Author | Queiroz, Jackson Alves da Silva | |
Author | Roca, Tárcio Peixoto | |
Author | Souza, Rutilene Barbosa | |
Author | Souza, Luiz Fellype Alves de | |
Author | Passos‑Silva, Ana Maísa | |
Author | Silva, André Luiz Ferreira da | |
Author | Silva, Eugênia de Castro e | |
Author | Borzacov, Lourdes Maria Pinheiro | |
Author | Rampazzo, Rita de Cássia Pontello | |
Author | Pereira, Soraya dos Santos | |
Author | Dantas, Thor Oliveira | |
Author | Mazaro, Janaína | |
Author | Villar, Lívia Melo | |
Author | Salcedo, Juan Miguel Villalobos | |
Author | Matta, Daniel Archimedes da | |
Author | Vieira, Deusilene Souza | |
Access date | 2025-01-21T12:42:13Z | |
Available date | 2025-01-21T12:42:13Z | |
Document date | 2023 | |
Citation | QUEIROZ, Jackson Alves da Silva et al. Development of quantitative multiplex RT‑qPCR one step assay for detection of hepatitis delta virus. Scientific Reports, v. 13, n. 12073, p. 1-8, 26 Jul. 2023. | en_US |
ISSN | 2045-2322 | en_US |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/68150 | |
Language | eng | en_US |
Publisher | Nature Research | en_US |
Rights | open access | en_US |
Title | Development of quantitative multiplex RT-qPCR one step assay for detection of hepatitis delta virus | en_US |
Type | Article | en_US |
DOI | 10.1038/s41598-023-37756-z | |
Abstract | Hepatitis Delta is a disease caused by exposure to hepatitis B (HBV) and hepatitis D (HDV) viruses, usually with a more severe clinical outcome when compared to an HBV monoinfection. To date, the real prevalence of HDV infection is underestimated and detection methods are poorly available, especially in more endemic regions. Therefore, a one-step RT-qPCR method for quantification of HDV-RNA was developed. Biological samples were selected between 2017 and 2023 from patients at the Ambulatório Especializado em Hepatites Virais of the Centro de Pesquisa em Medicina Tropical de Rondônia and Serviço de Assistência Especializada and underwent the test developed by this study and a second quantitative RT-qPCR assay. The slope of the initial quantitative assay was − 3.321 with an efficiency of 100.04% and amplification factor equal to 2. Analysis of the repeatability data revealed a Limit of Quantification of 5 copies/reaction and Limit of Detection (95%) of 2.83 copies per reaction. In the diagnostic sensitivity tests, there was an accuracy of 97.37% when compared to the reference test. This assay proved to be highly efficient and reproducible, making it a valuable tool to monitor hepatitis Delta patients and assess the risk of disease progression, as well as the effectiveness of treatment. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós‑Graduação em Medicina Tropical. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Centro de Infectologia Charles Merieux e Laboratório Rodolphe Merieux. Rio Branco, AC, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós‑Graduação em Medicina Tropical. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Centro de Infectologia Charles Merieux e Laboratório Rodolphe Merieux. Rio Branco, AC, Brasil . | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós‑Graduação em Medicina Tropical. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Centro de Pesquisa em Medicina Tropical de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Instituto de Biologia Molecular do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Acre. Rio Branco, AC, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Acre. Rio Branco, AC, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós‑Graduação em Medicina Tropical. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Universidade Federal de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Centro de Infectologia Charles Merieux e Laboratório Rodolphe Merieux. Rio Branco, AC, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil. | en_US |
Subject | Hepatitis Delta | en_US |
Subject | RT-qPCR | en_US |
Subject | HDV-RNA | en_US |
DeCS | Hepatitis D | en_US |
DeCS | Virology | en_US |