| Author | Berber, Gilcele de Campos Martin | |
| Author | Sarges, Kevin Matheus Lima de | |
| Author | Cruz, Thais Campos Dias da | |
| Author | Roma, Eric Henrique | |
| Author | Miyajima, Fábio | |
| Author | Almeida, Jorge Reis | |
| Author | Souza, Cíntia Fernandes de | |
| Author | Silva, Andrea Alice da | |
| Author | Vallinoto, Izaura Maria Vieira Cayres | |
| Author | Vallinoto, Antônio Carlos Rosário | |
| Author | Queiroz, Maria Alice Freitas | |
| Author | Baccin, Tatiana Gasperin | |
| Author | Castro, Andréa Cauduro de | |
| Author | Vieira, Angélica Thomaz | |
| Author | Azevedo, Francisco Kennedy Scoffoni de | |
| Author | Pereira, Alexandre da Costa | |
| Author | Falcão, Luiz Fábio Magno | |
| Author | Quaresma, Juarez Antônio Simões | |
| Author | Kehdy, Fernanda | |
| Author | Santos, Eduardo Tarazona | |
| Author | Siqueira, Marilda Mendonça | |
| Author | Garcia, Cristiana Couto | |
| Author | Santos, Eduardo José Melo dos | |
| Author | Slhessarenko, Renata Dezengrini | |
| Access date | 2025-04-11T12:36:40Z | |
| Available date | 2025-04-11T12:36:40Z | |
| Document date | 2025 | |
| Citation | BERBER, Gilcele de Campos Martin et al. Polymorphisms in HLA genes among Brazilian patients hospitalized with COVID-19: Insights from a multicentric study. Microbial Pathogenesis, p. 1-28, Apr. 2025. | |
| ISSN | 0882-4010 | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69566 | |
| Description | This is a PDF file of an article that has undergone enhancements after acceptance, such as the addition of a cover page and metadata, and formatting for readability, but it is not yet the definitive version of record. This version will undergo additional copyediting, typesetting and review before it is published in its final form, but we are providing this version to give early visibility of the article. Please note that, during the production process, errors may be discovered which could affect the content, and all legal disclaimers that apply to the journal pertain. | en_US |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Elsevier | |
| Later version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69799 | |
| Rights | restricted access | |
| Title | Polymorphisms in HLA genes among Brazilian patients hospitalized with COVID-19: Insights from a multicentric study | en_US |
| Type | Preprint | |
| DOI | 10.1016/j.micpath.2025.107542 | |
| DOI | 10.2139/ssrn.5125028. | |
| Abstract | Immunogenetic factors such as human leucocyte antigen (HLA) alleles, have yielded contrasting associations with protection or increased chances of hospitalization due to COVID-19 worldwide. This case-control study included834 patients with confirmed COVID-19 diagnosis from five Brazilian states: Ceará (n=110), Mato Grosso (n=192), Pará (n=209), Rio de Janeiro (n=211) and Rio Grande do Sul (n=112). Genotyping was performed using the Axiom™ Human Genotyping SARS-CoV-2 array, targeting single nucleotide polymorphisms in HLA class I and II genes, and HLA alleles were imputed for eight loci. Among the 15 preselected candidate alleles, only DQA1*05:01 (p=0.015) in the state of Ceará remained significantly associated with hospitalization. The meta-analysis of the most frequent alleles in all states revealed that HLA-DPA1*01:03 (p=0.0229, OR=0.76, 95% CI=0.60-0.96) and -DPB1*04:01 (p=0.0474, OR=0.78, 95% CI=0.611.00) were associated with protection against hospitalization, whereas HLA-DPA1*02:01 (p=0.0259, OR=1.37, 95% CI=1.04-1.80), -DQA1*05:01 (p=0.0133, OR=1.40, 95% CI=1.07-1.82), and -DRB1*03:01 (p=0.0276, OR: 1.59, 95% CI: 1.05-2.40) were associated with increased risk. HLA evolutionary divergence (HED) scores were significantly higher among the non-hospitalized group for the HLA-A locus, which has been shown to be a protective factor for the most severe forms and consequently hospitalization due to COVID-19. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal de Mato Grosso. Faculdade de Medicina. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Cuiabá, MT, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Mato Grosso. Faculdade de Medicina. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Cuiabá, MT, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Imunologia e Imunogenética em Doenças Infecciosas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Rede de Vigilância Genômica da Fiocruz. Laboratório de Epidemiologia Molecular por Competência Analítica. Eusébio, CE, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal Fluminense. Laboratório Multiusuário de Apoio à Pesquisa em Nefrologia e Ciências Médicas. Niterói, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal Fluminense. Laboratório Multiusuário de Apoio à Pesquisa em Nefrologia e Ciências Médicas. Niterói, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Entéricos e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal Fluminense. Laboratório Multiusuário de Apoio à Pesquisa em Nefrologia e Ciências Médicas. Niterói, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Grupo Hospitalar Conceição. Departamento de Análises Clínicas. Porto Alegre, RS, Brasil. | |
| Affilliation | Grupo Hospitalar Conceição. Departamento de Análises Clínicas. Porto Alegre, RS, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Laboratório de Microbiota e Imunomodulação. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Mato Grosso. Faculdade de Medicina. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Cuiabá, MT, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Hospital das Clínicas. InCor. Laboratório de Genética Molecular e Cardiologia. São Paulo, SP, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade do Estado do Pará. Centro de Ciências Biológicas da Saúde. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade do Estado do Pará. Centro de Ciências Biológicas da Saúde. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hanseníase. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Diversidade Genética Humana. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Entéricos e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Entéricos e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Integrado de Pesquisa em Biomarcadores. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Mato Grosso. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Faculdade de Medicina. Cuiabá, MT, Brasil. | |
| Subject | HLA evolutionary divergence | en_US |
| Subject | SARS-CoV-2 | en_US |
| Subject | Human leukocyte antigen | en_US |
| e-ISSN | 1096-1208 | |
| Embargo date | 2030-12-31 | |
