structural proteins through viral cysteine-proteases processing. Blocking this step is crucial to control virus replication. In this work, we reported the synthesis of 23 statine-based peptidomimetics to determine their ability to inhibit the main protease (Mpro) activity of SARS-CoV-2. Among the 23 peptidomimetics, 15 compounds effectively inhibited Mpro activity by 50% or more, while three compounds (7d, 8e, and 9g) exhibited maximum inhibition above 70% and IC50 < 1 µM. Compounds 7d, 8e, and 9g inhibited roughly 80% of SARS-CoV-2 replication and proved no cytotoxicity. Molecular docking simulations show putative hydrogen bond and hydrophobic interactions between specific amino acids and these inhibitors. Molecular dynamics simulations further confirmed the stability and persisting interactions in Mpro's subsites, exhibiting favorable free energy binding (ΔGbind) values. These findings suggest the statine-based peptidomimetics as potential therapeutic agents against SARS-CoV-2 by targeting Mpro. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Farmácia. Laboratório de Química Medicinal. Niterói, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Faculdade de Farmácia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Biotecnologia e Bioengenharia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Biotecnologia e Bioengenharia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Biotecnologia e Bioengenharia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Faculdade de Farmácia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências Matemáticas e da Natureza. Instituto de Química. Departamento de Química Orgânica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Farmácia. Laboratório de Química Medicinal. Niterói, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências Matemáticas e da Natureza. Instituto de Química. Departamento de Química Orgânica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Morfologia e Morfogênese Viral. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Biotecnologia e Bioengenharia Estrutural. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Faculdade de Farmácia. Departamento de Biotecnologia Farmacêutica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências Matemáticas e da Natureza. Instituto de Química. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
Affilliation | Universidade Federal Fluminense. Faculdade de Farmácia. Laboratório de Química Medicinal. Niterói, RJ, Brasil. | |
Subject | Drug discovery | en_US |
Subject | Medicinal chemistry | en_US |
Subject | Pharmacology | en_US |
e-ISSN | 1476-4687 | |
xmlui.metadata.dc.subject.ods | 03 Saúde e Bem-Estar | |
xmlui.metadata.dc.subject.ods | 09 Indústria, inovação e infraestrutura | |
xmlui.metadata.dc.subject.ods | 17 Parcerias e meios de implementação | |