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MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DNA FINGERPRINT CLUSTERS AND ITS RELATIONSHIP WITH RDRIO GENOTYPE IN BRAZIL
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Affilliation
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Johns Hopkins University. School of Medicine. Baltimore, MD, USA.
University of California. School of Public Health. Division of Infectious Disease and Vaccinology. Berkeley, CA, USA.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. bPrograma de Pós-graduação em Saúde Coletiva. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitória, ES, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Johns Hopkins University. School of Medicine. Baltimore, MD, USA.
University of California. School of Public Health. Division of Infectious Disease and Vaccinology. Berkeley, CA, USA.
Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. bPrograma de Pós-graduação em Saúde Coletiva. Vitória, ES, Brasil.
Abstract
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains designated as RDRio are responsible for a large cluster
of new cases of tuberculosis (TB) in Rio de Janeiro. They were previously shown to be associated
with severe manifestations of TB. Here, we used three genotyping methods (IS6110 RFLP,
spoligotyping, and multiplex PCR) to characterize RDRio and non-RDRio strains from the
metropolitan area of Vitória, State of Espirito Santo in southeast Brazil to determine strain
diversity and transmission patterns. Strains with identical IS6110 RFLP patterns were considered
to belong to a cluster indicative of recent transmission. Between 2000 and 2010, we identified
5470 new TB patients and genotyped 981 Mtb strains. Of these, 376 (38%) were RDRio. By RFLP,
180 (48%) of 376 RDRio strains and 235 (40%) of 593 non-RDRio strains belonged to RFLP
cluster pattern groups (p = 0.023). Simpson’s diversity index based on RFLP patterns was 0.96 for
RDRio and 0.98 for non-RDRio strains. Thus, although RDRio strains appear to be comprised of a
fewer number of RFLP genotypes, they represent a heterogeneous group. While TB cases caused
by RDRio appear more likely to be due to recent transmission than cases caused by non-RDRio
strains, the difference is small. These observations suggest that factors other than inherent
biological characteristic of RDRio lineages are more important in determining recent transmission,
and that public health measures to interrupt new transmissions need to be emphasized for TB
control in Vitória.
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