| Author | Ribeiro, Jessiane Rodrigues | |
| Author | Roca, Tárcio Peixoto | |
| Author | Cartonilho, Gleense dos Santos | |
| Author | Passos-Silva, Ana Maísa | |
| Author | Moreira, Hillquias Monteiro | |
| Author | Teixeira, Karolaine Santos | |
| Author | Silva, André Luiz Ferreira | |
| Author | Lugtenburg, Celina Aparecida Bertoni | |
| Author | Santos, Alcione Oliveira | |
| Author | Salcedo, Juan Miguel Villalobos | |
| Author | Nascimento, Valdinete Alves | |
| Author | Souza, Victor Costa | |
| Author | Roque, Rosemary Aparecida | |
| Author | Krieger, Marco Aurélio | |
| Author | Naveca, Felipe Gomes | |
| Author | Rampazzo, Rita de Cássia Pontello | |
| Author | Vieira, Deusilene Souza | |
| Access date | 2024-12-11T01:00:55Z | |
| Available date | 2024-12-11T01:00:55Z | |
| Document date | 2024 | |
| Citation | RIBEIRO, Jessiane Rodrigues et al. DENV-2 outbreak associated with cosmopolitan genotype emergence in Western Brazilian Amazon. Bioinformatics and Biology Insights, v. 18, p. 1-8, May 2024. | en_US |
| ISSN | 1177-9322 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/67526 | |
| Sponsorship | The Fundação Rondônia de Amparo ao Desenvolvimento das Ações Científicas e Tecnológicas and the Pesquisa do Estado de Rondônia—FAPERO, as well as the Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental—INCT—EpiAmo they have been important contributors to scientific development in the Amazon region. Collaboration from the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), from whom some authors received financial support (scholarships) during the production of this study, the Instituto de Biologia Molecular do Paraná (IBMP), the Laboratório Central de Saúde Pública de (LACEN/RO), Coordenação de Vigilância em Saúde e Laboratórios de Referência, the Rede de Plataformas Tecnológicas FIOCRUZ RPT09F-FIOCRUZ/RO, Rede Genômica da Fundação Oswaldo; Agência Estadual de Vigilância Sanitária de Rondônia (AGEVISA-RO), and the Secretaria Municipal de Saúde (SEMUSA). | en_US |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | SAGE | en_US |
| Rights | open access | |
| Subject in Portuguese | Dengue | en_US |
| Subject in Portuguese | DENV-2 | en_US |
| Subject in Portuguese | DENV-1 | en_US |
| Subject in Portuguese | Genotipo cosmopolita | en_US |
| Title | DENV-2 outbreak associated with cosmopolitan genotype emergence in Western Brazilian Amazon | en_US |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1177/11779322241251581 | |
| Abstract | Background: Dengue virus (DENV) causes an important disease and directly affects public health, being the arbovirus that presents the highest number of infections and deaths in the Western Brazilian Amazon. This virus is divided into 4 serotypes that have already circulated in the region. Methodology: Molecular characterization of a cohort containing 841 samples collected from febrile patients between 2021 and 2023 was analyzed using a commercial kit to detect the main arboviruses circulating in Brazil: Zika, DENV-1, DENV-2, DENV-3, DENV-4 and, Chikungunya. Subsequently, Sanger sequencing was performed for positive samples. Results: The cohort detected 162 positive samples, 12 for DENV-1 and 150 identified as DENV-2, indicating co-circulation of serotypes. The samples were subjected to sequencing and the analysis of the sequences that obtained good quality revealed that 5 samples belonged to the V genotype of DENV-1 and 46 were characterized as DENV-2 Cosmopolitan genotype—lineage 5. Conclusion: The results allowed us to identify for the first time the Cosmopolitan genotype in Rondônia, Brazilian Western Amazon, and its fast spread dispersion. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil / Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil / Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil / Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil / Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Nacional de Pesquisas na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil / Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
| Subject | Dengue | en_US |
| Subject | DENV-2 | en_US |
| Subject | DENV-1 | en_US |
| Subject | Genotype Cosmopolitan | en_US |
| DeCS | Dengue | en_US |
