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- IOC - Artigos de Periódicos [12947]
Metadata
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THE COMPARATIVE GENOMICS AND PHYLOGENOMICS OF LEISHMANIA AMAZONENSIS PARASITE
Author
Tschoeke, Diogo A
Nunes, Gisele L
Jardim, Rodrigo
Lima, Joana
Dumaresq, Aline S. R
Gomes, Monete R
Pereira, Leandro de Mattos
Loureiro, Daniel R
Stoco, Patrícia Hermes
Guedes, Herbert Leonel de Matos
Miranda, Antonio Basilio de
Ruiz, Jeronimo
Pitaluga, André
Silva Jr, Floriano P
Probst, Christian M
Dickens, Nicholas J
Mottram, Jeremy C
Grisard, Edmundo C
Dávila, Alberto M. R.
Nunes, Gisele L
Jardim, Rodrigo
Lima, Joana
Dumaresq, Aline S. R
Gomes, Monete R
Pereira, Leandro de Mattos
Loureiro, Daniel R
Stoco, Patrícia Hermes
Guedes, Herbert Leonel de Matos
Miranda, Antonio Basilio de
Ruiz, Jeronimo
Pitaluga, André
Silva Jr, Floriano P
Probst, Christian M
Dickens, Nicholas J
Mottram, Jeremy C
Grisard, Edmundo C
Dávila, Alberto M. R.
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Protozoologia. Florianópolis, SC, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Inflamação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / University of Glasgow.
University of Glasgow. Institute of Immunity, Infection and Inflammation. College of MVLS. Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology. Glasgow, UK.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz.Laboratório de Biologia Molecular de Parasitas e Vetores. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. 8Laboratório de Bioquímica de Proteínas e Peptídeos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil
University of Glasgow. Institute of Immunity, Infection and Inflammation. College of MVLS. Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology. Glasgow, UK.
University of Glasgow. Institute of Immunity, Infection and Inflammation. College of MVLS. Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology. Glasgow, UK.
Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Protozoologia. Florianópolis, SC, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Protozoologia. Florianópolis, SC, Brazil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Laboratório de Inflamação. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / University of Glasgow.
University of Glasgow. Institute of Immunity, Infection and Inflammation. College of MVLS. Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology. Glasgow, UK.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz.Laboratório de Biologia Molecular de Parasitas e Vetores. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. 8Laboratório de Bioquímica de Proteínas e Peptídeos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil
University of Glasgow. Institute of Immunity, Infection and Inflammation. College of MVLS. Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology. Glasgow, UK.
University of Glasgow. Institute of Immunity, Infection and Inflammation. College of MVLS. Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology. Glasgow, UK.
Universidade Federal de Santa Catarina. Laboratório de Protozoologia. Florianópolis, SC, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Pólo de Biologia Computacional e Sistemas. Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Leishmaniasis is an infectious disease caused by Leishmania species. Leishmania amazonensis is a New World Leishmania species belonging to the Mexicana complex, which is able to cause all types of leishmaniasis infections. The L. amazonensis reference strain MHOM/BR/1973/M2269 was sequenced identifying 8,802 codifying sequences (CDS), most of them of hypothetical function. Comparative analysis using six Leishmania species showed a core set of 7,016 orthologs. L. amazonensis and Leishmania mexicana share the largest number of distinct orthologs, while Leishmania braziliensis presented the largest number of inparalogs. Additionally, phylogenomic analysis confirmed the taxonomic position for L. amazonensis within the “Mexicana complex”, reinforcing understanding of the split of New and Old World Leishmania. Potential non-homologous isofunctional enzymes (NISE) were identified between L. amazonensis and Homo sapiens that could provide new drug targets for development.
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