| Author | Ferraro, Geraldo Argolo | |
| Author | Cunha, Joana Paixão Monteiro | |
| Author | Fernandes, Flora Maria de Campos | |
| Author | Miranda, Aline Cristina Andrade Mota | |
| Author | Alves, Carlos Roberto Brites | |
| Author | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
| Author | Castro Filho, Bernardo Galvão | |
| Author | Morgado, Mariza Gonçalves | |
| Access date | 2013-11-13T16:03:55Z | |
| Available date | 2013-11-13T16:03:55Z | |
| Document date | 2013 | |
| Citation | FERRARO, G. A. et al. Molecular characterization of long terminal repeat sequences from brazilian human immunodeficiency virus type 1 isolates. Aids Research and Human Retroviruses, v. 29, n. 5 p.837-841, 2013. | pt_BR |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/7231 | |
| Language | eng | pt_BR |
| Publisher | Mary Ann Liebert, Inc | pt_BR |
| Rights | open access | |
| Title | Molecular characterization of long terminal repeat sequences from brazilian human immunodeficiency virus type 1 isolates | pt_BR |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1089/aid.2012.0326 | |
| Abstract | HIV-1 provirus activation is under control of the long terminal repeat (LTR)-5¢ viral promoter region, which
presents remarkable genetic variation among HIV-1 subtypes. It is possible that molecular features of the LTR
contribute to the unusual profile of the subtype C epidemic in the Brazilian Southern region. To characterize the
LTR of Brazilian HIV isolates, we analyzed sequences from 21 infected individuals from Porto Alegre and
Salvador cities. Sequences were compared with subtype B and C reference strains from different countries.
Phylogenetic analysis showed that 17 (81%) samples were subtype B and four (19%) were subtype C. Common
patterns of transcription factor binding sites (TFBS) in subtypes B and C sequences were confirmed and other
potential TFBS specific for subtype C were found. Brazilian subtype C sequences contained an additional NF-jB
biding site, as previously described for the majority of subtype C isolates. The high level of LTR polymorphisms
identified in this study might be important for viral fitness. | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório Avançado de Saúde Pública - LASP. Salvador, BA, Brasil / Fundação Bahiana para o Desenvolvimento das Ciências. Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, Bahia, Brasil | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, Bahia, Brazil | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, Bahia, Brazil | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, Bahia, Brazil | pt_BR |
| Affilliation | Universidade Federal da Bahia. Salvador, Bahia, Brazil | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil / Fundação Bahiana para o Desenvolvimento das Ciências. Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, Bahia, Brasil | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil / Fundação Bahiana para o Desenvolvimento das Ciências. Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Salvador, Bahia, Brasil | pt_BR |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laborató rio de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | pt_BR |
| DeCS | Vírus 1 da Imunodeficiência Humana | pt_BR |
| DeCS | Vírus da AIDS | pt_BR |
| DeCS | HIV-1 | pt_BR |
| DeCS | Polimorfismo | pt_BR |
| DeCS | Genetica | pt_BR |
